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        五、cDNA 序列的分析及蛋白质一级结构的确定

        相关实验:cDNA 法推断蛋白质的一级结构实验

        最新修订时间:

        材料与仪器

        实验材料

        步骤

        1. 首先是对所得 cDNA 进行同源性的比较。通常是在 NCBl 的 GenBank 数据库中来完成,利用 Blast 程序,比较其与已知基因的同源性。


        2. 判断是否为完整的 cDNA 序列:如有无 polyA,有无起始和终止密码寻找开放性阅读框架(ORF,open reading frame)等。


        3. 在上述分析完成后,我们便可以根据已确定的阅读框架将核苷酸序列翻译成氨基酸序列。现在各种工具软件很多,常用的如 DNAsis 及 GoldKey 等。在 GenBank 及 Swissprot 的网站上也可进行类似的工作,它们可以按照 3' 和 5' 两个方向提供六种阅读框架的翻译结果。可从其中根据所确定的框架作常方便的任选其一。

        来源:丁香实验

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