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KAPA HiFi高保真二代测序文库扩增试剂kk2620/k

k2621
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  • KAPA
  • kk2620/kk2621
  • USA
  • 2025年08月25日
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      KAPA Library Amplification Kit with Primers (50 x 50 µl reactions)

    • 规格

      (50 x 50 µl reactions)

    KAPA HiFi高保真二代测序文库扩增试剂kk2620/kk2621
    在PCR扩增过程中,DNA扩增酶对文库中的不同DNA片段的扩增效率不完全一样。而非均匀的扩增所有的基因片段。这种扩增偏好性会加剧测序覆盖度的不均衡性。KAPA HIFI文库扩增试剂是为了应对由PCR扩增产生的偏好性问题。试剂盒中含有的新型KAPA HIFI DNA扩增酶,是二代基因工程酶,具有高保真性,高眼神能力,对于复杂DNA模板展示出均衡的扩增效率。
    ,产品应用
    高效,高保真,低偏好,扩增测序前的文库,主要包括:
    1,全基因组鸟枪法测序。
    2,靶标测序(补货前/后扩增)
    3,扩增子测序
    4,CHIP测序
    5,RNA测序
    技术优势:
    1,提高基因组中GC或高AT区的扩增效率
    2,降低扩增偏好性从而提高测序覆盖度。
    3,具有行业领先的工业级保真性。

    3、优异表现

      (1)高GC含量对于使用普通具有校正功能(proof-reading) (B-家族)扩增酶扩增的文库在测序读深中的影响

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      (2)根据文库扩增所用的扩增酶的不同,低GC含量的文库会产生不同的扩增偏好性

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      上图:采用相同的物理打断的 P.falciparum(恶性疟原虫,AT含量65%)gDNA制备的文库用图中所示的PCR试剂(KAPA HiFi,Phusion®)分别进行扩增,然后与没有进行扩增的同等文库进行比较。不同条件下测序read的观察到的不同GC含量的频率如图中曲线所示(黑色=没有扩增;绿色=KAPA HiFi热启动Master Mix;蓝色=Phusion® HF Master Mix)。Reads的期望频率分布为图中灰色阴影区域。未经扩增的文库曲线基本与期望频率分布区域外缘重合。使用KAPAHiFi作为扩增的文库表现出最小的偏差,而使用Phusion®进行扩增的文库中高GC含量的片段,和低GC含量的片段相比,表现出巨大扩增偏差。各文库平均覆盖深度为16.0X(作为对照的未扩增样本);16.5X(KAPA HiFi);18.8X(Phusion®)。以上数据由The Wellcome Trust Sanger Institute,Dr.Michael A.Quail提供。

      (3)文库扩增会极大影响测序覆盖度的一致性

      以下在Artemis的截屏图像描绘了分别使用KAPA HiFi热启动Master Mix、Phusion® HF Master Mix进行文库扩增后,与未进行文库扩增的对照相比,出现的覆盖度偏差。经过上诉不同的扩增途径,无论是高GC含量还是低GC含量的片段,覆盖度偏差的程度也有不同。

    2WgMtHtPQYuHAjQwAkU8Dg.jpg

      上图:P.falciparum(恶性疟原虫)基因组中一7kb片段的覆盖深度和GC含量

      在这段基因组序列中,有3处AT含量>80%,从而导致覆盖度偏差(灰色标注区域)。在这三处高AT区域中,使用PHusion®(蓝色)进行文库扩增后,覆盖深度急剧下降;而使用KAPA HiFi(绿色)进行文库扩增后,三处区域覆盖深度与基因组其他区域统一、一致,而且与没有进行扩增的对照组的覆盖深度结果基本重合。

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      上图:B.pertussis(百日咳鲍特菌)基因组中一7kb片段的覆盖深度和GC含量

      在这段基因组片段中,有4处GC含量>75%,从而导致覆盖度偏差(灰色标注区域)。在这4处高GC含量区域中,使用PHusion®(蓝色)进行文库扩增后,覆盖深度和未进行扩增的对照相比,急剧下降;而使用KAPA HiFi(绿色)进行文库扩增后,4处区域覆盖深度比较统一、一致,与没有进行扩增的对照组(黑色)的覆盖深度结果相似。

      (4)高保真文库扩增的超高准确性

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      上图:DNA扩增酶(包括混合酶)的错误率KAPA HiFi扩增酶对的错误率/错配率是每覆盖3.54×106 碱基仅出现一个错误(2.82×10-7),错误率比Taq扩增酶低100倍,比基于Taq的混合酶低40倍,比Phusion®低2倍。

      4、产品信息

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    产品价格:
    二代测序文库制备 KK8230 KAPA LTP文库构建(含文库扩增)试剂盒-Illumina 10个文库 2500
    KK8231 KAPA LTP文库构建(不含文库扩增)试剂盒-Illumina 10个文库 2400
    KK8232 KAPA LTP文库构建(含文库扩增)试剂盒-Illumina  50个文库 11000
    KK8233 KAPA LTP文库构建(不含文库扩增)试剂盒-Illumina  50个文库 10500
    KK8234 KAPA HTP文库构建(含文库扩增)试剂盒-Illumina  96个文库 18000
    KK8235 KAPA HTP文库构建(不含文库扩增)试剂盒-Illumina 96个文库 17000
    KK8260 KAPA TruSeq Adapter Kit, (Illumina, 20 μl each) 144 rxn 14000
    KK2620 KAPA Library Amplification Kit with Primers (50 x 50 µl reactions) 50rxn 1800
    KK2621 KAPA Library Amplification Kit with Primers (250 x 50 µl reactions) 250rxn 8000
    KK2623 KAPA Library Amplification Primer Kit (250 x 50 μl rxns) 250rxn 1500
    KK8400 KAPA Stranded RNA-Seq Library Preparation Kit (Illumina,24 reactions) 24 rxn 13000
    KK8401 KAPA Stranded RNA-Seq Library Preparation Kit (96 reactions) 96 rxn 40000
    KK8420 KAPA Stranded mRNA-Seq Library Preparation Kit (24 reactions) 24 rxn 15000
    KK8421 KAPA Stranded mRNA-Seq Library Preparation Kit (96 reactions) 96 rxn 47000

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