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- 详细信息
- 文献和实验
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479
- 英文名:
2×BaldStar Taq MasterMix(With Dye)
- 保质期:
长期
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
-20℃
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
北京百奥莱博专注于生命科学和生物技术领域,致力于为客户提供包括北京现货2×BaldStar Taq MasterMix(含染料)怎么卖在内的一系列分子生物学试剂产品,并提供一系列相关的技术服务。
名称:北京现货2×BaldStar Taq MasterMix(含染料)怎么卖
规格:5ml
英文名:2×BaldStar Taq MasterMix(With Dye)
编号:WE0112
产地:国产|进口
品牌:百奥莱博
本品是由BaldStar Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、Mg2+、dNTPs及PCR稳定剂和增强剂组成的预混体系,预混好的PCR混合液使操作更加简单快捷,可最大限度地减少人为误差和污染。该产品所含有的BaldStar Taq DNA Polymerase是一种经化学修饰的、全新高效Taq DNA Polymerase,在常温下酶的活性被完全封闭,使得该酶在低温或常温下没有活性,从而有效避免在常温条件下由引物和模板非特异性结合或引物二聚体而产生的非特异性扩增,酶的激活须在95℃下孵育10分钟。独特的缓冲体系使酶的应用更为广泛,使GC含量高、二级结构复杂以及低拷贝的模板,均能高效扩增,特有的MasterMix配方使整个反应体系稳定性更强。本产品已加入染料(蓝色),反应结束后可直接进行电泳检测,无需再使用上样缓冲液。用本品进行PCR扩增,PCR产物3"末端含有A,可直接用于T/A克隆。本产品特异性强,PCR扩增后无需胶回收去除杂带,可直接用于下游克隆或芯片杂交等实验。主要应用于常规的PCR、RT-PCR和多重PCR,特别适用于对特异性要求较高的PCR反应。
产品组成:
| 组份 | 5ml |
| 2×BaldStar MasterMix(With Dye) | 5×1ml |
| ddH2O | 5×1ml |
注意:2×BaldStar MasterMix含有BaldStar DNA Polymerase,3.4 mM MgCl2和 400μM each dNTP。
质量控制:
1、经检测无外源核酸酶活性;
2、PCR方法检测无宿主残留DNA;
3、能有效扩增人基因组中的单拷贝基因;
4、2~8℃存放三个月,无明显活性改变。
使用方法:
以下举例为以人基因组DNA为模板,扩增1 kb的片段的PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
| 试剂 | 50μl反应体系 | 终浓度 |
| 2×BaldStar MasterMix(With Dye) | 25μl | 1× |
| Forward Primer,10μM | 2μl | 0.4μM |
| Reverse Primer,10μM | 2μl | 0.4μM |
| Template DNA | <0.5μg | <0.5μg/50μl |
| ddH2O | up to 50μl |
注意:引物浓度请以终浓度0.1-1.0μM作为设定范围的参考。扩增效率不高的情况下,可提高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系。
2、PCR反应条件
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 95℃ | 10 min | |
| 变性 | 95℃ | 30 s | 30-40 个循环 |
| 退火 | 55-65℃ | 30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 60 s | |
| 终延伸 | 72℃ | 5 min |
注意:
1)一般实验中退火温度比扩增引物的熔解温度Tm低5℃,退火时间一般为30-60 s,无法得到理想的扩增效率时,适当降低退火温度;发生非特异性反应时,提高退火温度,由此优化反应条件。
2)延伸时间应根据所扩增片段大小设定,本产品中所包含的BaldStar Taq DNA Polymerase的扩增效率为1-2 kb/min。
3)可根据扩增产物的下游应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错配机率会增加,非特异性背景严重。所以在保证产物得率的前提下应尽量减少循环次数。
4)本产品须在预变性95℃,10 min条件下实现酶的活化。
储存条件:-20℃,避免反复冻融。
更多有关北京现货2×BaldStar Taq MasterMix(含染料)怎么卖的价格及使用说明等,请联*(代"系")我们的业务经理王欣女士咨询,我公司还销*(代"售")以下产品:
·二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)
编号:WE0229
英文名称:NGS Fast DNA Library Prep Set for Illumina
规格:24次|96次
本试剂盒提供了DNA文库构建所需要的酶预混体系及反应缓冲液,包含除接头与PCR引物外的所有成分,用于illumina二代测序平台DNA文库构建。和一般建库方法相比,该试剂盒操作简单、方便,极大地缩短了文库构建时间。另外,试剂盒采用高保真DNA聚合酶进行文库富集,无偏好的PCR扩增,扩大了序列的覆盖区域,可高效制备用于illumina二代测序平台的DNA文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性。
试剂盒组成:
| 组份 | 24次 | 96次 |
| End Prep Enzyme Mix | 48μl | 192μl |
| 10x End Repair Reaction Buffer | 200μl | 800μl |
| T4 DNA ligase | 48μl | 192μl |
| T4 DNA ligase Buffer | 400μl | 2×800μl |
| HiFidelity 2×PCRMasterMix | 600μl | 2×1.2ml |
试剂盒特点;
1、末端补平,磷酸化,加A一步完成。
2、不需纯化,直接加接头。
3、超保真扩增,最大程度上降低了扩增偏好性。
4、支持多种样本,且所得文库能够用于Illumina GAIIx,HiSacnSQ、HiSeq 2500/2000/1000和MiSeq sequencing等测序平台的测序。
自备仪器、试剂和耗材:
1、磁力架:建议使用DynaMagTM-2(货号: 12321D)。
