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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
218
- 英文名:
NewPurify FFPE DNA Extraction kit
- 保质期:
长期
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
RT(15~30℃)
- 规格:
50次
特别提示:包括新型固定组织基因组DNA提取试剂盒在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:新型固定组织基因组DNA提取试剂盒
英文名称:NewPurify FFPE DNA Extraction kit
产品货号:WE0172
产品规格:50次
本试剂盒适用于从福尔马林固定、石蜡包埋组织中有效纯化基因组DNA。本品使用专门优化脱蜡剂和裂解液,释放福尔马林固定或组织切片样本中的DNA,不涉及有机试剂二jiǎ苯,无需过夜操作;消化后的样品在较高的温度孵育后,去除游离DNA的福尔马林交联,有效提高DNA的产量和纯度;优化的缓冲系统使裂解液中的DNA可特异结合到吸附膜上,抑制剂通过两步漂洗步骤有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可获得高纯度DNA。同时配置高效微量吸附柱,洗脱体积可低至20μl。经过纯化的DNA可以直接用于PCR、Real-time PCR、SNP基因分型、STR基因分型、二代测序和药物基因组学研究等。
从福尔马林固定、石蜡包埋样本中分离的DNA分子量通常低于新鲜或冷冻样本中的DNA。DNA片段化的程度取决于样本类型、储存时间以及固定的条件。
试剂盒组成:
| 组份 | 50次 |
| Buffer GTL | 15ml |
| Buffer GL | 15ml |
| Buffer GW1(浓缩) | 13ml |
| Buffer GW2(浓缩) | 15ml |
| Buffer EB | 10ml |
| Buffer DS | 10ml |
| 蛋白酶K | 25 mg |
| 蛋白酶K 储存液 | 1.25ml |
| 离心吸附柱DF及收集管 | 50套 |
| 离心管(L-1.5ml) | 50个 |
自备试剂:无水乙醇。
实验前准备及重要注意事项:
1、获得样品后,要尽快将样品在4%-10%的福尔马林中固定,固定时间以14-24小时为宜,时间过长易导致基因组断裂,影响下游实验。如果甲醛固定时间过长或样本存放时间过久(>1年)则易导致DNA完整性受损,无法扩出长片段。
2、确保包埋前的样品彻底脱水,残留的福尔马林会抑制蛋白酶K 的作用。
3、向蛋白酶K 中加入1.25ml 蛋白酶K 储存液使其溶解,-20℃保存。配制好的蛋白酶K 勿长时间室温放置,以免影响其活性。
4、第一次使用前应按试剂瓶标签说明先在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。
5、使用前请检查Buffer GTL、Buffer GL和Buffer DS是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将Buffer GTL、Buffer GL和Buffer DS于56℃水浴重新溶解。
6、如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入Buffer GL前加入2μl DNase-Free的RNase A(100 mg/ml),RNase A本试剂盒并未提供,如果需要可单独向本公司订购,货号:WE0225S。
7、实验开始前将水浴锅或恒温混匀仪预热至56℃。
操作步骤:
石蜡包埋样本
1、用手术刀将组织块中多余的石蜡修剪掉,露出组织后切成5-10μM的薄片。
2、取约1×1cm2的切片(共约3-8片切片)置于离心管(自备)中,加入160μl Buffer DS,涡旋震荡10秒。短暂离心将样本收集到管底。56℃孵育3分钟,水浴锅中取出后静置,降至室温后进行下一步操作。
注意:如果样品表面暴露在空气中,最初的2-3片弃掉不用。
3、上述管中加入180μl Buffer GTL,涡旋震荡混匀,12000rpm离心1分钟,溶液分为两层。取20μl 蛋白酶K 加入到下层溶液中,移液器小心吹吸混匀。
4、56℃孵育1小时,直至样品完全溶解。90℃孵育1小时。12000rpm离心1分钟,使用200μl枪头沿管壁小心吸取下层的水相于新的离心管中。
注意:
1)此步骤的目的是修复由甲醛变性的核酸,孵育的温度过高或时间过长可能造成DNA断裂,产生DNA碎片。
2)56℃孵育后的样品可置于室温,直至水浴锅或干浴锅温度达到90℃后再把样品置于90℃孵育。
3)如需除去RNA,可将样品温度降到室温后,加入2μl浓度为100 mg/ml 的RNase A溶液(货号:WE0225S),震荡混匀,室温放置2分钟。
福尔马林等固定液中的样本
1、取约20 mg的样本,切成小块,置于离心管中,加入500μl 10mM PBS(PH7.4),涡旋振荡,12000rpm(~~13400×g)离心1分钟,弃上清,重复3次。
2、上述管中加入180μl Buffer GTL,20μl 蛋白酶K ,涡旋震荡混匀。
3、56℃孵育1小时,直至样品完全溶解。90℃孵育1小时。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
注意:
1)此步骤的目的是修复由甲醛变性的核酸,孵育的温度过高或时间过长可能造成DNA断裂,产生DNA碎片。
2)56℃孵育后的样品可置于室温,直至水浴锅或干浴锅温度达到90℃后再把样品置于90℃孵育。
4、12000rpm离心1分钟,使用200μl枪头沿管壁小心吸取上清到新的离心管中。
注意:如需除去RNA,可将样品温度降到室温后,加入2μl浓度为100 mg/ml 的RNase A溶液(货号:WE0225S),震荡混匀,室温放置2分钟。
5、加入200μl Buffer GL,涡旋震荡混匀后加入200μl无水乙醇,涡旋震荡彻底混匀。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
注意:
1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即充分混匀。
2)加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。
3)如果需要对多个样品进行操作,可以将Buffer GL和无水乙醇事先混匀后加样。
6、将步骤5所得溶液全部加入已装入收集管的吸附柱DF中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
8、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤8。
9、12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟以彻底晾干。
注意:这一步目的是将吸附柱中残余乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应。
10、将吸附柱置于一个新的1.5ml收集管中,向吸附柱的中间部位悬空加入20-100μlBuffer EB或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
注意:
1)洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5,pH值低于7.0时洗脱效率不高。
2)如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤10所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,室温放置2分钟,12000rpm离心1分钟。
储存条件:室温(15~30℃)。
我公司销售的新型固定组织基因组DNA提取试剂盒北京现货,质量上佳,价格普惠,欢迎广大新老客户踊跃订购。
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