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二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台) 基因结

构和功能
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  • ¥200 - 2190
  • 百奥莱博
  • WE0229-HPL
  • 北京
  • 2025年07月10日
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      844

    • 英文名

      NGS Fast DNA Library Prep Set for Illumina

    • 保质期

      长期

    • 供应商

      北京百奥莱博科技有限公司

    • 保存条件

      -20℃

    特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。

    北京百奥莱博专业生产供应二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能,我公司销*(代"售")全品类的分子生物学试剂,价格优惠,欢迎广大科研工作者垂询订购。


    名称:二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)
    规格:24次|96次
    品牌:百奥莱博
    产地:国产|进口
    编号:WE0229
      本试剂盒提供了DNA文库构建所需要的酶预混体系及反应缓冲液,包含除接头与PCR引物外的所有成分,用于illumina二代测序平台DNA文库构建。和一般建库方法相比,该试剂盒操作简单、方便,极大地缩短了文库构建时间。另外,试剂盒采用高保真DNA聚合酶进行文库富集,无偏好的PCR扩增,扩大了序列的覆盖区域,可高效制备用于illumina二代测序平台的DNA文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性。

    试剂盒组成

     
    组份 24次 96次
    End Prep Enzyme Mix 48μl 192μl
    10x End Repair Reaction Buffer 200μl 800μl
    T4 DNA ligase 48μl 192μl
    T4 DNA ligase Buffer 400μl 2×800μl
    HiFidelity 2×PCRMasterMix 600μl 2×1.2ml


    试剂盒特点;
    1、末端补平,磷酸化,加A一步完成。
    2、不需纯化,直接加接头。
    3、超保真扩增,最大程度上降低了扩增偏好性。
    4、支持多种样本,且所得文库能够用于Illumina GAIIx,HiSacnSQ、HiSeq 2500/2000/1000和MiSeq sequencing等测序平台的测序。

    自备仪器、试剂和耗材
    1、磁力架:建议使用DynaMagTM-2(货号: 12321D)。
    2、DNA纯化回收试剂盒:建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(货号: WE0205)。
    3、样本接头引物试剂盒:建议使用百奥莱博二代测序多样本接头引物试剂盒 I/II(货号:WE0241/WE0240)。
    4、无水乙醇,EB(10 mM Tris-HCl, pH 8.0),去离子水(pH 在7.0-8.0之间)。
    5、反应管:建议使用低吸附的PCR管与1.5ml离心管;枪头:建议使用高质量过滤枪头防止试剂盒、文库样本污染

    实验前准备及重要注意事项/strong>:
    1、避免试剂的反复冻融,建议您首次使用试剂盒后将剩余试剂分装保存。
    2、PCR产物因操作不当极易产生污染,导致实验结果不准确,建议将PCR反应体系配制区与PCR产物纯化区隔离,并使用专门的移液器,定时对各实验区域进行清洁。

    DNA建库流程示意图:



    操作步骤

    样本要求: 5ng-1μg打断的双链DNA,溶于EB(10 mM Tris-HCl pH 8.0)或去离子水中。DNA纯度要求:OD260/OD280=1.8~2.0。

    DNA末端修复反应:
    1、向200μl PCR管中加入以下试剂:
    试剂 体积
    10×End Repair Reaction Buffer 6.5μl
    End Prep Enzyme Mix 2μl
    fragmented DNA X(5ng-1μg)
    RNase-free Water Up to 65μl


    2、用枪头将上述溶液轻轻吹吸混匀,短暂离心,使所有组分收集到管底。
    3、将上述PCR管置于PCR仪中,热盖打开, 反应程序如下:
    15 min @ 12℃
    15 min @ 37℃
    20 min @ 72℃

    Adaptor 连接:
    建议使用百奥莱博adaptor进行连接,也可选择使用NEB、illumina公司的adaptor,具体连接方法可参考各公司的产品使用说明书。以下为使用百奥莱博adaptor进行连接的操作步骤
    1、向上述已完成DNA末端修复的反应液中直接加入以下试剂:
    试剂 体积
    T4 DNA ligase buffer for illumina 14μl
    T4 DNA ligase 2μl
    Adaptor 2.5μl

    此时管中溶液总体积为83.5μl。
    注意:若起始样本量少于100ng,请将adaptor用去离子水稀释10倍至1.5μM后使用。
    2、用枪头将上述试剂吹吸混匀,短暂离心,使溶液收集到管底。
    3、20℃温浴15分钟。
    注意:若此操作使用pcr仪,请将热盖关闭。

