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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
充足
- 英文名:
Ribo-off rRNA depletion kit(Plant)
- 供应商:
诺唯赞
- 保存条件:
-30°C~-15°C保存
- 规格:
12 rxns/24 rxns
| 规格: | 12 rxns | 产品价格: | ¥10800.0 |
|---|---|---|---|
| 规格: | 24 rxns | 产品价格: | ¥19680.0 |
Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)
植物去除rRNA试剂盒

植物根、种子和叶片总RNA中去除rRNA;mRNA和非编码RNA分析

兼容性强:能兼容多种植物物种,同时针对植物的不同部位(根、种子和叶片)也具有良好的兼容性。
rRNA残留率低:针对不同物种均能有效去除rRNA

1.低的rRNA残留率

针对不同物种,Vazyme N409均能有效去除rRNA,较大程度减少rRNA的残留导致的数据浪费,且去除效率优于illumina同类产品。
2.优异的数据质量

对下机数据过滤后得到的高质量clean reads,根据参考序列使用HISAT2软件对序列进行比对分析,得到mapping rate。Vazyme N409搭配后续的建库模块的下机数据,在Mapping rate上优于illumina。

Ribo-off rRNA depletion kit (Plant)是针对植物根、种子和叶片总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于模板起始量为1 - 5 μg的植物总RNA,总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步骤,将rRNA(包括5S、18S和25S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA和其它非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;试剂盒额外提供了靶向线粒体rRNA和叶绿体rRNA的消化探针,可以高效去除多种植物种属主要的rRNA,提供信息充实的测序结果。该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本,所得的产物适用于RNA文库及其他实验。



-30°C~-15°C保存
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文献和实验限度地减少不希望的脱靶去除效应。捕获磁珠用于从溶液中去除与核糖体 RNA 杂交的探针。最后的纯化步骤去除所有反应成分并回收剩余的 RNA 用于下游应用(图 3)。 图 3 | 使用杂交/捕获的特定探针去除 rRNA。该工作流程改编自Lexogen 的 RiboCop Depletion Kits。 杂交/捕获方法不依赖于酶促反应,因此这些方法保留完整的全长转录本以供下游应用。它们特别适用于具有挑战性的应用,例如 RiboSeq 4,并最大限度地减少非特异性 RNA 降解。 在 Lexogen
更多的总RNA);ribo Minus kit现在也有几种了,我多是用Invitrogen的。 为了同时给出ribo Minus的对应图片,下面的结果不是来源于培养的细胞系,而是小鼠的肺组织。 RNA来源:小鼠的肺组织;提取方法:Invitrogen Trizol 提取总RNA——miRNeasy kit 分离small RNA和long RNA——从long RNA中提取Ploy A+ RNA——ribo Minus kit去除残余的rRNA。 Poly
,或者用RNase-Free的DNase处理RNA样品。在这里我们介绍一些常用的RNA纯化试剂盒,特别是由Affymetrix公司推荐的QIAGEN RNA纯化系列。* RNeasy Protect Kit:一旦生物样品被收集分离,它的RNA会立刻变得非常不稳定,极易被降解。由于特异及非特异的RNA降解,或者由于应激反应产生新的RNA都会引起RNA状态的改变。对于生物芯片、基因表达矩阵分析(Array Analysis)、定量RT-PCR等实验来说,采样后立即稳定样品里的RNA以保存当时RNA的表达状态,是精确







