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426
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NGS Library Quantification Kit for Illumina
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长期
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北京百奥莱博科技有限公司
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
北京百奥莱博专业生产供应DNA文库定量试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能,我公司销*(代"售")全品类的分子生物学试剂,价格优惠,欢迎广大科研工作者垂询订购。
名称:DNA文库定量试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能
规格:1ml|5ml
编号:WE0231
英文名:NGS Library Quantification Kit for Illumina
品牌:百奥莱博
本产品是采用染料法(SYBR Green I)对NGS建库后的产物进行实时荧光定量PCR(qPCR)。试剂盒提供了qPCR过程所需的反应混合液,DNA引物混合物,标准品,试剂体系完整,操作简单方便。本试剂盒使用的是一种经化学修饰的全新高效热启动聚合酶,酶的激活需在95℃下孵育10 min。该产品特异性强,扩增效率高,能够对构建的文库浓度进行快速准确的定量。适用于无需ROX作为校正染料的荧光定量PCR仪,如Roche LightCycler 480,Roche LightCyler 96,Bio-radiCyleriQ,iQ5,CFX96。
ROX染料用于校正定量PCR仪孔与孔之间产生的荧光信号误差,一般用于ABI、Stratagene等公司的Real Time PCR扩增仪。不同仪器的激发光学系统有所不同,因此ROX染料的浓度必须与相应的荧光定量PCR仪相匹配。
不需要ROX校正的仪器: Roche LightCycler 480,Roche LightCyler 96,Bio-radiCyler iQ,iQ5,CFX96等。
需要Low ROX校正的仪器: ABI Prism7500/7500 Fast,QuantStudio® 3 System,QuantStudio® 5 System, QuantStudio® 6 Flex System,QuantStudio® 7 Flex System,ViiA 7 system, Stratagene Mx3000/Mx3005P,Corbett Rotor Gene 3000等。
需要High ROX校正的仪器: ABI Prism7000/7300/7700/7900,Eppendorf,ABI Step One/Step One Plus等。
更多有关DNA文库定量试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能的价格及使用说明等,请联*(代"系")我们的业务经理王欣女士咨询,我公司还销*(代"售")以下产品:
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DNA文库定量试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能关键词:NGS Library Quantification Kit for Illumina,Illumina平台,WE0231,DNA文库定量试剂盒(Illumina平台)
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DNA文库定量试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能关键词:NGS Library Quantification Kit for Illumina,Illumina平台,WE0231,DNA文库定量试剂盒(Illumina平台)
·DyLight594标记山羊抗人IgG(H+L)
编号:WE0358
英文名称:Goat Anti-Human IgG, DyLight 594 Conjugated
规格:100μl
本产品为DyLight 594标记的经抗原亲和纯化的山羊抗体,特异识别人IgG,最大吸收光谱为591nm,最大发射光谱为616nm。使用本产品检测灵敏度高,本底低,对其他种属IgG无明显交叉反应,常用于免疫荧光和流式细胞等标记检测。DyLight 594是近年来新开发的一种荧光素,较普通的荧光素具有较高的荧光强度和耐光性,在pH4-9的范围内均具有较高的荧光信号,被激发后产生明亮的橙红色荧光。
免疫原:人IgG
缓冲液:0.01M PBS,50%甘油,pH7.6
稳定剂:15 mg/ml BSA(不含IgG和蛋白酶)
防腐剂:0.05%叠氮*
荧光团:Amax=591; Emax=616
应用范围:对于大多数实验(1:100-800)
·Babuddy超保真DNA聚合酶
编号:WE0109
英文名称:Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase
规格:100U
Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase是一种快速、高扩增效率的高保真DNA聚合酶,具有5"-3"DNA聚合酶活性和3"-5"外切核酸酶活性。经过改造的Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase,其活性区域融合有一段聚合增强结构域,独特的结构极大提升了保真性和延伸速度。Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase的保真性是普通Taq DNA Polymerase的50倍,是普通Pfu的6倍。其延伸速率为15-30 sec/kb,成功克服了普通Pfu酶扩增效率低、扩增速度慢的缺陷,大大缩短了反应时间。本品特别适合于在基因克隆实验中扩增长片段DNA,尤其在扩增>10 kb的DNA片段时,优势更加明显,所扩增的片段最长可达20kb。
本产品中包含两种PCR缓冲液,经过优化的缓冲体系使酶的应用更加广泛,即使以复杂的基因组DNA为模板,也可以保证很高的特异性和长片段的扩增。特有的PCR增强剂DMSO使GC含量高,有二级结构和重复序列的复杂模板也能得到高效扩增。
使用本产品扩增得到的PCR产物的3"端不带有“A”碱基,可直接克隆于平末端载体中。如需进行T/A克隆,需在PCR产物末端添加“A”后进行克隆。本产品具有延伸速度快、扩增效率高、保真性强的特点。适用于基因克隆、基因定点突变、SNP等实验。
产品特点
1、高保真性:保真性是普通Taq DNA Polymerase的50倍,普通Pfu的6倍。
2、扩增速度快:其延伸速率为15-30sec/kb,成功克服了普通Pfu酶扩增效率低、扩增速度慢的缺陷。
