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武汉康测科技有限公司
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MeRIP测序 | 核酸-蛋白互作研究
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核酸-蛋白互作研究系列产品:ChIP测序、 RIP测序、 CLIP测序、 MeRIP测序
简介
m6A甲基化修饰在基因表达调控、mRNA剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色。
甲基化RNA免疫共沉淀结合高通量测序(Methylated RNA Immunoprecipitation with Next Generation Sequencing,MeRIP-Seq)是研究细胞内转录组表观修饰的新技术。这项技术通过使用N6-甲基腺嘌呤抗体富集高甲基化的RNA片段,然后结合高通量测序,在全转录组范围内研究发生甲基化的RNA区域,从而比较不同细胞、组织、样本间的RNA甲基化修饰模式的差异,可帮助解决细胞分化、生物发育、疾病发生发展、热休克反应等生物学问题。
康测技术优势
- 对抗体进行严格质检、效价分析,提供文章发表质量的IP报告;
- 对MeRIP实验体系进行精心优化
- 特有的Peak calling技术
- 提供个性化分析报告,可根据客户需要提供关联分析、解析m6A调控机制
分析结果展示

A)reads在基因上的覆盖情况:在peak区域,IP的reads覆盖度高于input(没有使用抗体富集的对照),(横轴为基因位置,左边纵轴为覆盖度);
B)Peak在基因5'UTR、CDS、3'UTR区域的分布;
C)基于差异m6A基因和差异表达的mRNA的联合分析(绿色三角表示显著差异的m6A修饰基因,黄色圆圈表示显著差异表达的基因,橙色五角星表示同时显著差异m6A修饰和显著差异表达的基因);
D)Peak的motif分析。
武汉康测科技有限公司是由加州大学圣地亚哥分校(UCSD)、武汉大学、华中农业大学博士团队创建的高新技术企业。截至2017年底,团队核心成员已在Nature、Cell、Molecular Cell、Nat. Struct. Mol. Biol.、Proc Natl Acad Sci USA、Cell Reports等国际顶刊发表文章十余篇。公司秉承技术创新、服务至上的核心理念,与多所985/211院校、中国科学院的实验室建立了长期合作关系。
公司研发团队于2017年成功开发出绝对定量转录组(KC-DigitalRNA)、免疫组库(KC-IRQuant)、16S rDNA绝对定量、ctDNA检测(KC-SMP)等4项建库技术,并成功申请发明专利和配套数据分析系统的软件著作权。成为中国首.家UID(UMI)绝对定量高通量测序服务平台,为广大科研工作者提供转录组(mRNA、lncRNA)/TCR/BCR/ctDNA/肠道微生物多样性等多种绝对定量测序服务。
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文献和实验比拟的。 能否以有限的成本用一台仪器产生足够数量的序列标记也是另一个需要改善的重要问题。这个问题已经被Roche公司解决了,应用他们的系统,仅花费阅读35bp或者更小片段的成本就能产生比35bp多10倍的序列标记。 一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤,可以非常轻松完成基因组重测序(re-sequence)。但是也应该看到,由于高通量测序读取长度的限制,使其在对未知基因组进行从头测序(novo sequencing)的应用
文献速递:患者福音?宏基因组下一代测序用于尿路感染诊断提高诊断精度
/组织学和临床结果的离散特征。尿沉渣来源的 DNA 测序对 UTUC 具有很高的诊断价值,灵敏度为 82.2%,特异性为 100%。 病原微生物NGS检测是近年来的热点,但是从人体体液样本中提取的核酸十分有限,常规定量方法甚至可能检测不到核酸信号,这给感染源的准确检测带来了巨大挑战。上述两篇研究针对尿液提取核酸信息进行下游测序建库,采用的是QIAamp DNA Micro Kit。QIAamp DNA Micro Kit适用于从拭子和体液中纯化和富集细菌微生物组DNA。在纯化过程中,该试剂盒能高
这样的循环之后,已经获得延伸的 引物会变性脱落,再重新结合上新的引物从头开始新一轮测序,不过这一次可能获得的是第4号碱基、第9号 碱基、第14号碱基以及第19号碱基的信息。我们可以使用不同长度的引物(+1或者-1)或者使用在不同位点 (比如第2号碱基)标记荧光的8bp核酸探针片段达到这个目的。如此反复,最终就能获得整条模板片段的完 整序列信息。 AB SOLiD测序仪还有一个特点就是使用了双碱基编码技术(two-base encoding),该技术具有误差校 正功能,因为它是通过两个