2、DNA纯化回收试剂盒:建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(货号: WE0205)。
3、样本接头引物试剂盒:建议使用百奥莱博二代测序多样本接头引物试剂盒 I/II(货号:WE0241/WE0240)。
4、无水乙醇,EB(10 mM Tris-HCl, pH 8.0),去离子水(pH 在7.0-8.0之间)。
5、反应管:建议使用低吸附的PCR管与1.5ml离心管;枪头:建议使用高质量过滤枪头防止试剂盒、文库样本污染
实验前准备及重要注意事项/strong>:
1、避免试剂的反复冻融,建议您首次使用试剂盒后将剩余试剂分装保存。
2、PCR产物因操作不当极易产生污染,导致实验结果不准确,建议将PCR反应体系配制区与PCR产物纯化区隔离,并使用专门的移液器,定时对各实验区域进行清洁。
DNA建库流程示意图:
操作步骤:
样本要求: 5ng-1μg打断的双链DNA,溶于EB(10 mM Tris-HCl pH 8.0)或去离子水中。DNA纯度要求:OD260/OD280=1.8~2.0。
DNA末端修复反应:
1、向200μl PCR管中加入以下试剂:
| 试剂 | 体积 |
| 10×End Repair Reaction Buffer | 6.5μl |
| End Prep Enzyme Mix | 2μl |
| fragmented DNA | X(5ng-1μg) |
| RNase-free Water | Up to 65μl |
2、用枪头将上述溶液轻轻吹吸混匀,短暂离心,使所有组分收集到管底。
3、将上述PCR管置于PCR仪中,热盖打开, 反应程序如下:
15 min @ 12℃
15 min @ 37℃
20 min @ 72℃
Adaptor 连接:
建议使用百奥莱博adaptor进行连接,也可选择使用NEB、illumina公司的adaptor,具体连接方法可参考各公司的产品使用说明书。以下为使用百奥莱博adaptor进行连接的操作步骤:
1、向上述已完成DNA末端修复的反应液中直接加入以下试剂:
| 试剂 | 体积 |
| T4 DNA ligase buffer for illumina | 14μl |
| T4 DNA ligase | 2μl |
| Adaptor | 2.5μl |
此时管中溶液总体积为83.5μl。
注意:若起始样本量少于100ng,请将adaptor用去离子水稀释10倍至1.5μM后使用。
2、用枪头将上述试剂吹吸混匀,短暂离心,使溶液收集到管底。
3、20℃温浴15分钟。
注意:若此操作使用pcr仪,请将热盖关闭。
DNA片段的选择性回收:
建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)进行DNA片段选择性回收。
注意:DNA片段选择性回收是可选步骤,若起始样本量低于50ng,不建议进行DNA片段选择性回收,直接进行DNA片段的纯化。另外构建不同大小的DNA文库时,DNA片段选择性回收的磁珠使用量不同,具体磁珠用量可参照附表1(若使用除百奥莱博以外厂家的磁珠,需自行摸索最佳磁珠用量)。
以下操作步骤中,可选择回收DNA片段长度峰值为320bp(插入片段长度200bp),反应起始体积为100μl。
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、向连接反应液中加入16.5μl去离子水,使adaptor连接反应缓冲液体积至100μl。
注意:若使用NEB adaptor,只需要加入13.5μl去离子水。
3、将上述adaptor反应缓冲液转移至一新的1.5ml离心管中。
4、加入70μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后, 室温静置5分钟。
5、短暂离心,将离心管置于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心地将上清溶液转移至新的1.5ml离心管中,并弃去磁珠。
注意:不要弃除上清。
6、向上清中加入25μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温放置5分钟。
7、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
8、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
9、重复步骤8。
10、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
11、将离心管从磁力架上取下,加入28μl 10 mM Tris-HCl(pH 8.0)或去离子水(自备),涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
12、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中;
注意:一定不要转移磁珠,微量磁珠污染可影响后续PCR反应的正常进行。
另一种方案: DNA片段的纯化:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、将adaptor连接反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后,室温静置5分钟。
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入28μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中。
附表1:不同片段选择回收时磁珠建议用量
| DNA文库大小 | 插入片段 | 150bp | 200bp | 250bp | 300-400bp | 400-500bp | 500-700bp |
| 插入片段+adaptor | 270bp | 320bp | 400bp | 400-500bp | 500-600bp | 600-800bp | |
| 磁珠用量 | 第一次选择 | 85 | 70 | 55 | 50 | 45 | 35 |
| 第二次选择 | 25 | 25 | 20 | 20 | 20 | 15 |
PCR扩增:
1.在PCR管中加入以下试剂并混匀。
| 试剂 | 体积 |
| 连接adaptor后的DNA片段 | 23μl |
| 2×HiFid elity PCR Mix | 25μl |
| Univesial primer | 1μl |
| Index primer | 1μl |
| 总体积 | 50μl |
2、PCR反应条件:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s | |
| 变性 | 98℃ | 10 s | 6-16个循环 |
| 退火 | 65℃ | 30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 30 s | |
| 终延伸 | 72℃ | 5 min |
