载玻片/0.8mm

FFPE样本空间转录组实验流程，你想要的细节都在这里了

10x Visium空间转录组测序针对FFPE样本的实验已经开展有一段时间了，今天小编就来总结一下整个实验的详细流程。   首先来一张实验流程导图：   10xVisium FFPE的实验流程   FFPE样本Visium空间转录组技术流程（图片引自10x官方） 一、取材 FFPE样本取材要求组织不要大于6.5mm*6.5mm，因为10x visum的每张切片的捕获区域只能容纳6.5*6.5的组织大小，≤6.5 x 6.5 mm的组织块可与Visium

Visium空间基因表达解决方案-冰冻切片制备指南

切片面积的大小：因为芯片捕获区域的面积为6.5mm X 6.5mm，所以我们要控制切割区域在这个面积以内； 2，冰冻切片的厚度：冰冻切片的厚度一般设置在10μm，但是根据不同的组织类型，切片厚度也会有所调整。例如脂肪含量较高的乳腺组织可能需要更厚的切片； 3，冰冻切片质量：由于不同的组织样本中脂质、蛋白质含量有所差异，冷冻组织的硬度和延展性并不相同，因此切片的环境温度也有所要求。温度过低，会导致组织块过硬，切片出现碎裂、薄厚不均或孔洞；而温度过高，导致组织变软，硬度不够，切片无法成形或者出现褶皱。   冰冻

新型光机结合的二维共焦生物芯片扫描仪设计

扫描仪中，都采用机械式的二维X，Y线性扫描技术实现，即X，Y方向都采用直线驱动器和直线导轨实现往复运动。此类装置，由于驱动系统的频率限制，驱动器的扫描惯性大，使得扫描效率低，分析时间相当长；并且往复行程长，对直线导轨的精度要求相当高。二、光机结合的二维扫描系统为同样实现生物芯片的二维扫描，我们的实验装置设计如图2，采用了振镜和大数值孔径的远心f-è物镜相结合实现X方向扫描，Y方向的运动仍采用直线驱动器和直线导轨实现。 系统中，对于f-è物镜，满足x＝2fè（è为振镜的摆动角度，f为物镜焦距）的线性