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5′末端同位素标记试剂盒北京供应商

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  • 百奥莱博
  • 北京
  • 2025年07月10日
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      155

    • 英文名

      DNA 5′End-Labeling Kit

    • 保质期

      一年

    • 供应商

      北京百奥莱博科技有限公司

    • 保存条件

      低温运输,-20℃

    • 规格

      20次

    特别提示:包括5′末端同位素标记试剂盒在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!


    产品名称:5′末端同位素标记试剂盒
    英文名称:DNA 5′End-Labeling Kit
    产品货号:BTN131036
    产品规格:20次

    本产品为DNA 5′末端标记系统,利用T4 Polynucleotide Kinase(T4多聚核苷酸激酶)和[γ-32P]ATP 对粘性末端或平末端的DNA或RNA的5′末端进行高效标记反应。原理如下:


    产品特点:
    1. 使用本试剂盒之前,不需要对 5′末端的磷酸基团进行去磷酸化处理,因为使用的kinase 能使5′末端的磷酸与[γ-32P]ATP的γ-磷酸进行交换。
    2. 合成的单链或双寡核苷酸的5′末端游离的OH基团都能通过Kinase反应被标记(或者只是简单的磷酸化)。
    3. 提供的两种反应液使交换反应和磷酸化反应都能高效进行,均能得到大于106 cpm/pmol(5′-end)的比活性。

    试剂盒组份:
    成分 规格
    T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) 20μl
    5×交换反应缓冲液 100μl
    10×磷酸缓冲液 50μl
    Control DNA 20μl
    说明书 1份


    储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。

    使用方法:

    一、交换反应
    1. 实验前需自备的试剂:7 M 醋酸铵、100%乙醇、70%乙醇等
    2.在微量离心管中制备下列反应液:
    成分 加入的体积
    自备的5′磷酸化DNA片段 14μL(≤5 pmoles的5′末端)
    5×交换反应缓冲液 5μL
    [γ-32P]ATP 5μL
    T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) 1μL
    灭菌的超纯水 补足到25μL

    注:5 pmoles的5′末端约等于0.17μg的长100bp的双链DNA。
    3. 37℃反应30分钟。
    4. 70℃加热5~10分钟使酶失活。
    5. 加入10μl的7 M CH3COONH4(pH4.5)。如使用CH3COONa做乙醇沉淀时使其终浓度达300mM。
    6. 加入87.5μl(2.5倍)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
    7.离心回收沉淀,用 70%的冷乙醇清洗沉淀,真空干燥。
    8. 用适当 Buffer 溶解沉淀。
    注:通过第5~8 步操作几乎可以除去大部分未反应的[γ-32P] ATP,如要完全将其除去时,乙醇沉淀后用凝胶过滤等方法精制即可。如需用běn酚抽提除去蛋白质时,请在第8 步之后进行。

    二、磷酸化反应标记

    A. 去磷酸化反应
    1. 实验前需自备的试剂:TE 饱和酚/lǜ仿、3 M NaCl 、100%乙醇、70%乙醇、牛小肠碱性磷酸酶(CIAP)等
    2.在微量离心管中制备下列反应液:
    成分 加入的体积
    自备的DNA片段 133μL(≤10μg)
    1M Tris-HCl,pH8.0 15μL
    牛小肠碱性磷酸酶(CIAP,10~20U/μL) 2μl
    灭菌的超纯水 补足到150μL

    3. 50℃反应30分钟。
    4. 加入150μl的TE 饱和酚/lǜ仿/异戊chún(25:24:1),充分混匀。
    5.离心,取上层(水层)移到另一个微量离心管中。
    6. 重复操作 4~5。
    7. 加入7.5μl的3 M NaCl(最终浓度150mM)。
    8. 加入375μl(2.5倍量)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
    9.离心回收沉淀,用 1mL 70%的冷乙醇清洗后,沉淀真空干燥。
    10. 使用 20μl的TE Buffer 溶解沉淀。

    B. 磷酸化反应(前反应)
    1.在微量离心管中制备下列反应液:
    成分 加入的体积
    自备的DNA片段 20.5μL(≤5 pmoles的5′末端)
    10×磷酸缓冲液 2.5μL
    [γ-32P]ATP 1μL
    T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) 1μL
    灭菌的超纯水 补足到25μL

    2. 37℃反应30分钟。
    3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。

    三、合成DNA 寡核苷酸的标记
    1.在微量离心管中制备下列反应液:
    成分 加入的体积
    Oligonucleotide DNA with free 5′-OH(5~10 pmoles) ≤3μL
    10×磷酸缓冲液 2.5μL
    [γ-32P]ATP 1μL
    T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) 1μL
    灭菌的超纯水 补足到25μL

    2. 37℃反应30分钟。
    3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。

    四、合成DNA 寡核苷酸的标记
    当掺入水平很低的时候,需要使用本步骤,即通过体积排阻色谱或过滤试剂盒除去未反应的标记。Sephadex G-50 层析柱(需另购)对于去除未掺入的dNTPs效果很好,它还能大幅减少小于20个碱基的DNA 寡核苷酸和小于20bp的双链DNA的量。使用之前需要在70℃加热5~10分钟以使T4 多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25 层析柱可以用来纯化长度不小于10个碱基的寡核苷酸。

    注意事项:
    1.缓冲液可在室温融解。融解后立即置于冰中,使用前充分混匀。
    2. 5×交换反应缓冲液于-20℃冻结保存时会有白色浑浊出现,但不影响反应效果。
    3.酶切得到的DNA片段需经乙醇沉淀等方法纯化。
    4. 当用于交换反应的DNA在5 pmoles以上(约1,000bp以上)时,标记效率有时会低于106 cpm/pmol。
    5. 如果交换反应所用 DNA低于500bp时,标记效率有时会有所降低。
    6. 若不进行放射线标记,仅使用本试剂盒做5′末端磷酸化反应时,反应体系中的[γ-32P]ATP可用5μl的10mM ATP 代替。
    7. 磷酸化反应时的[γ-32P]ATP可用[γ-35S]ATP 替代。

    使用举例:
    按照使用方法中交换反应和合成DNA 寡核苷酸的标记的实验操作,取λ-BstP I,λ-Hpa I,λ-EcoT22 I 各3 pmols,用[γ-32 P]ATP 通过正向磷酸化反应或交换反应标记。各DNA片段的放射自显影结果如下所示:


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