注意:建议1μg样本起始量时PCR循环数为6个循环,50ng时10个循环,5ng时14-15个循环,PCR循环数也可根据实验需要进行优化。
PCR产物的纯化:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、将PCR反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟。
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟)。小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入30μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将洗脱液转移至一个新的PCR管中约25μl,DNA文库在-20℃保存。
文库质量检测
文库浓度:
为了得到高质量的测序结果,需要对DNA文库进行精确定量,首先推荐使用Real-time PCR方法对DNA文库进行绝对定量。此外,还可使用荧光染料法,如Qubit法或荧光染料picogreen法,此处请勿使用基于吸光度测量的定量方法。最终可使用以下近似公式换算DNA文库的摩尔浓度。
| 文库平均总长度 | 近似转换公式 | 成簇反应DNA文库浓度 |
| 200 bp | 1ng/μl=7.5 nM | 6-12 pM |
| 300 bp | 1ng/μl=5.0 nM | 6-12 pM |
| 400 bp | 1ng/μl=3.8 nM | 6-12 pM |
| 500 bp | 1ng/μl=3.0 nM | 6-12 pM |
文库长度分布
制备好的DNA文库可用琼脂糖凝胶电泳或Agilent 2100 Bioanalyzer检测DNA文库中的片段长度分布范围。

图1:Agilent 2100 Bioanalyzer文库分析结果
L:DNA Ladder;
S:使用200ng人基因组DNA构建文库,磁珠进行选择回收后结果。
文库结构
5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT [Target Sequence] TGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACNNNNNNATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’
NNNNNN:index, 6bases
储存条件:-20℃
北京现货2×BaldStar Taq MasterMix(含染料)怎么卖关键词:2×BaldStar Taq MasterMix(With Dye),WE0112,含染料,2×BaldStar Taq MasterMix(含染料)
·通用型柱式DNA提取试剂盒
编号:WE0190
英文名称:Universal Genomic DNA Extraction Kit
规格:50次|200次
本试剂盒适合于从新鲜或冷冻的动物组织、细胞、血液、细菌等多种样品中提取高纯度总DNA。本品可纯化获得分子量最大为50 kb的DNA片段,纯化过程不需使用*酚或*仿等有毒溶剂,无需乙醇沉淀。本试剂盒采用优化的缓冲体系使裂解液中的DNA高效特异的结合到硅基质离心吸附柱上,PCR和其他酶促反应的抑制剂可通过两步洗涤步骤被有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可得到高纯度DNA。纯化得到的DNA可以直接用于酶切、PCR、Real-Time PCR、文库构建、Southern Blot、分子标记等下游实验。
试剂盒组成:
| 组份 | 50次 | 200次 |
| Buffer GTL | 15ml | 60ml |
| Buffer GL | 15ml | 50ml |
| Buffer GW1(浓缩液) | 13ml | 52ml |
| Buffer GW2(浓缩液) | 15ml | 50ml |
| Buffer GE | 15ml | 60ml |
| 蛋白酶K | 25 mg | 90 mg |
| 蛋白酶K 储存液 | 1.25ml | 5ml |
| 吸附柱DM及收集管 | 50套 | 200套 |
自备试剂:无水乙醇,Enzymatic Lysis Buffer(提取革兰氏阳性菌基因组DNA时须准备)。
Enzymatic Lysis Buffe配方:20 mM Tris,pH8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2% Triton X-100;终浓度为20 mg/ml的Lysozyme(溶菌酶)。
实验前准备及重要注意事项/strong>:
1.向蛋白酶K 中加入指定用量(1.25ml|4.5ml)的蛋白酶K 储存液使其溶解,-20℃保存。配制好的蛋白酶K 勿长时间室温放置,避免反复冻融,以免影响其活性。
2、样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。
3、如果提取次生代谢产物大量积累或细胞壁厚的细菌培养物的基因组,建议在对数生长期早期收集样品。
4、第一次使用前应按试剂瓶标签的说明在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。
5、使用前请检查Buffer GTL和Buffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将Buffer GL和Buffer GTL于56℃水浴重新溶解。
6、如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入Buffer GL前加入4μl DNase-Free的RNase A(100 mg/ml),RNase A 本试剂盒并未提供,如需要可单独向本公司订购,货号:WE0225S。
操作步骤:
一、血液及细胞样本基因组提取:
1、材料处理
a. 如果提取材料为哺乳动物抗凝血液(无核红细胞),可直接向50-200μl新鲜或冷冻的抗凝血液样品中加入Buffer GTL补足至200μl;
b. 如果提取材料为禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的抗凝血液,其红细胞为有核细胞,取5-10μl新鲜或冷冻的抗凝血液样品,加入Buffer GTL补足至200μl;
c. 贴壁培养的细胞应先处理为细胞悬液(最大提取量为5×106个细胞),2000rpm(400×g)离心5分钟,弃尽上清,加200μl GTL,振荡至样品彻底悬浮;注意:如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl浓度为100 mg/ml的RNase A溶液(货号:WE0225S),涡旋15秒,室温放置2分钟。
2、加入20μl 蛋白酶K 。
3、加入200μl Buffer GL,涡旋震荡充分混匀,56℃水浴10分钟。