    DNA片段的选择性回收:
      建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)进行DNA片段选择性回收。
    注意:DNA片段选择性回收是可选步骤,若起始样本量低于50ng,不建议进行DNA片段选择性回收,直接进行DNA片段的纯化。另外构建不同大小的DNA文库时,DNA片段选择性回收的磁珠使用量不同,具体磁珠用量可参照附表1(若使用除百奥莱博以外厂家的磁珠,需自行摸索最佳磁珠用量)。
      以下操作步骤中,可选择回收DNA片段长度峰值为320bp(插入片段长度200bp),反应起始体积为100μl。
    1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
    2、向连接反应液中加入16.5μl去离子水,使adaptor连接反应缓冲液体积至100μl。
    注意:若使用NEB adaptor,只需要加入13.5μl去离子水。
    3、将上述adaptor反应缓冲液转移至一新的1.5ml离心管中。
    4、加入70μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后, 室温静置5分钟。
    5、短暂离心,将离心管置于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心地将上清溶液转移至新的1.5ml离心管中,并弃去磁珠。
    注意:不要弃除上清。
    6、向上清中加入25μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温放置5分钟。
    7、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
    注意:不要弃除磁珠。
    8、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
    9、重复步骤8。
    10、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
    11、将离心管从磁力架上取下,加入28μl 10 mM Tris-HCl(pH 8.0)或去离子水(自备),涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
    12、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中;
    注意:一定不要转移磁珠,微量磁珠污染可影响后续PCR反应的正常进行。

    另一种方案: DNA片段的纯化:
    1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
    2、将adaptor连接反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
    3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后,室温静置5分钟。
    4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
    注意:不要弃除磁珠。
    5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
    6、重复步骤5。
    7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
    8、将离心管从磁力架上取下,加入28μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
    9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中。

    附表1:不同片段选择回收时磁珠建议用量
    DNA文库大小 插入片段 150bp 200bp 250bp 300-400bp 400-500bp 500-700bp
    插入片段+adaptor 270bp 320bp 400bp 400-500bp 500-600bp 600-800bp
    磁珠用量 第一次选择 85 70 55 50 45 35
    第二次选择 25 25 20 20 20 15


    PCR扩增:
    1.在PCR管中加入以下试剂并混匀。
    试剂 体积
    连接adaptor后的DNA片段 23μl
    2×HiFid elity PCR Mix 25μl
    Univesial primer 1μl
    Index primer 1μl
    总体积 50μl


    2、PCR反应条件:
    步骤 温度 时间 循环数
    预变性 98℃ 30 s  
    变性 98℃ 10 s 6-16个循环
    退火 65℃ 30 s
    延伸 72℃ 30 s
    终延伸 72℃ 5 min  

    注意:建议1μg样本起始量时PCR循环数为6个循环,50ng时10个循环,5ng时14-15个循环,PCR循环数也可根据实验需要进行优化。

    PCR产物的纯化:
    1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
    2、将PCR反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
    3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟。
    4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟)。小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
    注意:不要弃除磁珠。
    5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
    6、重复步骤5。
    7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
    8、将离心管从磁力架上取下,加入30μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
    9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将洗脱液转移至一个新的PCR管中约25μl,DNA文库在-20℃保存。

    文库质量检测

    文库浓度:
      为了得到高质量的测序结果,需要对DNA文库进行精确定量,首先推荐使用Real-time PCR方法对DNA文库进行绝对定量。此外,还可使用荧光染料法,如Qubit法或荧光染料picogreen法,此处请勿使用基于吸光度测量的定量方法。最终可使用以下近似公式换算DNA文库的摩尔浓度。
    文库平均总长度 近似转换公式 成簇反应DNA文库浓度
    200 bp 1ng/μl=7.5 nM 6-12 pM
    300 bp 1ng/μl=5.0 nM 6-12 pM
    400 bp 1ng/μl=3.8 nM 6-12 pM
    500 bp 1ng/μl=3.0 nM 6-12 pM


    文库长度分布
    制备好的DNA文库可用琼脂糖凝胶电泳或Agilent 2100 Bioanalyzer检测DNA文库中的片段长度分布范围。

    产品细节图片1
    图1:Agilent 2100 Bioanalyzer文库分析结果
    L:DNA Ladder;
    S:使用200ng人基因组DNA构建文库,磁珠进行选择回收后结果。

    文库结构
    5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT [Target Sequence] TGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACNNNNNNATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’
    NNNNNN:index, 6bases

    储存条件:-20℃
    关键词:NGS Fast DNA Library Prep Set for Illumina,WE0229,二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)


    二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能外,我公司正在打折促销以下产品:

     

    编号 名称
    WE0109 Babuddy超保真DNA聚合酶
    WE0361 生物素标记驴抗小鼠IgG(H+L)
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    WE0371 生物素化驴抗人IgG(H+L)
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    WE0198 动物组织/细胞RNA提取试剂盒(含DNase I)
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    WE0144 实时荧光定量PCR的预混体系(探针法)
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    WE0238 T4 DNA聚合酶
    WE0375 HRP标记山羊抗人IgG(H+L)
    WE0142 快速实时荧光定量PCR预混体系(低含量ROX校正染料)
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    WE0286 SDS-PAGE浓缩胶缓冲液(4×)
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    WE0153 快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(高含量ROX校正染料)
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