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        用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取法纯化组织和细胞中的 RNA

        相关实验:用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取法纯化组织和细胞中的 RNA

        最新修订时间:

        原理

        在提取过程的第一阶段细胞的 RNA 酶应尽快灭活。一旦内源的 RNA 酶被破坏,RNA 受损的可能就大大降低,而纯化的过程就可以按合适的速度进行。

        材料与仪器

        步骤

        一、材料

        1. 溶液与缓冲液

        氯仿:异戊醇(49:1,V/V)

        乙醇

        异丙醇

        液氮

        苯酚

        磷酸缓冲盐溶液 PBS(仅供悬浮细胞和单层细胞用)

        乙酸钠(2 mol/L,pH 4.0)

        溶液 D(变性液)

        用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取法纯化组织和细胞中的 RNA

        去离子甲酰胺(可选)

        细胞和组织

        2. 离心与转子

        Sorvall SS-34 (或与之相当的转子);Sorvall H1000 (或与之相当的转子)

        3. 专用设备

        测 260 nm 吸光率的比色杯

        组织匀浆器

        用 DEPC 水处理过、预冷的研棒和研钵

        聚丙烯管

        65℃ 水浴

        二、方法

        1. 选取从组织或细胞中提取 RNA 的适宜方法

        (1) 组织

        ① 分离组织并立即置于液氮中。

        ② 将约 100 mg 冰冻组织含液氮的研钵中,用研棒研磨。研磨过程中可加入液氮使组织保持冰冻状态。

        ③ 将组织碎末移入含 3 ml 溶液 D 的管中。

        ④ 用搅拌子室温下搅拌组织 15~30 s。

        (2) 哺乳动物悬浮细胞

        ① 室温下 200~1900 g 离心 5~10 min (1000~3000 r/min 用 Sorvall RT600, H1000 转子)收获细胞。

        ② 吸出培养基将细胞重悬于 1~2 ml 冰预冷的 PBS 中。

        ③ 离心收获细胞,彻底吸尽 PBS, 每 106 细胞加 2 ml 溶液 D。

        ④ 用搅拌子室温下搅拌细胞 15~30 s。

        (3) 哺乳动物单层培养细胞

        ① 吸出培养基用 5~10 ml 冰冷的 PBS 洗细胞一次。

        ② 吸出 PBS 加入溶液 D 覆盖细胞,90 mm 培养皿加 2 ml ( 60 mm 培养皿加 1 ml)。

        ③ 将细胞溶解物移至管中。

        ④ 用搅拌子室温下搅拌溶解细胞 15~30 s。

        2. 将混合物移至一管中,在每毫升溶液 D 中立即加入 0.1 ml 2 mol/L 的醋酸钠 ( pH 4.0),1 ml 酚,0.2 ml 氯仿-异戊醇。加入每种组分后,盖上管盖,倒置混匀。

        3. 将匀浆剧烈振荡 10 s。冰浴 15 min 使核蛋白质复合体彻底裂解。

        4. 10000 g ( 9000 r/min 用 Sorvall SS-34 转子)4℃ 离心 20 min, 将上层含 RNA 的水相移入一新管中。

        5. 加入与提取的 RNA 等量的异丙醇。充分混合液体,并在 -20℃ 沉淀 RNA 1 h 或更长时间。

        6. 10000 g ( 9000 r/min 用 Sorvall SS-34 转子)4℃ 离心 30 min, 收集沉淀的 RNA。

        7. 轻轻倒出异丙醇加入溶液 D 溶解 RNA 颗粒,每 1 ml 第一步所使用的溶液加 0.3 ml 溶液 D。

        8. 将溶液移至一微量离心管,涡旋混匀,并在 -20℃ 用等量异丙醇沉淀 RNA 1 h 或更长时间。

        9. 在微量离心机上,于 4℃ 最大速离心 10 min 收集 RNA 沉淀。用 75% 的乙醇洗涤沉淀 2 次,重复离心。用一次性使用的吸头吸出残存的乙醇。将打开盖的离心管在实验台放置几分钟,以便乙醇蒸发。RNA 不可完全干燥。

        10. 加 50~100 μl DEPC 处理过的水。将 RNA 溶液贮存于 -70℃。

        11. 估计 RNA 的浓度。

        用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取法纯化组织和细胞中的 RNA
        用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取法纯化组织和细胞中的 RNA

        来源:丁香实验

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