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Axiom® Genome-Wide CHB1 & CHB2

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  • 2026年01月28日
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    简介:
    Axiom®中国人基因分型芯片(Axiom® Genome-Wide CHB1 & CHB2 Array)中的所有内容精选自Axiom®基因组数据库,此数据库包含了经过在真实样本上验证的标记,均来自各种公开来源,包括国际HapMap计划、dbSNP数据库和千人基因组计划。
    Axiom® Genome-Wide CHB1 & CHB2 Array包含了Axiom® Genome-Wide CHB1 Array
    Axiom® Genome-Wide CHB2 Array,其中CHB1最大限度覆盖中国汉族人群常见变异(MAF5%),CHB2主要设计稀有变异位点(MAF 2-5%),以作为CHB1的补充。

    SNP实现全基因组覆盖最大化:
    X和Y染色体SNP、线粒体SNP、编码区SNPindels,还包括编码区功能相关SNP和非翻译区(UTR)、毒药物动力学(ADME)和疾病相关SNPSNP相关疾病注释选自Gene Ontology数据库的心血管系统部分、桑格癌症基因普查、PharmaADME6号染色体主要组织相容性复合体(MHC)、美国国家人类基因组研究中心(NHGRIGWAS研究目录。

    芯片特点:
    130万个SNP标记,选自中国汉族人群GWAS研究数据;
    全面验证的SNP标记,达到市场上针对中国汉族人群常见和罕见变异覆盖度最高,且避免冗余;
    着重于与疾病及功能密切相关的SNP,如:心血管疾病、癌症、免疫、炎症、主要组织相容性复合体和中枢神经系统;
    用于关键生物学类别的覆盖,例如:编码区SNP和生物学通路、药物代谢或心血管基因;
    完全自动化,实现高通量;
    Axiom 2.0 Reagent KitGeneTitanMC、自动或自定义的workflowGenotyping Console™均兼容。

    Axiom® Genome-Wide CHB1 & CHB2 Array在不同人群不同MAF覆盖情况:

    产品细节图片1
    千人基因组计划第一阶段(201112月发布)中r20.8SNP的基因组覆盖
    北京的汉族人(CHB)、南方的汉族人(CHS)、日本东京人(JPT

    芯片性能验证:
    为了验证Axiom® Genome-Wide CHB1 & CHB2 Array的性能,Affymetrix测试了来自国际 HapMap计划的190个中国和日本人样本,结果如下:

    产品细节图片2
    affymetrixillumina针对中国人群基因分型的两款经典芯片信息比较:
    产品细节图片3






     

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