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Hieff NGS® MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(人/

小鼠/大鼠)
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  • ¥3785
  • 翌圣生物(Yeasen)已认证
  • 12253ES08
  • 上海
  • 2025年10月14日
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      Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

    • 保质期

      有效期1年

    • 供应商

      翌圣生物科技(上海)股份有限公司

    • 保存条件

      干冰运输,-20°C存放。

    • 规格

      8T

    产品信息
    产品名称 产品编号 规格 价格/
    Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
    MaxUp rRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠)
    12253ES24 24 T 11363.00
    12253ES96 96 T 37363.00

    产品描述
    Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)利用RNase H消化法去除人、小鼠、大鼠总RNA中的核糖体RNA以保留信使RNAmRNA)和其它非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA(如FFPE RNA)均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成或其它下游应用。

    适用范围
    适用于人、小鼠、大鼠来源的100 ng~1 μg 总RNA样品;适用于完整或部分降解RNA(如FFPE RNA)样品。

    产品组分
    产品细节图片1
    产品细节图片2

    运输与保存方法
    干冰运输,-20°C存放。

    注意事项
    1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM 高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。
    2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。
    3. RNA样品最大投入体积为11 μL,若样品体积较大,可先进行浓缩。

    自备材料
    1. RNA纯化磁珠:Hieff NGS® Cleaner(Cat#12602)或其他等效产品。
    2. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox) (Cat#11201)或其他等效产品;
    3. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

    操作步骤
    1. 探针杂交
    1.1 将探针和杂交Buffer-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。
    1.2 准备RNA样品根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至11 μL。
    1.3 按照表1200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

    表 1 探针杂交反应体系
    名称 体积(μL
    Hybridization Buffer 3
    Probe Mix(H/M/R) 1
    Total RNA 11100 ng~1 μg
    Total 15
    1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。
    1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

    表 2 探针杂交反应程序
    温度 时间
    热盖105°C On
    95℃ 2 min
    95℃-22℃ 0.1℃/s
    22℃ 5 min
    4℃ hold
     
    2. RNase H消化
    2.1将RNase H消化试剂从-20 °C取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表 3 所示,配制RNase H消化反应体系。

    表3 RNase H消化反应体系
    名称 体积(μL
    RNase H Buffer 3
    RNase H 2
    上步产物 15
    Total 20
    2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。
    2.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:37℃30 min 4℃hold,进行RNase H消化反应。

    3. DNase I 消化
    3.1将DNase I消化试剂从-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表4所示,配制DNase I消化反应体系。

    表4 DNase I消化反应体系
    名称 体积(μL
    DNase I Buffer 27.5
    DNase I 2.5
    上步产物 20
    Total 50
    3.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。
    3.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:37℃30min 4℃hold,进行DNase I消化反应。

    4. RNA纯化
    4.1 准备工作:将 Hieff NGS® RNA Cleaner (Cat#12602)磁珠由冰箱中取出,室温平衡至少 30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。
    4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。
    4.3 吸取 110 μL Hieff NGS® RNA Cleaner(2.2×Beads:DNA=2.2:1)至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min
    4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。
    4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。
    4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。 10 μL移液器吸干净残留液体。
    4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10 min)。
    4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min
    4.9将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL 上清(可根据步骤4.7选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。
    【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。

    案例展示
    qPCR验证: 1μg 293T RNA进行rRNA去除,利用qPCR对比去除前后rRNA基因和mRNA基因的表达量变化。
     
    产品细节图片3

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