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昂飞基因芯片服务(affyme
昂飞基因芯片服务(affymetrix,Agilent,Illumina等)
浙江省内第一台Affymetrix基因芯片系统。凭借浙江加州国际纳米研究院雄厚的科研实力,丰富的服务经验积累,严格的试验建立了全球标准化的操作规程,涵盖芯片实验所需要 的所有工作,实现开放性的芯片实验及生物信息学等系列技术服务平台,竭诚为国内外各高等院校、医院、生物科技公司的课题研究,提供全方位芯片技术服务。有任何问题请联系zjubell#hotmail.com(将#替换成@即可),详情请致电057188208345联系洪老师1.产品表达谱芯片类型:人类表达谱芯片;动物类表达谱芯片;植物类表达谱芯片;2.芯片服务—Affymetrix基因表达谱芯片(Gene Expression)客户只需要提供组织、细胞、即可,从提RNA到纯化、质检、芯片杂交扫描及分析,我们都会为您完成。a样品寄送,组织块建议用干冰或液氮运输;细胞建议放在trizol中4度或干冰运输都可。RNA最好溶解在RNase free的水中干冰运输(如果路程小于30分钟,可以直接放普通冰上运输)(送样要求:RNA实验只需要200ng的总RNA即可,浓度不低于70ng/ul, 考虑到QC以及重复需要,希望提供10ul以上的总RNA。260/280希望在1.8-2.2之间。260/230最好在2.0以上,尽量不低于1.0)b RNA提取与质检,我们采用最先进的Agilent bioanalyzer跑电泳。(下图为DNA电泳模拟图,RNA原理同DNA)电泳结果如下图:18S,28S的比值,5S的区域,浓度以及模拟电泳图c 芯片杂交与洗涤判断芯片是否成功的一些知识:
1. - 四条边明暗交替模式、拐角棋盘模式 - 左上角芯片名称清晰2.背景平均值(Average Background)和噪音值(Noise Values)典型的背景平均值范围在 20 到 100 之间。来源于相同扫描仪应该有可比较的噪音值。结果显示在.rpt 文件中。 3) Poly-A Controls: lys,phe,thr,dapPoly-A RNA Controls 用来监控全程的标记过程. lys,phe,thr,dap 的 3’端都应该表达(Detection 为 P)。结果显示在.rpt 文件中。4) 杂交对照:bioB,bioC,bioD,and crebioB,bioC,bioD 代表 E.coli.生物素合成通路中的基因。bioC,bioD,and cre 应该总是检测到并以递增的信号强度表达,来反映它们相对的浓度。结果显示在.rpt 文件中。5) 内参照基因 Sig(3’/5’)比值检测对于大多数的表达芯片,ß-Actin 和 GAPDH 两个基因被用来评估样品制备的质量。二者探针组的 3’/5’比值至少一个小于 3。ß-Actin 和 GAPDH 的 3’/5’比值显示在.rpt 文件中。6) 总体基因的表达率不能低于 20%。7) RNA, cRNA QC 电泳图 符合质控要求d 数据分析信号通路分析信号通路网络分析聚类分析
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