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SimGlycan质谱数据分析
可提供试用
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SimGlycan质谱数据分析软件
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SimGlycan软件可以根据质谱仪获得的MS/MS数据分析和预测多糖化合物的结构。它通过比较实验数据和自身的多糖化合物数据库,给出可能的多糖结构,并根据相似程度进行打分,从而帮助研究者确定最可能的多糖化合物结构。 主要功能特点
SimGlycan数据库是一个巨大的关系数据库,包含22,456种多糖、22814种糖肽、11,438种已知生物来源的多糖、11,918种已知分类的多糖、 263种生物化学反应、194种生化通路、250种酶相关多糖和9521个其他数据库链接。随着其他多糖信息的公布,数据库不断更新。
产生注释的图谱
SimGlycan突出符合理论裂解的实验质核比值,产生描述连续单糖单位减少的注释的图谱。这有助于研究者建立支链类型,验证多糖的基本单位。每个峰可 用动画或Domon Costello命名法代表。可产生适合页面大小或基于目标区域的定制化的注释图谱,输出并与他人分享。简单的界面可以放大进入特定图位,指定质核比范围 来显示特定的图谱部分,也可以以图像文件输出到MS PowerPoint。
用户绘制结构
SimGlycan允许用户绘制和编辑多糖和糖肽。单糖、肽链或如HSO3和Etn的取代基可以添加或删除,分支点和端基连接(anomeric linkage)可点击按键来修饰。每步,绘制结构的裂解使用户可以比较实验和理论数据,用户可见该修饰是否使理论上的多糖更接近于实验数据。这一功能对 解析多糖结构有很大帮助,特别是在没有目标多糖数据的情况下。
精确的多糖排序
基于我们专有的研究和评分机制对所有可能的多糖进行排序和打分。排序机制基于对多糖分数的计算,该分数是一个数值,代表多糖的实验属性(组成和分支类型)与数据库中多糖的属性的接近程度。
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