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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
大量
- 英文名:
Candida tropicalis SYBR qPCR Kit
- 保质期:
一年
- 供应商:
上海钰博生物科技有限公司
- 保存条件:
-20℃保存
- 规格:
50次
Candida tropicalis SYBR qPCR Kit
热带念珠菌(Candida tropicalis)是一种腐物寄生菌,广泛存在于自然界, 可从水果、蔬菜、乳制品、土壤中分离出。也可存在于健康人体的皮肤、阴道、 口腔和消化道等部位。约 10%的健康妇女和 30%的孕妇可无任何临床症状而阴 道内带有念珠菌。当机体抵抗力降低或阴道局部环境发生改变时,热带念珠菌就 大量繁殖,产生病变。所以,热带念珠菌是一种条件致病菌。本公司开发热带念 珠菌染料法荧光定量 PCR 试剂盒,它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供 DNA 模板。
2. 引物根据热带念珠菌专一区设计,特异性高。
3. 荧光定量 PCR 检测,比常规 PCR 更加灵敏。
4. 一管式闭管操作,降低了交叉污染。
5. 本试剂盒足够 50 次 20μL 反应体系的荧光定量 PCR。
6. 本产品只适用于科研,不能用于临床诊断。
| 编号 | 成分 | 规格 |
| 试剂一 | 2×qPCR MagicMix | 500 μL(棕色管) |
| 试剂二 | 荧光 PCR 专用模板稀释液 | 1 mL(黄盖) |
| 试剂三 | 热带念珠菌染料法 qPCR 引物混合液 | 100 μL(白盖) |
| 试剂四 | 热带念珠菌染料法 qPCR 阳性对照(1×10E8 拷贝/μL) | 50 μL(黄盖) |
| 使用手册 | 1 份 |
运输及保存 低温运输、-20℃保存,有效期一年。
自备试剂 DNA 模板、10×ROX(根据机型决定,具体见使用方法)。
使用方法 一、稀释 PCR 阳性对照(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)
1. 注意:由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万 不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原, 本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供可以直接使用的 DNA 片段作为阳性对 照。
2. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
3. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液(最好用带芯枪头,下同)。
4. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照,充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
5. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得), 充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
6. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照到 5 号管中,充分 震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
7. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品 DNA 的制备
8. 如果有 N 个样品,必须设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照), 一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 上步制备的 PCR 阳性对照的第 4 号(浓度为 1×10E4 拷贝/μL,10μL 相当于 1 万拷贝)或第 5 号(浓度为 1×10E5 拷贝/μL,10μL 相当于 10 万拷贝)再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求 的体积一样,以此作为 PC。另外用水作为 NC。如果每次制备需要 200μL 样品, 则 PC 和 NC 的体积也必须是 200μL。
9. 用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒 DNA 提取试剂盒兼 容。也可以选购本公司的一管式病毒 DNAout 或其升级版柱式病毒 DNAout。本 试剂盒免费赠送 15 次一管式病毒 DNAout,
三、设置 qPCR 反应(20 μL 体系,在样品制备室进行)
10.如果只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个 样品,1 个用于 PCR 阴性对照,6 个用于 PCR 阳性对照。如果做 2-3 次重复,则 反应设置数量相应增加 2 或 3 倍。
11.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕 后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
| 成分 | 样品管 N+2 个 | PCR 阴性 对照管 | PCR阳性对照管(2-7 管) |
| 2×qPCR MagicMix | 10μL | 10 μL | 各 10 μL |
| 热带念珠菌染料法 qPCR引物混合液 | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
| 自备 10×ROX (见注) | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
| N+2 待测样品 cDNA 模板 | 6 μL | - | - |
| 自备超纯水 | - | 6 | - |
| 第 7 步所得 PCR 阳性对照 稀释液(2-7 号) |
- | - | 各 6μL(2 号样到 2 号管,3 号样到 3 号管…) |
12. 盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR(具体 PCR 参数可以根据仪器不同而自行优化)。
| 过程 | 温度 | 时间 |
| 预变性 | 95℃ | 5 min |
PCR 反应 (40 个循环) |
95℃ | 15 sec |
| 60℃ |
1 min,(采集 SYBR 通道的荧光信号) |
|
| 按仪器预设程序进行熔解曲线分析 | ||
四、数据处理
13. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 cDNA浓度的 log 值,再推算出其浓度。
14. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大 于或等于 35。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小 于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 35 则为阴性,如果小于或 等于 30 则为阳性。如果在 30-35 之间,则重复一次。若重复结果 Ct 值小 于35,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性。
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文献和实验,不靠壁,不贴液面。 混匀平均分装的注意事项: 1、第一管吸液前需要先把枪头在液面中浸润一下,以保证三复孔的枪头吸液量是差不多的。 2、用混匀器进行混匀,不要用移液器吹打。 详细说明书 transhold cat. A2010A0112荧光定量PCR Premix试剂盒(荧光染料) (FQ
所特有的,下游引物为通用引物就可以了。 荧光定量PCR检测方法有SYBR Green染料法和TaqMan探针法。前者需要调整引物浓度以及引物扩增效率,把引物二聚体调整到越小越好;探针法则需要设计荧光探针,这其中由于MGB探针需要碱基数量少和特异性好的特点而被推荐。 探针设计位置有3个:完全与miRNA序列相同、在miRNA与RT引物的交叉点、完全在RT引物上;这其中又有正向和反向互补两种情况。至于探针要设计在那个位置,根据自己试验情况而定,本人以为效果都差不多。 四、试验操作流程
PCR产物的荧光值就可以。参比染料的作用是标准化荧光定量反应中的非PCR震荡,校正加样误差或者是孔与孔之间的误差,提供一个稳定的基线。现在很多公司已经把ROXTM配制在MasterMix或者Premixture里。如果反应曲线良好或已经优化好反应体系,也可以不加ROXTM染料校正。通常来讲,real-time qPCR的反应程序不需要像常规的PCR那样,要变性、退火、延伸3步。由于其产物长度在80-150bp 之间,所以只需要变性和退火就可以了。SYBR@Green等染料法,最好在PCR扩增程序结束
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