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去泛素化酶基因载体库,dubiquitin,DUB fami

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          去泛素化酶(DUBs),是一类数量很大的蛋白酶类家族。它主要通过水解泛素羧基末端的酯键、肽键或异肽键,将泛素分子特异性的从链接有泛素的蛋白质或者前体蛋白水解下来。人类基因组编码近100种去泛素酶,使得它们成为泛素系统酶中最大家族。在人类中的去泛素化酶基因,可分为两大类:半胱氨酸蛋白酶家族和金属蛋白酶家族。半胱氨酸蛋白酶家族包含一些泛素特异型加工蛋白酶(USPs),泛素羧基末端端水解酶(UCHs),Machado-Josephin结构域蛋白酶(MJDS)和卵巢肿瘤相关蛋白酶(OTU)。金属蛋白酶家族只包含MPN(+)/JAMM蛋白酶家族。 

           去泛素化酶在泛素化途径中扮演重要的角色,在泛素-蛋白酶系统中已泛素化的蛋白底物,通过裂解切断泛素链与底物蛋白之间的连接及泛素化链之间的连接,使泛素分子从蛋白质底物中脱离出来。
     



          去泛素化酶基因家族一共有100多个,本公司现已将接近200个基因克隆构建至慢病毒载体,新的基因持续克隆更新中。
          
         载体骨架是慢病毒载体:



    表. 去泛素化酶基因载体列表。
     
    The Human DUB Superfamily Tree
    Family 编号 Name length/bp NCBI Reference Sequence
    USP  FAMILY L1 USP15 2995 NM_001252078.1 NP_001239007.1
    L2 USP4 2942 NM_003363.3 NP_003354.2
    L3 USP11 2942 NM_004651.3 NP_004642.2
    L4 USP32 4897 NM_032582.3 NP_115971.2
    L5 USP6 4293 NM_001304284.1 NP_001291213.1
    L6 USP8 3414 NM_005154.4 NP_005145.3
    L7 USP19 4023 NM_006677.2 NP_006668.1
    L8 USP21 1728 NM_001014443.2 NP_001014443.1
    L9 USP2 1850 NM_004205.4 NP_004196.4
    L10 USP31 4128 NM_020718.3 NP_065769.3
    L11 USP43 3430 NM_153210.4 NP_694942.3
    L12 USP50* 1023 NM_203494.4 NP_987090.2
    L13 USP39* 1728 NM_001256725.1 NP_001243654.1
    L14 USP20 2792 NM_001008563.4 NP_001008563.2
    L15 USP33 2878 NM_015017.4 NP_055832.3
    L16 USP16 2515 NM_001032410.1 NP_001027582.1
    L17 USP45 2487 NM_001080481.1 NP_001073950.1
    L18 USP3 1591 NM_006537.3 NP_006528.2
    L19 USP51 2173 NM_201286.3 NP_958443.1
    L20 USP22 1606 NM_015276.1 NP_056091.1
    L21 USP27X 1340 NM_001145073.2 NP_001138545.1
    L22 USP10 2438 NM_005153.2 NP_005144.2
    L23 USP17 1616 NM_201402.2 NP_958804.2
    L24 USP36 3430 NM_001321291.1 NP_001308220.1
    L25 USP42 3981 NM_032172.2 NP_115548.1
    L26 USP44 2176 NM_001042403.2 NP_001035862.1
    L27 USP49 2103 NM_001286554.1 NP_001273483.1
    L28 USP12 1132 NM_182488.3 NP_872294.2
    L29 USP46 1120 NM_022832.3 NP_073743.2
    L30 USP35 3107 NM_020798.3 NP_065849.1
    L31 USP38 3181 NM_032557.6 NP_115946.2
    L32 USP37 2988 NM_020935.2 NP_065986.2
    L33 USP26 2787 NM_031907.1 NP_114113.1
    L34 USP29 2815 NM_020903.2 NP_065954.1
    L35 USP13 2635 NM_003940.2 NP_003931.2
    L36 USP5 2619 NM_001098536.1 NP_001092006.1
    L37 CYLD 2921 NM_015247.2 NP_056062.1
    L38 USP48 3162 NM_032236.7  NP_115612.4
    L39 USP14 1512 NM_005151.3 NP_005142.1
    L40 USP47 4199 NM_001330208.1 NP_001317137.1
    L41 USP40 3772 NM_018218.2 NP_060688.1
    L42 USP7 3365 NM_003470.2 NP_003461.2
    L43 USP30 1579 NM_032663.4 NP_116052.2
    L44 USP18 1138 NM_017414.3 NP_059110.2
    L45 USP41 1094 XM_017029164.1 XP_016884653.1
    L46 USP25 3318 NM_001283042.2 NP_001269971.1
    L47 USP28 3287 NM_020886.3 NP_065937.1
    L48 USP34 10818 NM_014709.3 NP_055524.3
    L49 USP24 7994 NM_015306.2 NP_056121.2
    L50 USP9X 7841 NM_001039590.2 NP_001034679.2
    L51 USP9Y 7795 NM_004654.3 NP_004645.2
    L52 USP1 2397 NM_003368.4 NP_003359.3
    L53 USP52* 3661 NM_001127460.2 NP_001120932.1
    L54 USPL1 3333 NM_005800.4 NP_005791.3
    L55 USP53* 3275 NM_019050.2 NP_061923.2
    L56 USP54* 5139 NM_152586.3 NP_689799.3
    UCH  FAMILY L57 UCHL1 683 NM_004181.4 NP_004172.2
    L58 UCHL3 705 NM_006002.4 NP_005993.1
    L59 UCHL5 1007 NM_015984.4 NP_057068.1
    L60 BAP1 2226 NM_004656.3  NP_004647.1
    JOSEPHIN  FAMILY L61 ATXN3 1104 NM_004993.5 NP_004984.2
    L62 ATXN3L 1086 NM_001135995.1 NP_001129467.1
    L63 JOSD1 619 NM_001360235.1 NP_001347164.1
    L64 JOSD2 576 NM_001270639.1 NP_001257568.1
    OTU  FAMILY L65 OTUD4 3400 XM_005263079.4 XP_005263136.1
    L66 HIN1L** 1351 GenBank: BN000160.1  
    L67 OTU1 827 NM_017670.2 NP_060140.2
    L68 OTUD1 1470 NM_001145373.2 NP_001138845.1
    L69 OTUD5 1744 NM_017602.3 NP_060072.1
    L70 OTUD3 1216 NM_015207.1 NP_056022.1
    L71 OTUD6A 881 NM_207320.2 NP_997203.1
    L72 OTUD6B 896 NM_016023.4 NP_057107.4
    L73 OTUB1 829 NM_017670.2 NP_060140.2
    L74 OTUB2 716 NM_023112.3 NP_075601.1
    L75 VCPIP 3722 NM_025054.4 NP_079330.2
    L76 TRABID 2157 NM_017580.2 NP_060050.2
    L77 A20 2407 NM_001270508.1 NP_001257437.1
    L78 Cezanne2 2821 NM_130901.2 NP_570971.1
    L79 Cezanne 2568 NM_020205.3 NP_064590.2
    L80 FAM105* 1088 NM_019018.2 NP_061891.1
    L81 OTULIN 1076 NM_138348.5 NP_612357.4
    JAMM/MPN+ FAMILY L82 CSN5 1020 NM_006837.2 NP_006828.2
    L83 POH1 947 NM_005805.5 NP_005796.1
    L84 BRCC3 966 NM_024332.3 NP_077308.1
    L85 MPND 1439 NM_032868.5 NP_116257.2
    L86 MYSM1 2528 NM_001085487.2 NP_001078956.1
    L87 EIF3H* 1076 NM_003756.2 NP_003747.1
    L88 CSN6* 999 NM_006833.4 NP_006824.2
    L89 PSMD7* 991 NM_002811.4 NP_002802.2
    L90 EIF3F* 1091 NM_003754.2 NP_003745.1
    L91 AMSH 1294 NM_001353967.1 NP_001340896.1
    L92 AMSH-LP 1329 NM_020799.3 NP_065850.1
    L93 PRPF8* 7124 NM_006445.3 NP_006436.3

