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根据对培养组成物质的化学成分是否完全了解来区分，可以将培养基分为天然培养基、合成培养基和半合成培养基。
（1）天然培养基。天然培养基是指利用各种动、植物或微生物的原料，其成分难以确切知道。例如培养细菌常用的肉汤蛋白胨培养基：牛肉膏3g，蛋白胨5g，水1000mL。
用做这种培养基的主要原料有：牛肉膏、麦芽汁、蛋白胨、酵母膏、玉米粉、麸皮、各种饼粉、马铃薯、牛奶、血清等。用这些物质配成的培养基虽然不能确切知道它的化学成分，但一般来讲，营养是比较丰富的，微生物生长旺盛，而且来源广泛，配制方便，所以较为常用，尤其适合于配制实验室常用的培养基和大生产上的培养基。
这种培养基的稳定性常受生产厂或批号等因素的影响，另外自养微生物一般不能在其上面生长。
（2）合成培养基。合成培养基是一类化学成分和数量完全知道的培养基，它是用已知化学成分的化学药品配制而成。例如培养细菌的葡萄糖铵盐培养基：C6H12O60.2%，K2HPO40.7%，KH2PO4 0.3%，Na3C6H5O70.05%，MgSO4·7H2O0.01%，（NH4）2SO40.1%，H2O 100mL。
这类培养基化学成分精确、重复性强，但价格昂贵，而微生物又生长缓慢，所以它只适用于做一些科学研究，例如营养、代谢的研究。
（3）半合成培养基。在合成培养基中，加入某种或几种天然成分；或者在天然培养基中，加入一种或几种已知成分的化学药品即成半合成培养基。例如马铃薯蔗糖培养基等。如果在合成培养基中加入琼脂，由于琼脂中含有较多的化学成分不太清楚的杂质，故也只能算是半合成培养基。这种培养基在生产实践和实验室中使用最多。
胰化大豆蛋白琼脂（TSA）价格按培养基的物理状态区分
培养基按其物理状态可分为固体培养基、液体培养基和半固体培养基三类。
（1）固体培养基。是在培养基中加入凝固剂，有琼脂、明胶、硅胶等。固体培养基常用于微生物分离、鉴定、计数和菌种保存等方面。
用于微生物分离，鉴定，计数。如图，微生物分离成菌落、菌苔。图中为大肠杆菌菌落，是用涂布平板法得到。
用于分离微生物的固体培养基
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（2）半固体培养基。是在液体培养基中加入少量凝固剂而呈半固体状态。可用于观察细菌的运动、鉴定菌种和测定噬菌体的效价等方面。
用于观察微生物运动特征。如图，左侧试管中微生物不运动，而右侧试管中微生物运动，因而两试管中现象不同
用于观察微生物运动特征的半固体培养基
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（3）液体培养基。液体培养基中不加任何凝固剂。这种培养基的成分均匀，微生物能充分接触和利用培养基中的养料，适于作生理等研究，由于发酵率高，操作方便，也常用于发酵工业。
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文献和实验性有很大提高。酸处理时，pH值11S球蛋白有很强的变性作用。 2.3 酶处理 Wu等用木瓜蛋白酶水解大豆分离蛋白，并用超滤分离水解产物。11S蛋白亚基比7S球蛋白严基对木瓜蛋白酶敏感。木瓜蛋白酶显著提高大豆分离蛋白的表面吸水性、溶解性和乳化性。 QI等研究了胰酶对大豆分离蛋白的水解作用。胰酶包括胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶，能水解11S大豆球蛋白的两个碱性亚基。大豆蛋白经胰酶水解后，表面吸水性（S0）显著提高，溶解性变化不大，乳化液蛋白质和油含量增加，乳化能力增加，但乳化稳定性有所降低。
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