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蛋白质组学 Label-Free

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  • 苏州工业园区
  • 2025年07月16日
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      普信质谱组学服务


    Label-free技术即非标记定量蛋白质组分析技术,是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做标记,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样本中相应肽段的信号强度,从而肽段对应的蛋白质进行相对定量。

    技术原理
    每条肽段的丰度(量)与其在MS1中的峰面积或信号强度成正比;而不同样本的同一条肽段在色谱上的保留时间是一致的,因此,可通过对比MS图谱,再整合到相应蛋白,实现对蛋白质在不同样本中的相对表达水平的定量分析。

    实验流程
    提取样本中的总蛋白,取出一部分做蛋白浓度测定及SDS-PAGE检测,另取部分进行胰蛋白酶酶解,对酶解肽段除盐后,对样本进行质谱分析及数据分析,如图所示


    技术特点
    1、无需标记,操作简单;
    2、不受比较样品数限制;
    3、对实验操作稳定性、重复性要求高,要求至少做三次技术重复或生物重复;
    4、准确性较标记定量差。

    应用领域
    1、适合大样本量的定量比较
    2、对无法用标记定量实现的实验设计,易用label-free技术
    3、要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息




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    相关实验
    • label-free定量蛋白质组学技术

      本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括:(1)以MS数据为例,系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。(2)介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。(3)以免疫沉淀(IP)数据为例,展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。(4)以数据为例,展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。

    • Label-free/iTRAQ定量蛋白质组学技术

      行串联质谱分析,可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量或绝对含量。 iTRAQ技术特点: 不同样本标记之后混样,统一处理上机,减少了分别上机造成的实验误差,并利用同位素标签的丰度来检测,定量更准确,重复性更好; 由于需要标记试剂标记,因此成本相对较高; 通量高,在一次实验中最多可同时比较8个样品; 利用基于同一个参考样品的办法,可以进行多于8个样品的定量比较; iTRAQ的覆盖度高、灵敏度高。 Label-Free定量蛋白质组学分析 Label-Free定量,即非标记的定量蛋白质组学

    • 常规样本蛋白质组学样本量要求

      备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。

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