3、特别适合于扩增长片段:扩增的片段长度可长达20kb。
产品组成:
| 组份 | 20μl×250次(100 U) |
| Babuddy DNA Polymerase,2U/μl | 50μl |
| 5×Babuddy HF Buffer | 1.5ml |
| 5×Babuddy GC Buffer | 1.5ml |
| 100% DMSO | 0.5ml |
| 50 mM MgCl2 | 1.5ml |
注意:本产品的5×Babuddy HF 和GC Buffer中含有7.5 mM*离子。
活性定义:
在74℃,30分钟内,将10 nmol脱氧核苷酸掺入到酸性不溶物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。
质量控制:
1、核酸内切酶活性检测:50μl反应体系中,10 U本酶与0.2 mM dNTPs和1μg的pUC19质粒于37℃温育4小时,<10%的pUC19质粒由超螺旋变为缺刻状态。
2、7.5 kb基因组DNA PCR扩增:50μl反应体系,1×Babuddy HF Buffer,50ng基因组DNA,1 U Babuddy DNA聚合酶,200μM dNTPs和1μM引物,30个循环PCR扩增出7.5 kb目的片段。
3、20 kb λDNA PCR扩增:50μl反应体系,5×Babuddy HF Buffer,10ng λDNA,1 UBabuddy DNA聚合酶,200μM dNTPs和1μM引物,22个循环PCR扩增出20 kb目的片段。
使用方法:
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
| 试剂 | 20μl反应体系 | 50μl反应体系 | 终浓度 |
| 5×Babuddy HF Buffer | 4μl | 10μl | 1× |
| dNTP Mix,2.5 mM each | 1.6μl | 4μl | 200μM each |
| Forward Primer,10μM | 1μl | 2.5μl | 0.5μM |
| Reverse Primer,10μM | 1μl | 2.5μl | 0.5μM |
| Template DNA | 适量 | 适量 | <250ng |
| 100% DMSO | 0.6μl | 1.5μl | 3% |
| Babuddy DNA Polymerase | 0.2 μl | 0.5μl | 1 U/50μl |
| ddH2O | up to 20μl | up to 50μl |
注意:
1)对于复杂模板或高GC含量的模板,请使用5×Babuddy GC Buffer。
2)可选步骤:对于复杂模板,如高GC含量、带有复杂二级结构的序列,可加入本产品中提供的100%DMSO或其他PCR添加物,以提高扩增效率,推荐终浓度为3%,也可按照2%的浓度递增优化。由于DMSO可以降低引物的Tm值,因此若DMSO使用浓度很高,需降低退火温度。
a.模板:在50μl PCR反应体系中,DNA模板的建议用量为低复杂度模板(如质粒DNA,λDNA等)1 pg- 10ng,高复杂模板(如基因组DNA)50-250ng。
b.引物:引物浓度请以终浓度0.2-1.0μM作为设定范围的参考,推荐终浓度为0.5μM。扩增效率不高的情况下,可提高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系。
c.*离子:*离子浓度请以终浓度1.5-3 mM作为设定范围的参考。本产品的 5×Babuddy HF Buffer和GC Buffer中已经含有7.5 mM*离子,可根据dNTP浓度、引物和模板来调整,由此优化反应体系。若引物或模板中有螯合剂(如EDTA)存在,则应提高*离子浓度。若需要对*离子浓度进行优化时,可使用本产品中提供的MgCl2按照0.5 mM浓度梯度逐步调整。
d.dNTPs:反应体系中dNTPs的浓度一般为每种200μM,使用本品时,不推荐使用dUTP和带有尿嘧啶的引物或模板。
e.Babuddy酶的浓度:Babuddy酶推荐的使用浓度为1 U/50μl 反应体系,可在0.5-2 U/50μl 反应体系之间优化酶的浓度。
2、PCR反应条件
常规三步法PCR反应:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s-3 min | |
| 变性 | 98℃ | 5-10 s | 25-35 个循环 |
| 退火 | 45-72℃ | 10-30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 2-4 kb/min | |
| 终延伸 | 72℃ | 5-10 min |
a.变性:简单模板的预变性温度为98℃,预变性时间为30 s。对于比较复杂的模板,预变性时间可延长至3分钟。
b.退火:使用本产品时,退火温度设定的基本原则是,当引物长度小于或等于20 nt时,退火温度为引物最低的Tm;当引物长度大于20 nt时,退火温度应在最低Tm的基础上以Tm+3℃退火10-30 s。当无法得到理想的扩增效率时,应以最低的Tm值逐步提升至模板延伸温度。对于Tm高的引物可以使用两步法PCR。
c.延伸:延伸时间应根据所扩增片段的长度和模板复杂程度设定,本产品中所包含的Babuddy DNA Polymerase扩增效率为2-4 kb/min,复杂性低的模板可用4 kb/min,复杂性高的基因组DNA模板,延伸时间则应为2 kb/min,对于一些cDNA模板,延伸时间可增加到1.5 kb/min。
d.循环次数:可根据扩增产物的下游应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错配机率会增加,非特异性背景严重。所以,在保证产物得率的前提下,应尽量减少循环次数。
当引物的退火温度较高时,建议使用两步法进行PCR扩增:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s-3 min | |
| 变性 | 98℃ | 5-10 s | 25-35 个循环 |
| 延伸 | 72℃ | 2-4 kb/min | |
| 终延伸 | 72℃ | 5-10 min |
储存条件:-20℃,避免反复冻融。
北京百莱博科技有限公司是基因结构和功能产品的专业生产供应销*(代"售")商,恭候您的咨询选购DNA文库定量试剂盒(Illumina平台) 基因结构和功能。
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liushuitao 比如 骨形态发生蛋白BMP、转化生长因子-β1 TGF-β1 、骨钙素 OCN 、碱性磷酸酶ALP等, 已知这些蛋白,怎么从文库中找到与其对应的RNA或DNA呢? 小弟学临床的,对这些了解较少,现写标书要用,望各位大侠赐教。找的方法步骤越详细越好,不甚感激!:) zhujoker 建议借一本生物信息学的书,比如 生物信息学与功能基因组学 = Bioinformatics
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