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文献和实验Nat Commun:开发人工空间隔离策略,构建稳定的多物种微生物群落
稳定的微生物生态系统的重要因素。 受大自然的启发,研究团队开发了一种人工的空间分隔方法来构建由单一或多物种组成的合成微生物群落(图 1)。科研人员通过交联的凝胶网络构建尺寸为 ~400 微米的微球并包裹微生物 (Microbial swarmbot, MSB)。微球的三维网状交联结构允许小分子 (营养物质、信号分子和代谢物) 及生物大分子(蛋白质)的自由扩散,但会限制微球内的微生物的运动。因此,每个 MSB 代表一个可以与其他 MSB 交互的亚群。通过将包含不同亚群的 MSB 进行组合,科研
10,000 2.4.2加入50ul未知样品到分析管里,轻轻混匀捕捉混合微球,吸取50ul加入分析管中,室温孵育1小时。 2.4.3每个待测管中加入PE检测试剂50ul,轻轻震荡混匀。室温孵育2小时。 2.4.4加入1ml清洗液Wash Buffer。200g离心5分钟,去上清。 2.4.5加入300ul清洗液Wash Buffer清洗液,震荡重悬微球。 2.5机器条件设定 BD .FACSCalibur包含488蓝激光
光淬灭基团,当两个基团相互先靠近的时候,由于发生能量传递作用,报告基团不能发出荧光,但随着扩增反应的进行,5’端的报告基团随着探针的水解而脱落下来,不再与淬灭发生能量传递作用,从而能发出荧光,被信号探测器所捕获。常同探针5’端相结合的基团有FAM(6-羧基荧光素),TET(四氯-6-羧基荧光素),JOE(2,7-二甲基-4,5-二氯-6-羧基荧光素),HEX(六氯-6-甲基荧光素)或VIC,常与3’端相结合的荧光淬灭基团常为TAMRA (6- 羧基四甲基若丹明)或DABCYL(4-(4’-恶烷氨基苯偶氮)苯甲
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