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文献和实验Cancer Cell I 多组学连用绘制肝内胆管癌多维分子图谱,助推精准治疗的开发
有关,BAP1 及 IDH1/2 突变肿瘤分别出现胆汁酸分泌增加以及 ECM 通路激活等,并且 IDH1/2 突变肿瘤中激活了免疫炎症和 MAPK 通路。 基于蛋白组学为核心手段研究人员将肝内胆管癌进行分子分型,将肿瘤分为炎症型(S1)、间质型(S2)、代谢型(S3)、分化型(S4)四种肿瘤亚型,其分别具有差异化的临床特征、突变分子谱、通路富集以及免疫微环境分布,S1 型多为 CA19-9 表达升高、肿瘤坏死增加,肝内转移,KRAS 突变及中性粒细胞聚集增加;S2 型有较高的淋巴结转移,TP53 基因
Cancer Cell:樊嘉 / 周虎等绘制肝内胆管癌多组学分子特征全景
(S1)、间质(S2)、代谢(S3)、分化(S4)四种亚型,四种亚型具有差异化的临床特征、突变谱、通路富集以及免疫特征分布,且有显著预后差异。 通过降维分析,团队找到了可特异性区分 4 个亚型的标志物,并通过验证证实了其用于临床样本分型的可能性。最终,科研人员确定 HKDC1 和 SLC16A3 是 iCCA 预后相关的生物标志物。 本项研究是在国际癌症蛋白质基因组联盟(International Cancer Proteogenome Consortium,ICPC)及国际临床
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