
基因功能分类及Pathway分析
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- 2025年07月13日
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基因功能分类及Pathway分析
基因功能分类及Pathway分析
GO功能富集分析是判断某个具体的GO term是否富集,也就是在这个term上面映射到的基因数量是否得到一个标准,样本的GO功能分析是基于各自样本得到的差异基因来进行的,通过GO功能富集分析可以了解该样本行使的主要的生物学功能。
Pathway功能富集分析同样对实验结果有提示的作用,样本的Pathway功能富集分析同样也是基于该样本的差异基因来进行的,通过Pathway分析可以了解该样本较显著性的代谢通路。
案例分析
| membrane |
| transport |
| transporter activity |
| plasma membrane |
| cellular homeostasis |
| cytoplasm |
| hydrolase activity |
| nucleus |
| vacuole |
| vesicle-mediated transport |
| protein complex biogenesis |
Pathway功能富集
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文献和实验造血细胞因子IL3,IL5和GMCSF能引起嗜酸性粒细胞中黏附分子ICAM-1的表达,但是关于IL3,IL5和GMCSF介导的嗜酸性粒细胞表达并释放多种黏附分子的具体机制尚未阐明。 实验使用从新鲜人白血球层分离培养的嗜酸性粒细胞,在不同条件处理后,抽提RNA与SuperArray的人NF-κB信号通路基因芯片(GEArray Q series Human NF-κB Signaling Pathway Gene Array, Catalog No. HS-016N)杂交。实验结果分析发现在IL
引言: 基因表达谱常被称为是某一生理/病理现象的“分子图像”。这类复杂的“分子图像”,可用于同时检测成千上万个基因的表达水平,再经专门的计算机软件解读出来。研究人员通过比较源于不同病理条件下的“分子图像”的结果,可以识别出引发癌症等复杂疾病的标志物(Marker)。目前,这些标志基因(Marker genes)还有待于大量工作对其作进一步验证。许多科研人员已把注意力投向密度相对较低的功能分类基因芯片(focused DNA microarray)。因为,如果研究对象是某一生物学通路的基因
bingo816 芯片的结果,信息量很大,而且表达谱很复杂,哪位仁兄有没有什么关于分析基因芯片结果的好方法啊。 非常感谢!!! freecell http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19763933 bingo816 非常感谢您,能不能 上传一下 文章Bioinformatics analysis of microarray data
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