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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
155
- 英文名:
DNA 5′End-Labeling Kit
- 保质期:
一年
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
低温运输,-20℃
- 规格:
20次
特别提示:包括5′末端同位素标记试剂盒在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:5′末端同位素标记试剂盒
英文名称:DNA 5′End-Labeling Kit
产品货号:BTN131036
产品规格:20次
本产品为DNA 5′末端标记系统,利用T4 Polynucleotide Kinase(T4多聚核苷酸激酶)和[γ-32P]ATP 对粘性末端或平末端的DNA或RNA的5′末端进行高效标记反应。原理如下:
产品特点:
1. 使用本试剂盒之前,不需要对 5′末端的磷酸基团进行去磷酸化处理,因为使用的kinase 能使5′末端的磷酸与[γ-32P]ATP的γ-磷酸进行交换。
2. 合成的单链或双寡核苷酸的5′末端游离的OH基团都能通过Kinase反应被标记(或者只是简单的磷酸化)。
3. 提供的两种反应液使交换反应和磷酸化反应都能高效进行,均能得到大于106 cpm/pmol(5′-end)的比活性。
试剂盒组份:
| 成分 | 规格 |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 20μl |
| 5×交换反应缓冲液 | 100μl |
| 10×磷酸缓冲液 | 50μl |
| Control DNA | 20μl |
| 说明书 | 1份 |
储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一、交换反应
1. 实验前需自备的试剂:7 M 醋酸铵、100%乙醇、70%乙醇等
2.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
| 自备的5′磷酸化DNA片段 | 14μL(≤5 pmoles的5′末端) |
| 5×交换反应缓冲液 | 5μL |
| [γ-32P]ATP | 5μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 灭菌的超纯水 | 补足到25μL |
注:5 pmoles的5′末端约等于0.17μg的长100bp的双链DNA。
3. 37℃反应30分钟。
4. 70℃加热5~10分钟使酶失活。
5. 加入10μl的7 M CH3COONH4(pH4.5)。如使用CH3COONa做乙醇沉淀时使其终浓度达300mM。
6. 加入87.5μl(2.5倍)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
7.离心回收沉淀,用 70%的冷乙醇清洗沉淀,真空干燥。
8. 用适当 Buffer 溶解沉淀。
注:通过第5~8 步操作几乎可以除去大部分未反应的[γ-32P] ATP,如要完全将其除去时,乙醇沉淀后用凝胶过滤等方法精制即可。如需用běn酚抽提除去蛋白质时,请在第8 步之后进行。
二、磷酸化反应标记
A. 去磷酸化反应
1. 实验前需自备的试剂:TE 饱和酚/lǜ仿、3 M NaCl 、100%乙醇、70%乙醇、牛小肠碱性磷酸酶(CIAP)等
2.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
| 自备的DNA片段 | 133μL(≤10μg) |
| 1M Tris-HCl,pH8.0 | 15μL |
| 牛小肠碱性磷酸酶(CIAP,10~20U/μL) | 2μl |
| 灭菌的超纯水 | 补足到150μL |
3. 50℃反应30分钟。
4. 加入150μl的TE 饱和酚/lǜ仿/异戊chún(25:24:1),充分混匀。
5.离心,取上层(水层)移到另一个微量离心管中。
6. 重复操作 4~5。
7. 加入7.5μl的3 M NaCl(最终浓度150mM)。
8. 加入375μl(2.5倍量)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
9.离心回收沉淀,用 1mL 70%的冷乙醇清洗后,沉淀真空干燥。
10. 使用 20μl的TE Buffer 溶解沉淀。
B. 磷酸化反应(前反应)
1.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
| 自备的DNA片段 | 20.5μL(≤5 pmoles的5′末端) |
