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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
大量
- 英文名:
miRNA 尿素-PAGE 电泳套装
- 保质期:
一年
- 供应商:
上海泽叶生物科技有限公司
- 保存条件:
4℃
- 规格:
瓶
中文名:miRNA 尿素-PAGE 电泳套装
英文名:
CAS:N/A
级别:N/A
分子量:N/A
分子式:N/A
纯度:N/A
储存条件:4℃
产品简介
注意:过硫铵(APS)为固体粉末,使用前配制成10% APS溶液(0.1 g APS加1mL双蒸水)。APS溶液最好现配现用,通常4℃可保存一周,-20℃能保存半年。
准备工作:
估计所需要的凝胶溶液的体积,一般配制一块 13 cm×15 cm× 0.8 mm 的胶需要 15 mL 凝胶溶液,配制一块 36 cm×45 cm×0.8 mm 的胶需要 120 mL 凝胶溶液。
操作步骤:
1. 取适量的制胶液于三角瓶中,边摇晃溶液边加入TEMED 和10%过硫酸。(建议每100mL的加入量:10% APS 500uL,50-100uL的TEMED)
2. 再充分摇晃约 30 秒后迅速灌胶,然后插入样品梳,室温放置 30-60 分钟等待胶凝固。
3. 将凝胶板放置在电泳装置上后,在上下层分别加入适当量的 1×TBE电泳缓冲液。如果不马上使用,需要有湿纸将上样孔端盖住以防凝胶过度干燥。
4. 拔出梳子后用加样枪吸取电泳缓冲液,充分将每个加样空中未聚合的 Acrylamide/Bis、尿素和气泡吹打出来。
5. 在上样前,预电泳 20-30 分钟以使多余的过硫酸跑出加样空,同时还可 以使凝胶的温度升高(到 50℃左右),有利于 RNA 变性状态。
6. 将 miRNA 样品与等体积的 miRNA上样液混合,70℃保温 2-3 分钟后迅速放置在冰上冷却,快速离心半分钟,放冰上待用。
7. 关电泳仪后开始上样。
8. 重开电泳仪,对 13 cm×15 cm 的胶,以 20-30mA 的电流电泳,直到红 色染料移动到凝胶边缘为止;对 36 cm×45 cm 的胶,则以 50-60mA 的 电流电泳,直到红色染料移动到凝胶边缘为止。
9. 染色观察:将凝胶一面的玻璃板揭开,直接用仍然附着在另一玻璃板上的凝胶进行各种染色,包括银染(固定、漂洗、显影和定影等步骤)、EB(每 100 mL 1×TBE 中加 20 uL 10mg/mL 的 EB 溶液)。UV 下观察并拍照。
10. miRNA 回收:按上法用 EB 等染料染色后,UV 下确定所需要的 miRNA 条带的位置,切胶后进行胶回收处理。
11. Northern 杂交:按上法用 EB 等染料染色后,UV 下确定所需要的 miRNA 条带的位置,切胶后电转移到带正电的尼龙膜上,然后进行杂交处理。
12. 放射自显影:如果 miRNA 样品电泳前经过同位素标记,则将凝胶一面的 玻璃板揭开,用滤纸将附着在另一玻璃板上的凝胶吸附过来,然后包上保 鲜膜,真空抽干,然后使胶跟 X 光片向对置进行放射自显影。
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文献和实验可以采取现在比较常用的TRIzol一步法。不要使用带柱子的RNA提取试剂盒,因为除了专门用于提取miRNA的试剂以外,绝大部分柱子无法捕获20nt左右的miRNA。 2、电泳 (1)配制15%的尿素变性PAGE胶,可以先用预冷的0.5XTBE缓冲液作为电泳缓冲液,60V预跑30min。 (2)将样品与RNA loading buffer按比例混合,70℃预热5min,立即放置冰上。 (3)上样前,用缓冲液冲洗点样孔,防止点样孔中的杂质影响电泳。 (4)点样时,使样品均匀铺在点样孔底部
data on the web, providing data previously accessible from the miRNA Registry. Old miRNA Registry addresses should redirect you to this page. * The miRBase Sequence Database is a searchable database of published miRNA sequences and annotation
或northern时,你必须验证分析只检测目的miRNA,而不是其它成员。我们在玉米(Zea)RNA载体背景中加入合成的成熟miRNA(IDT)来验证。 就northern来说,每个miRNA家族成员的合成miRNA在含有8M尿素的15% PAGE胶上进行。优化杂交温度,让LNA探针只与目的miRNA结合,而不与其它成员结合。一旦利用加标策略建立了适当的northern杂交条件,就能应用于实验样品。 3. 原位杂交:我们也利用Exiqon的DIG标记的miRCURY LNA
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