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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
2
- 英文名:
QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library Prep Kit V2
- 保质期:
18个月
- 供应商:
北京仲黎商贸有限公司
- 保存条件:
-20
- 规格:
24-96反应
QuantSeq-Flex RNA-Seq文库构建试剂盒V2 是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行第一链和 或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。
产品优势
- 试剂盒应用灵活,可用千靶向测序;
- >100 多重引物的靶向文库构建;
- 每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量
- 识别已知和未知融合转录本;
- 只需4.5 小时即可完成RNA文库构建;
- 节省测序成本, Dual index兼容多达9,216 种组 (i5/i7组合)。
使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:
1) Oligo(dT)用于第一链合成,随机引物用于第二链合成(Quantseq FWD);
2) Oligo(dT)用第一链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’ mRNA-Seq);
3) 特异性靶向引物用于第一链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);
4) 特异性靶向引物用于第一链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。
Fig.2所示,靶向引物构建的文库。针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf (BRAF, NM_004333.4)、受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2 (ERBB2, NM_001005862.2)和KRAS原癌基因GTPase (KRAS, NM_004985.4)设计了引物,以K562细胞的总RNA为模板,用QuantSeq-Flex试剂盒进行建库。Fig.3 展示以不同RNA起始量(500ng, 100ng和10ng)检测BCR-ABL基因的融合转录本。
Figure 2 | 靶向引物构建的文库。针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf (BRAF,NM_004333.4),受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2 (ERBB2, NM_001005862.2)和KRAS原癌基因,GTPase (KRAS, NM_004985.4)设计了引物,以K562细胞的总RNA为模板用QuantSeq-Flex试剂盒进行建库。
Figure 3 | BCR-ABL融合基因靶向文库的片段分析。
订购信息rg订购eted RNA-Seq Library Prep Kits
订购货号 产品名称 试剂盒规格
033.24 QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library Prep Kit with First Strand Synthesis Module, 24 preps 24
033.96 QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library Prep Kit with First Strand Synthesis Module, 96 preps 96
034.24 QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library Prep Kit with Second Strand Synthesis Module, 24 preps 24
034.96 QuantSeq-FlexTargeted RNA-Seq Library Prep Kit with Second Strand Synthesis Module, 96 preps 96
035.24 QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library Prep Kit with First and Second Strand Synthesis Modules,24 preps 24
035.96 QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library Prep Kit with First and Second Strand Synthesis Modules,96 preps 96
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文献和实验相关实验
化到相似的浓度水平。最后,剩余的 cDNA 分子在 PCR 反应中被扩增以生成可测序的文库(图 2)。 图2 | 使用双链特异性核酸酶 (DSN) 处理酶法去除丰富的序列。 DSN 处理应用广泛,特别是用于注释的测序流程,DSN处理被普遍使用。它可用于从特征较少的物种中获取转录组信息,这些物种无法使用使特定探针进行靶向去除高丰度转录本的方法,以及不具有 poly(A) 尾而无法通过 poly(A) 选择富集 mRNA 的物种(3) . 因此,一些 RNA-Seq 试剂盒及常用的去除方法
input量少;可结合Quantseq 3’mRNA建库试剂盒使用,节省大量的测序空间,大大节约测序成本,使其成为RNA代谢动力学研究的首选,同时,SLAM-seq技术方法学发表在了Nature Methods上。 图3 SLAMseq工作流示意图。培养的细胞用4-硫代尿苷(S4U)标记新生RNA(绿色)。抽提纯化总RNA,并加入碘乙酰胺(IAA)诱导4-巯基烷基化。用QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建试剂盒进行文库构建,在反转录过程中,S4U位点会反转录成鸟嘌呤 (G,红色
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Lexogen QuantSeq-Flex 靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2
¥2880 - 31580










