Sino Biological 人TMEM258基因ORF cDNA克隆表达质粒 全长 人源哺乳动物表达 质粒表达

读一文掌握LncRNA研究套路

rRNA比例评估 Ø 基本比对统计，链特异数据评估 Ø Cufflink,stringtie转录本组装 2. 特性分析 Ø 序列，位点保守性分析 Ø 外显子个数,表达和长度分析 Ø 定量差异分析 3. 新LncRNA鉴定 Ø 与已知lncRNA库比对过滤 Ø 过滤exon Ø CPC,CNCI,phyloCSF编码潜能预测 Ø ORF长度过滤 Ø miRNA前体序列过滤 4. 功能分析 Ø 顺和反式靶基因预测 Ø 靶基因功能富集分析 Ø

差异基因研究技术及其应用

有偏向性；获得的片段多为300bp左右的3′非编码区，很难判断其功能和意义，只能提供研究线索。哺乳动物的创伤愈合常需要数周至数月时间，伴有瘢痕形成且机制不明，MRL/MPJ（MRL）鼠具有无瘢痕愈合的能力，Masinde等［8］采用差异显示PCR方法研究了参与MRL/MPJ（MRL）鼠无瘢痕创伤愈合的基因，鉴定了36个与创伤愈合有关的差异表达基因，为无瘢痕创伤愈合的研究提供了靶基因。4 消减杂交法（SH）经典的消减杂交法是将实验组mRNA（或cDNA）与对照组cDNA（或mRNA）杂交，去除杂交体

生物芯片入门（五）：应用

内的核酸序列同源性在98.2%到83.5%之间，提示了二者在进化上的高度相似性。 3．2 基因表达水平的检测 用基因芯片进行的表达水平检测可自动、快速地检测出成千上万个基因的表达情况。Schena等采用拟南芥基因组内共45个基因的cDNA微阵列（其中14个为完全序列，31个为EST），检测该植物的根、叶组织内这些基因的表达水平，用不同颜色的荧光素标记逆转录产物后分别与该微阵列杂交，经激光共聚焦显微扫描，发现该植物根和叶组织中存在26个基因的表达差异，而参与叶绿素合成的CAB1基因在叶组织较根组织表达