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北京诺禾致源科技股份有限公司
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FFPE定量蛋白质组学
研究意义
基于质谱的蛋白质组学为高通量分析成千上万的蛋白质提供了可能,因此,将标准蛋白质组学分析技术应用于 FFPE 组织蛋白提取液,将揭示大量与疾病相关的功能信息,从而帮助我们识别与特定疾病诊断、预后、监测和治疗相关的有意义的生物标志物。技术难点
对组织进行甲醛固定及石蜡包埋等处理会导致组织细胞中的蛋白质、核酸等分子发生相当广泛的分子交联,使获取 FFPE 组织内锁定的蛋白质组变得相当困难。甲醛固定限制了蛋白质的提取效率,损害了免疫反应活性,并可能导致质谱技术对蛋白质的鉴定不明确。因此,需要一种有效的方法从 FFPE 组织中进行蛋白质的提取。基于此,诺禾致源经过大量文献调研、研发测试,现已开发出能高质量获取 FFPE 样本中蛋白质的提取方法。
参考文献
Fabian Coscia, Ernst Lengyel, Jaikumar Duraiswamy, et al. Multi-level Proteomics Identifies CT45 as a Chemosensitivity Mediator and Immunotherapy Target in Ovarian Cancer[J]. Cell, 2019, 179: 1-15.风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
文献和实验,4046 个蛋白质被定量。与对照组相比,CUMS 组在 1.5 倍变化 (> 1.50 或 差异蛋白验证:免疫荧光证实,与对照组相比,海马 CA1 和 DG 亚区的神经元损失显著。对 RIP3、MLKL 和 p-MLKL 及与铁稳态失调和脂质过氧化相关指标,包括 Ftl1、MDA、GSH 和 GPX4 等进行 WB 验证,结果表明铁死亡和坏死与慢性应激诱导的抑郁有关。 6.2、IF 3-5 分文章:蛋白质组学+代谢组学 蛋白质组学和代谢组学检测 分析差异蛋白,对差异蛋白进行
University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple
备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
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