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        随机引物法(利用寡核苷酸延伸法标记DNA放射性)

        相关实验:随机引物法标记 DNA

        最新修订时间:

        原理

        利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿单链模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它们就可在模板的多位点上与模板杂交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互补物将以同样的频率掺入产物。

        材料与仪器

        步骤

        一、材料

        1. 缓冲液和溶液

        醋酸氨(10 mol/L)

        乙醇

        NA 终止/贮存缓冲液(50 mmol/L Tris-Cl (pH 7.5),50 mmol/L NaCl,5 mmol/L EDTA (pH 8.0),0.5% (m/V) SDS)

        5X 随机引物缓冲液(250 mmol/L Tris (pH 8.0),25 mmol/L MgCl2,100 mmol/L NaCl,10 mmol/L 二琉苏糖醇(DTT),1 mol/L HEPES ( 用 4 mol/L NaOH 调至 pH 6.6),1 mol/L DTT 贮存于 -20℃,临用前用水稀释,使用后弃去稀释的 DTT。)

        2. 酶和缓冲液

        大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ Klenow 片段

        3. 凝胶

        碱性琼脂糖凝胶或变性聚丙烯酰胺凝胶

        4. 核酸和寡核苷酸

        含三种未标记的 dNTP 溶液(各 5 mmol/L)

        长度为六或七个碱基的随机脱氧核苷酸引物(125 ng/μl TE,pH 7.6)

        模板 DNA ( 5~25 ng/μl TE,pH 7.6)

        5. 放射性复合物

        [α-32P] dNTP ( 10 mCi/ml,比活性 >3000 Ci/mmol)

        6. 专用设备

        预热至 95℃ 的沸水浴或加热板

        微量离心管(0.5 ml )

        SephadexG-50 离心柱,用 TE ( pH 7.6) 平衡

        二、方法

        1. 在一个 0.5 ml 的微量离心管中加入溶于 30 μl 水的模板 DNA ( 25 ng ) 及 1 μl 随机脱氧核苷酸引物(约 125 ng)。盖紧微量离心管,置于沸水浴中 2 min。

        2. 将微量离心管移至冰上放置 1 min,4℃ 下离心 10s 使引物与模板的混合物沉降至管底,将微量离心管重新置于冰上。

        3. 在引物与模板的混合物中加入:

        5 mmol/L dNTP 溶液       1 μl

        5X 随机引物缓冲液         10 μl 

        10 mCi/ml [α-32P] dNTP  5 μl

        ( 比活性 3000 Ci/mmol)

        水                                   加至 50 μl

        4. 加入 5 单位(约 1 μl)的 Klenow 片段,轻弹管壁以混合各组分。以最大速度离心 1~2s 使所有液体沉降到管底。反应混合物室温下反应 60 min。

        5. 在反应液中加入 10 μl NA 终止/贮存缓冲液,可根据需要进行以下步骤。

        贮存放射性标记的探针于 -20℃ 以备杂交用。



        通过离心柱层析分离放射性标记的探针与未结合的 dNTP 或以乙酸铵和乙醇选择性地沉淀放射性标记的 DNA。如果 >50% 的放射 性 dNTP 已在反应中掺入,可不进行该步骤。

        来源:丁香实验

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