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文献和实验根据研究目的，研究者需要选择合适的载体。不同的载体对基因组DNA的长度有不同的要求，必须选择合适长度的基因组DNA来构建基因组文库。比如，对于黏粒载体，合适的片段长度大约为40kb；对于BAC载体，合适的片段长度平均为120kb-300kb。构建黏粒基因组DNA文库，需要将基因组DNA用注射器抽打来随机剪切DNA；接着用末端修复酶修复DNA，可以提高DNA连接入载体的效率；然后通过脉冲场电泳或者普通电泳来找到40kb左右的DNA片段，随后使用胶回收试剂盒回收DNA。构建BAC基因组DNA文库，需要
的pIndigoBAC-5、pCC1BACTM)，平均来说，合适的片段长度为120kb-300kb。 构建黏粒基因组DNA文库，研究者需要将基因组DNA用注射器抽打来随机剪切DNA;接着用末端修复酶修复DNA，可以提高DNA连接入载体的效率;然后通过脉冲场电泳或者普通电泳来找到40kb左右的DNA片段，随后使用Epicentre GELase 胶回收试剂盒回收DNA。 构建BAC基因组DNA文库，研究者需要将基因组DNA用限制性内切酶(常用EcoR I、BamH I或者Hind III
片段，随后使用胶回收试剂盒回收DNA。 构建BAC基因组DNA文库，需要将基因组DNA用限制性内切酶(常用EcoR I、BamH I或者Hind III)来消化基因组DNA，然后通过脉冲场电泳找到合适长度的DNA片段(比如100kb-150kb)，随后透析回收DNA。 需要注意： (1)电泳时，要选用合适的DNA Ladder，以保证电泳后可以准确定位所需分子量的DNA。 (2)电泳以后，应尽量缩短用紫外光照射目标DNA的时间，否则会显著降低克隆效率
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