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嵘崴达
- 英文名:
5′/3′ RACE Kit, 2nd Generation
- 规格:
10 REACTIONS
5′/3′ RACE试剂盒,第2代
sufficient for 10 reactions
一般描述
cDNA末端快速扩增(RACE)是一种用于从部分已知序列快速获得全长cDNA的常用技术。5′/3′ RACE试剂盒包含转录物逆转录酶和重组末端转移酶。转录子逆转录酶可转录全长cDNA,用于高达14 kb的55′或3′ cDNA片段的高灵敏度和快速扩增。其具有热稳定性(高达+ 65°C),适用于具有高二级结构的高GC含量模板。使用转录物逆转录酶可以实现高灵敏度,从而实现高效的cDNA合成和长RACE产物的获得。重组末端转移酶用于将同聚A尾添加至cDNA的3′末端。poly(A)+尾可降低oligo(dT)-锚定引物所产生的不适当截短的可能性,并且可以克服相较于G / C来说较弱的A / T杂交问题.此外,在oligo(dT)-锚定引物可以与内部位点进行杂交并且截短扩增产物之前,需要一段更长的A残基片段。使用基因特异性引物和oligo(dT)-锚定引物通过PCR扩增加尾cDNA。使用嵌套的特异性引物和PCR锚定引物,通过第二次PCR进一步扩增所获cDNA,从而将RACE产物克隆到合适的载体中以用于后续研究。
特异性
热灭活:终端转移酶:70°C,10分钟
转录物逆转录酶:85°C,5分钟
应用
第二代5′/3′ RACE试剂盒适用于
- RNA分子的结构和表达研究
- 生成全长cDNA
- 从低拷贝RNA信使中分离和鉴定5′或3′末端
- 第一链cDNA合成
- 扩增和进一步克隆稀有mRNA
- 与外显子捕获方法结合使用
- RACE反应产物无需克隆即可直接测序
特点和优势
- 强大的性能: 重组转录物逆转录酶能够在困难的二级RNA结构区域上向前移动。
- 方便:RNA的5′ 或3′ 末端的功能和表达研究可以用相同的试剂盒进行。
- 可靠: 使用重组末端转移酶获得的dA加尾cDNA降低了不当截短的概率。
- 可重复:具有非3′ dT的寡聚dT-锚定引物能够确保与poly (A)尾的内端正确结合。
- 产生长片段:使用转录物逆转录酶生成长达14kb的cDNA。
对照反应包括使用对照引物neo1/rev将对照RNA转录成第一链cDNA。使用对照引物neo2/rev和neo3/for进行cDNA的扩增,以获得157bp的PCR产物。使用dATP对纯化的cDNA进行加尾。用寡聚dT-锚定引物和对照引物neo2/rev进行加尾cDNA的扩增,以获得293bp的PCR产物。
包装
1个试剂盒包含12个组分
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文献和实验Characterizing cDNA Ends by Circular RACE
Rapid amplification of cDNA ends (RACE) is a widely used PCR-based method to identify the 5′ and 3′ ends of cDNA transcripts from partial cDNAs. While conceptually simple, this method often requires substantial optimization before accurate
GeneRacer Kit 自己DIY了,效果不错。找来了:Invitrogen的SuperScript III反转酶,TAKaRa LA Taq酶、Pyrobest高保真酶。并根据 Invitrogen GeneRacer Kit,自己合成了3’接头引物(侵犯了人家知识产权):3’接头:3'ap 5'-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACGGCATGACAGTG (T)18 -354 bases3’外侧:3'Primer 5’-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACG-3′ 25
5’-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACG-3′ 25bases 76°C 3’内侧:3’Nested Primer 5’-CGCTACGTAACGGCATGACAGTG-3′ 23bases 72°C 二、体会与心得 1、RNA的质量: RNA的质量对于3’RACE的成功至关重要, RNA的质量不好,其他全是白忙活。刚开始用了师兄半年前的RNA做不出来,后发现是由于RNA降解了,用新的RNA后问题就解决了。 所以提完了RNA后别怕麻烦,验证一下质量再往下做(看看OD260/280的值,再电泳检查一下),免得后面
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