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        🔥 大肠杆菌菌液 PCR

        相关实验:🔥 菌液 PCR

        最新修订时间:

        丁香实验推荐阅读

        合作专家 | 吴惠瑕硕士

        遗传学 湖南师范大学

        丁香实验推荐阅读

        审核专家 | 郭雅婕博士

        生物化学分子生物 中国科学院大学

        原理

        将菌体热解释放的 DNA 质粒为模板直接用于 PCR 反应扩增,鉴定目的片段。

        用途

        检验目的片段是否成功插入载体质粒。

        材料与仪器

        菌液

        GoTaq® Green Master Mix(PCR 预混酶溶液、M7122、promega)或其他常规 PCR 试剂盒

        无酶水、无菌枪头

        目的片段扩增引物(或通用引物)

        无菌无核酸酶的离心管

        含固体培养基的平板、液体培养基

        载体对应的抗生素

        步骤

        进行大肠杆菌菌液 PCR 的操作流程如下:

        1、挑菌扩培:在超净工作台中,利用 10 μl 枪头挑取单克隆放入 300 μl 含相应抗性的液体培养基中,在摇床上 37 ℃,220 rpm 培养 3~4 小时即可取菌液进行 PCR;

        2、将 GoTaq® Green Master Mix 从冰箱取出,混匀后瞬离,也可使用其他常规 PCR 试剂盒,按照说明书配制反应体系;

        3、以下以 GoTaq® Green Master Mix 为例,按照下列表格配置 PCR 体系,同时需要设置阴性对照,阴性对照中的菌液换成无酶水。

        10 ul 体系:  
        组分 体积
        GoTaq® Green Master Mix, 2x 5 ul
        上游引物,10 uM 0.5 ul
        下游引物,10 uM 0.5 ul
        菌液 0.2 或 0.5 ul
        无酶水补充至终体积 10 ul

        4、将 PCR 管放入仪器进行 PCR 循环反应。

        🔥 大肠杆菌菌液 PCR

        5、反应结束后,取 PCR 反应产物进行 1%~1.5% 琼脂糖凝胶电泳,在凝胶成像仪下观察并拍照,根据目的条带大小取阳性菌落送测序,测序结果比对目的条带序列以鉴定是否构建成功。

        注意事项

        1、在正式实验前,可以拿确定可行的质粒或者菌液样本进行预实验,探究最适 Tm 值和引物的效果。

        2、进行菌液 PCR 时最好设置一个阴性对照,必要时设置阳性对照组(control),如果实验组没有出现条带或者条带位置不对,可以通过阴性和阳性对照组分析结果形成的原因,不必进行盲目重复实验来寻找原因。

        问题思考方向:PCR 体系配置有问题,PCR 程序设置有问题,上下游引物不匹配或者是基因片段没有连到载体上等等。

        3、菌液量不要过多或过少。PCR 是一个很灵敏的反应,微量的 DNA 模板都可以通过扩增得到目的条带。菌液是一个很复杂的溶液,里面含有培养基及各种细菌代谢产物,这些物质的量过多会影响甚至抑制酶的活力。如果觉得加入 0.2 μl 的菌液量不好吸取,可以将 1 μl 菌液稀释 10 倍后再取 0.5~1 μl 加入 PCR 体系。

        来源:丁香实验

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