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    相关实验
    • Crystallization of Kinesin Family Motor Proteins

      Motor proteins of several kinesin family groups have now been crystallized: monomeric Kinesin-1 motor domains from human,rat and Neurospora (Kull et al.,1996; Sack et al.,1997; Song et al.,2001)and dimeric rat Kinesin-1 (two motor domains connected

    • family

      生物分类群的等级,它位于属之上和目之下。从整个生物来看虽然不一定是处于同一阶段上,但大体上它是由亲缘关系相近的属所集合成的自然群。以前作为自然群的科往往被认为是超科的(在动物界)。在命名上是以模式或属于该科的属名附以特定的词尾(动物为-idae,植物为 -aceae)以表示之。科的概念稍迟于属,林奈( C. von Linne’)在《植物学哲学论文集》(‘ Philosophia Botanica’, 1751)一书中列举了植物 68个目( ordo),其中具有科的内容和词尾的有葫芦

    • 家庭 family

      着密切的相互作用,这种动物集团(见动物的社会)也可称之为家庭或生物学的家庭( biological family)。动物由母亲和养育期的幼仔所形成的集团,以及社会性昆虫的变形大家庭集团等是典型的生物学家庭。由雌雄个体所形成的性的集团( mating association, pair- pond)虽然不能称之为家庭,但有雌雄关系且随之而有亲代与子代间的养育关系,在此期间的动物集团也多被称为家庭。有关人类家庭的起源,是人类学中的一个困难问题,自 1877年摩尔根( L. H. Morgan)的原始乱婚

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