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        磷酸化位点分析实验-磷酸化位点的确定

        实验分类:

        蛋白质实验

        最新修订时间:

        简介

        来源:《蛋白质组学:从序列到功能》

        来源:丁香实验

        操作方法

        磷酸肽的化学测序

        过去确定磷酸化位点测序最常用的是逐步化学降解法,如丝氨酸和苏氨酸磷酸化分析方法、酪氨酸磷酸化分析方法, 最近,此方法已经主要被质谱方法所取代 。非放射活性和放射活性磷酸肽测序的方法,这两种方法可以补充.在某些情况下可以替代质谱方法来确定磷酸化位点。非放射活性方法是用于检测磷酸丝氨酸和磷酸苏氨胺,包括β-消除,与巯基乙醇反应形成s- 乙基化半胱氨酸或β-甲基-s-乙基半胱氨酸,它们很容易以 PTH

        磷酸肽的质谱分析

        下面讲的 MS 扫描方式,已经成功用于磷酸肽的分析。总之,在不能掺入32p或标记物已经衰变到检测限以下的情况下.产生磷酸盐特异离子(例如一个诊断离子)的方法是很有用的。如果希望的话这种扫描模式也能用于分析放射性标记的磷酸肽,因为由放射性同位素磷酸盐对磷酸肽贡献的质量非常小,可忽略不计。需要注意的是,虽然有人担心质谱仪会被 32p样品污染.但这种可能性可以避免,只要在质谱实验之前等侯足够数量的半衰期

        源后衰变

        这种实验在 MALDI-TOF质谱仪上进行。在 single-stage型仪器中.通过观察亚稳裂解提供肽段序列信息。这一方法已成功用于磷酸肽的序列分析。

        用酶和化学方法去磷酸化

        这种方法得到特别关注、但它能提供磷酸肽中磷酸化氨基酸的定位,可以在非磷酸肽占主导地位的混合物中鉴别磷酸肽,此方法使用的是磷酸酶 。用简单的 MALDI-TOF仪器就可以得到磷酸化蛋白水解后产生肽段的质量,同样的样品用磷酸酶处理后,除去了丝氨酸,苏氨酸和酪氨酸上的磷酸,再分析其质量。任一个减少了 80u 的质量数,都将预示着这一肽段被磷酸化了。MALDI 做这一实验的优点是产生的肽段离子更倾向于单质

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