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FFPE定量蛋白质组学

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  • 福尔马林固定的石蜡包埋(formalin-fixedparaffin-embedded,FFPE)组织样本长期以来被用于组织学和形态学结构的保存,以便对疾病进行组织病理学诊断。这些 FFPE 组织集合连同附加的临床和结果信息,形成了用于癌症和其他疾病研究的组织样本的宝贵资源。
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  • 2026年04月29日
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      北京诺禾致源科技股份有限公司

    • 服务名称

      FFPE定量蛋白质组学

    福尔马林固定的石蜡包埋(formalin-fixedparaffin-embedded,FFPE)组织样本长期以来被用于组织学和形态学结构的保存,以便对疾病进行组织病理学诊断。这些 FFPE 组织集合连同附加的临床和结果信息,形成了用于癌症和其他疾病研究的组织样本的宝贵资源。

    研究意义

    基于质谱的蛋白质组学为高通量分析成千上万的蛋白质提供了可能,因此,将标准蛋白质组学分析技术应用于 FFPE 组织蛋白提取液,将揭示大量与疾病相关的功能信息,从而帮助我们识别与特定疾病诊断、预后、监测和治疗相关的有意义的生物标志物。

    技术难点

    对组织进行甲醛固定及石蜡包埋等处理会导致组织细胞中的蛋白质、核酸等分子发生相当广泛的分子交联,使获取 FFPE 组织内锁定的蛋白质组变得相当困难。甲醛固定限制了蛋白质的提取效率,损害了免疫反应活性,并可能导致质谱技术对蛋白质的鉴定不明确。因此,需要一种有效的方法从 FFPE 组织中进行蛋白质的提取。基于此,诺禾致源经过大量文献调研、研发测试,现已开发出能高质量获取 FFPE 样本中蛋白质的提取方法。产品细节图片1
    实验流程
     

    参考文献

    Fabian Coscia, Ernst Lengyel, Jaikumar Duraiswamy, et al. Multi-level Proteomics Identifies CT45 as a Chemosensitivity Mediator and Immunotherapy Target in Ovarian Cancer[J]. Cell, 2019, 179: 1-15.

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    图标文献和实验
    相关实验
    • 蛋白质组学研究思路以及发表案例

      ,4046 个蛋白质被定量。与对照组相比,CUMS 组在 1.5 倍变化 (> 1.50 或 差异蛋白验证:免疫荧光证实,与对照组相比,海马 CA1 和 DG 亚区的神经元损失显著。对 RIP3、MLKL 和 p-MLKL 及与铁稳态失调和脂质过氧化相关指标,包括 Ftl1、MDA、GSH 和 GPX4 等进行 WB 验证,结果表明铁死亡和坏死与慢性应激诱导的抑郁有关。 6.2、IF 3-5 分文章:蛋白质组学+代谢组学 蛋白质组学和代谢组学检测 分析差异蛋白,对差异蛋白进行

    • 蛋白质组学指南

      University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple

    • 常规样本蛋白质组学样本量要求

      备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。

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