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- 2025年07月15日
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生物信息学分析
| 生物信息学分析服务： |
| 生物信息学（Bioinformatics）是一门计算机、数学、信息技术与生物学交叉结合的新兴学科。伴随大规模的基因组测序，生物学数据快速增长，我们已不可能单凭手工的方法就可以从海量的数据中发现和解决我们的生物学问题，我们必须借助于数学，计算机等学科的技术，生物信息学应运而生。生物信息技术目前已成为生物学领域的核心技术之一，它与传统方法有机的结合，加速生物学、医学、农学等学科的发展。我们从具体实践经验入手，以为科学研究提供科学服务为宗旨，致力于为全国生命科学领域提供高质量低成本，方便快捷的生物信息学服务，包括高通量生物学数据分析，基因的功能注释和分类，分子进化分析等， |
| 分析结果报告： |
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| 基本分析： |
| 1. 基因组学相关分析 1) 序列拼接，BAC及中小基因组组装。 2) 序列比对，同源性搜索。 3) 多序列全局比对，同源进化树构建。 4) EST的基因组定位，可变剪切形式确定 。 5) Promoters预测与查找，CpG岛，调控元件等。 6) 重复序列注释：SSR,STR,LINE,SINE,Transposons等。 7) 基因预测及基因结构分析：真核，原核，mRNA/cDNA编码区预测。 8) Non-Coding RNA的预测与注释： tRNA预测及二级结构分析 rRNA预测 MiRNA预测及结合靶点预测 soRNA预测及甲基化位点预测 9) SNP分析。 10) 分子进化相关分析：分歧年代，进化树，进化压力（Ka,Ks）。 11) EST序列/一般序列分析 序列基本分析：去除载体，污染，聚类，拼接 表达谱分析：特异表达基因，共调控基因 Unigene的功能注释及分类（见下面基因注释及功能分类） 基于EST的SNP分析 12) 基因的功能注释及分类 NCBI非冗余核酸库（NT） NCBI非冗余蛋白库（NR） SwissProt蛋白数据库 Kegg Pathway数据库 COG/KOG蛋白家族数据库 Interpro&GO蛋白功能位点和结构域（domain）数据库 2. 蛋白质组学相关分析 1) 蛋白质亲/疏水性、等电点、抗原性分析及跨膜蛋白，信号肽等性质分析和相似性分析 2) 蛋白级/三级结构预测 3. Microarray/Biochio生物芯片数据分析 1) 对基因芯片的表达谱数据进行预处理与归一化分析 2) 使用多种统计方法筛选具有显著性差异表达的基因 3) 对差异表达基因数据进行多种聚类分析，并给出树状图 4) 结合基因GO分类(gene ontology)、信号转导数据库（KEGG），进行相关路径分析、差异表达基因的功能分类、所属信号通路分类等 4. 引物/探针设计 1) 核酸引物、PCR引物、测序引物及杂交探针的设计与评价 2) 用于细菌种属分类的杂交探针设计 3) 用于SNP检测的探针设计 4) 芯片的olgio设计 |
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