| 10×磷酸缓冲液 | 2.5μL |
| [γ-32P]ATP | 1μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 灭菌的超纯水 | 补足到25μL |
2. 37℃反应30分钟。
3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。
三、合成DNA 寡核苷酸的标记
1.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
| Oligonucleotide DNA with free 5′-OH(5~10 pmoles) | ≤3μL |
| 10×磷酸缓冲液 | 2.5μL |
| [γ-32P]ATP | 1μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 灭菌的超纯水 | 补足到25μL |
2. 37℃反应30分钟。
3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。
四、合成DNA 寡核苷酸的标记
当掺入水平很低的时候,需要使用本步骤,即通过体积排阻色谱或过滤试剂盒除去未反应的标记。Sephadex G-50 层析柱(需另购)对于去除未掺入的dNTPs效果很好,它还能大幅减少小于20个碱基的DNA 寡核苷酸和小于20bp的双链DNA的量。使用之前需要在70℃加热5~10分钟以使T4 多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25 层析柱可以用来纯化长度不小于10个碱基的寡核苷酸。
注意事项:
1.缓冲液可在室温融解。融解后立即置于冰中,使用前充分混匀。
2. 5×交换反应缓冲液于-20℃冻结保存时会有白色浑浊出现,但不影响反应效果。
3.酶切得到的DNA片段需经乙醇沉淀等方法纯化。
4. 当用于交换反应的DNA在5 pmoles以上(约1,000bp以上)时,标记效率有时会低于106 cpm/pmol。
5. 如果交换反应所用 DNA低于500bp时,标记效率有时会有所降低。
6. 若不进行放射线标记,仅使用本试剂盒做5′末端磷酸化反应时,反应体系中的[γ-32P]ATP可用5μl的10mM ATP 代替。
7. 磷酸化反应时的[γ-32P]ATP可用[γ-35S]ATP 替代。
使用举例:
按照使用方法中交换反应和合成DNA 寡核苷酸的标记的实验操作,取λ-BstP I,λ-Hpa I,λ-EcoT22 I 各3 pmols,用[γ-32 P]ATP 通过正向磷酸化反应或交换反应标记。各DNA片段的放射自显影结果如下所示:
我公司销售的5′末端同位素标记试剂盒北京供应商,质量上佳,价格普惠,欢迎广大新老客户踊跃订购。
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文献和实验公司的Atlas Pure Total RNA Labeling System: 这是一个从Total RNA中制备同位素标记的cDNA探针的试剂盒。利用生物素偶联的Oligo(dT)和磁珠偶联的Streptavidin将mRNA吸附到磁珠上,加入MacroArray(包括尼龙膜基质和塑料基质)提供的基因特异引物混合物(CDS Primer)、同位素标记物和逆转录酶,直接在磁珠上合成同位素标记的cDNA探针,最后从磁珠上洗脱标记好的探针,纯化后即可用于杂交。这个标记试剂盒可以从少至10μg
MacroArray(包括尼龙膜基质和塑料基质)提供的基因特异引物混合物(CDS Primer)、同位素标记物和逆转录酶,直接在磁珠上合成同位素标记的cDNA探针,最后从磁珠上洗脱标记好的探针,纯化后即可用于杂交。这个标记试剂盒可以从少至10μg的total RNA中制备适用于Clontech公司各种尼龙膜基质和塑料基质MacroArray的高质量cDNA探针。由于将mRNA纯化和cDNA探针合成、标记合为一体,方便用户的同时还可节约成本。这个系统不适用于玻片芯片的探针标记。 4) Clontech公司
10%,此方法降低了显示谱带的复杂性,同时简化了后期进行克隆筛选的工作。电泳结束后,进行放射自显影。有用32P或 33P代替原方法中的32S,由于32P或33P的能量高且稳定,可提高电泳条带放射自显影的分辨力,缩短曝光时间,同时,将同位素标记反应底物dNTP改为末端标记锚定Oligo(dT)引物,使只有5′端和3′端引物之间的扩增产物才能被显示,而两个5′端引物之间的扩增产物则不被显示,这样就减少了“人工条带”造成的假阳性,提高了灵敏度和特异性。Lohman等(1995)建立了银染差异显示方法
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