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上海实维实验仪器技术有限公司
美国 Illumina NextSeq 500 / 550 高通量桌上型基因测序系统
产品简介:NextSeq 500系统集高通量测序的性能和台式测序仪的简约为一体,是目前*一款可实现外显子组、转录组和全基因组测序的台式测序仪。它可在两种模式下开展测序实验:高产量(High Output)和中等产量(Medium Output),在单次运行中可获得20-120 Gb的数据,为您带来广泛的应用灵活性。
与MiSeq一样,NextSeq 500的整个流程也非常简单。制备好的文库可直接上样到系统。整合的簇生成实现了单分子的自动化克隆扩增。产生的DNA簇在NextSeq 500系统上测序,利用Illumina边合成边测序(SBS)技术及的可逆终止子原理。凭借成熟的SBS技术,NextSeq 500系统带来了行业*的测序准确性,其中75%以上的测序碱基都高于Q30。
NextSeq 500测序系统带来了高通量测序的通量以及台式NGS(新一代测序)系统的快速、简约和经济。这个快速、完整、从样品到结果的流程实现了许多测序应用 – 包括外显子组、全基因组和转录组 – 只需单次运行。这个NGS系统可无缝融入研究实验室,而无需专门的设备。如今,研究人员可开展高和低通量的测序应用组合,以推进他们的研究。
*台高通量的台式测序仪
NextSeq 500测序系统带来了高通量测序的通量以及台式NGS(新一代测序)系统的快速、简约和经济。这个快速、完整、从样品到结果的流程实现了许多测序应用 – 包括外显子组、全基因组和转录组 – 只需单次运行。这个NGS系统可无缝融入研究实验室,而无需专门的设备。如今,研究人员可开展高和低通量的测序应用组合,以推进他们的研究。
NextSeq 550桌上型测序仪
在Nextseq 500 的基础上, Nextseq 550实现了进行新一代测序(NGS),同时又能扫描细胞遗传学芯片。
灵活扩展的NGS系统,适合所有应用
有了NextSeq 500系统,研究人员可在一个平台上开展多个测序应用。NextSeq 500系统是*一台能够在单次运行中以高覆盖度(30倍)对人类全基因组测序的NGS系统。它也为多个流行的测序应用带来了*的周转时间。研究人员只需按一下按钮,就能在两种配置间转换,在需要时开展较低通量的测序应用或处理较小的样品批量。
全基因组测序
NextSeq 500系统凭借行业*的Illumina测序技术,带来了*的覆盖度,可鉴定整个基因组中的变异。通过一键式的测序和极少的手工操作,NextSeq全基因组测序解决方案让研究人员可高效地分析任何基因组,从微生物到人类。
外显子组测序
NextSeq 500系统提供了一种*简单、*可靠的外显子组测序方法,以鉴定真正的编码变异,*测序*困难的基因组区域。Illumina的外显子组测序方案包括完整的文库制备和外显子组富集、一键式测序和简单的数据分析。通过极少的手工操作,研究人员可更准确、更高效地拷问更多外显子组。
转录组测序
RNA测序让研究人员能够更深入地了解基因表达,并用于鉴定转录本亚型、新的转录本和基因融合。NextSeq RNA测序解决方案凭借行业*的Illumina技术,带来了整个转录组的详细快照。这种解决方案让研究人员能够定制他们的研究,从基因表达到复杂的全转录组图谱分析。
快速轻松的流程
为缩短设置时间而设计,NextSeq 500系统特有上样即运行的流程和直观的用户界面。用户只需上样流动槽和试剂夹盒,然后按下按钮,即可测序。无需额外的设备,NextSeq 500系统将簇生成、边合成边测序和和碱基检出整合在单台NGS系统中。在运行过程中,研究人员可通过仪器或在任何位置监控运行表现。为了简化运行管理、下游分析和数据共享,NextSeq 500系统提供了连接到BaseSpace的选项,这是Illumina的基因组学计算环境,有云端和现场软件包可供选择。
一个完全集成的测序生态系统
NextSeq 500测序系统设有一个特殊的用户界面和上样即运行的流程。NextSeq 500系统将簇生成和测序整合在单台仪器中,实时地产生碱基检出和质量指标。测序是自动且快速的,可在1天内产生数据。数据自动转移到BaseSpace环境中,进行简化的分析、存储和共享。
成熟的Illumina技术
Illumina的边合成边测序(SBS)原理是世界上**且广泛采用的NGS技术。NextSeq 500系统与Illumina所有的NGS系统一样,采用成熟的可逆终止子SBS技术,并融合近期在缩短循环和数据处理时间上的创新。这种技术实现了大规模并行测序,并带来了行业*的测序准确性。
成熟的动力
NextSeq 500测序系统利用Illumina边合成边测序(SBS)原理的*进展 – 这一成熟、高度准确的可逆终止子技术被Illumina所有测序平台所使用。
简化的信息学
有了Illumina的信息学解决方案,研究人员无需生物信息学*知识,也能从样品到发表。NextSeq 500系统的软件旨在*限度地减少设置时间和用户错误的风险,让研究人员能够在任何时候从任何地方查看实时数据和性能指标。可选的BaseSpace解决方案有云端和现场环境可供选择,为准备运行、跟踪样品以及存储、分析和共享基因组数据提供了一种轻松而经济的方式。
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文献和实验对SNapShot法进行阐述。SNapShot法是一种新兴的SNP检测技术,该技术有美国应用生物公司(ABI)开发的,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,其原理是先根据基因序列,设计特异性的扩增引物及延伸引物,在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧邻多态位点5’端的不同长度的延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经过测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知渗入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。SNapShot法操作简单、经济
方面,常规分析使用的单个图像切片(图 1,左,2D 分析)或使用投影图像(图 1,中,2.5D 分析)。这两种技术均会从 3D 样品中丢失诸如空间、形态和体积信息等大量数据(图 1)。 图 1 (从左到右):2D、2.5D 和 3D 分析示意图。 在本应用指南中,我们介绍如何使用活/死微球测定法通过 NoviSight 软件定量分析 3D 样品。 方法 样品制备 我们在 PrimeSurface96U 孔板(Sumitomo Bakelite)中培养 500 HT-29 细胞/孔八天以形成微球
达到这一目标,然由于仪器产出通量及测序准确性证明他们并不具备这个能力。但在今年1月13号第32届摩根大通保健大会上,这一口号似乎要成为了现实。 在大会上,世界测序仪器制造巨头Illumina总裁兼CEO Jay Flatley宣布:Illumina将推出两款新的测序平台:HiSeq X Ten和NextSeq 500。HiSeq X Ten是一台工厂规模的测序仪,适合群体测序;而NextSeq 500是一台新的台式高通量测序仪,大小与MiSeq相当,性能却与HiSeq相当。新测序仪能准确地测出
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