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        限制性酶切标记基因组扫描检测基因突变实验

        实验分类:

        其他实验

        最新修订时间:

        简介

        当今,在环境毒素和辐射暴露导致的人类和其他生物突变检测上需要更有效的方法。而环境基因组学研究是以非模式系统生物作为研究对象,这就需要一种不需要知道这些生物的基因组序列信息的方法。限制性酶切标记基因组扫描(restriction landmarkgenome scanning, R L G S ) 是一种对末端标记的DNA片段进行双向电泳( 2 -D E )的分析方法。一种垂直大型2-DE凝胶系统已经得到发展并应用于R L G S 。在小鼠或者人类D N A 的单个R L G S 图谱中,在一向电泳1.0〜5.0 k b , 二 向电泳0.2〜 3 k b 的范围内可以观察到大约2000个 DNA片 段 ( 点) 。理论上,这个系统可检测两类基因组的改变:( 1 ) 得到或者丢失研究中使用的三种限制性内切酶的任一酶切位点,以 及 (2 ) 插人/删除/重排等事件。当样品制备和电泳条件优化后,单 个 DNA 样本的凝胶电泳得到的点的分布图谱可与其他样本比较。这种技术不需任何探针即可检测3000个 D NA片段,因此在监测分布于基因组中DNA片段的I/D /R 事件引起的突变方面相当有效。此方法直接标记DNA片段而非杂交,所以不需了解基因组的准确信息。因此,此方法可适用于任何物种。
        作者:马丁,本实验来自「环境基因组学实验指南」

        来源:丁香实验

        操作方法

        限制性酶切标记基因组扫描检测基因突变实验

        ##一、材料 ###1.封闭:偶发的损伤修复(repair of adventitious damage, RAD) (1) 高分子质量基因组 D N A : 330 ug/mL 溶 于 T E 缓 冲 液(10 m m 〇l/L Tris, I ###2 限制性酶切和同位素标记 ###3 二维电泳 3.1 一 向 电 泳(1st D) 制备凝胶和原位消化所需要的装置如图2所示

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