4、短暂离心以去除管盖内壁的水珠。加入200μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀,短暂离心。
注意:
1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。
2)加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。一些组织在加入Buffer GL和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。
5、上一个步骤中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱DM中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12000rpm(~~13400 ×g)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤7。
8、12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。
9、将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μlBuffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
注意:
1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。
2)Buffer GE在65-70℃水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。
3)如果要提高DNA的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟;若洗脱体积小于200μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1μg,推荐用50μl Buffer GE或灭菌水洗脱。
4)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。
二、动物组织基因组提取:
1、材料处理
如果提取材料为动物组织,取25 mg(脾组织用量应少于10 mg);如果材料为鼠尾,取一段长度为0.4-0.6 cm的大鼠鼠尾或两段长度为0.4-0.6 cm的小鼠鼠尾。
a. 样本进行液氮研磨或切成小块后置于1.5ml离心管中,加入180μl Buffer GTL,将不同样品做好标记。
b. 若使用匀浆器处理样本,匀浆前向样本中加入不超过80μl Buffer GTL,匀浆后加入100μl Buffer GTL。
注意:
1)确保各组织的量不要超出推荐范围。
2)组织样本在加入Buffer GTL之前用液氮研磨或加入Buffer GTL用匀浆器匀浆处理,可以增加裂解效率。
2、加入20μl 蛋白酶K ,涡旋震荡使样品彻底混匀。56℃水浴,直至组织完全裂解,孵育过程中可每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样品分散。
注意:
1)不同组织消化时间不同,通常1-3小时即可完成,鼠尾需要消化6-8小时,必要时过夜消化,不会影响后续操作。
2)如果孵育和涡旋震荡后仍然有胶状物质,延长56℃孵育时间或再加入20μl 蛋白酶K 消化。
3)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl的浓度为100 mg/ml的RNase A溶液(货号:WE0225S),涡旋15秒,室温放置5-10分钟。
3、加入200μl Buffer GL,涡旋震荡充分混匀,70℃水浴10分钟。短暂离心后加入200μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。
注意:
1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。
2)加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。一些组织(如脾,肺)在加入Buffer GL和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。
4、短暂离心,将步骤3所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱DM中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12000rpm(~~13400×g)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
5、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤6。
7、12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。
8、将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μlBuffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
注意:
1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。
2)Buffer GE在65-70℃水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200μl BufferGE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。
3)如果要提高DNA的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟;若洗脱体积小于200μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1μg,推荐用50μl Buffer GE或灭菌水洗脱。
4)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。
三、细菌基因组提取:
1、细菌样本预处理
a. 革兰氏阴性菌
①取细菌培养物1-5ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备)中,12000rpm(~~13400 ×g)离心1分钟,尽量吸净上清。
②向沉淀中加入180μl Buffer GTL,振荡使菌体重悬。
③加入20μl 蛋白酶K ,涡旋混匀,56℃孵育,直至菌体完全裂解,孵育过程中每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样本分散。
注意:如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl浓度为100 mg/ml 的RNase A溶液(货号:WE0225S),震荡混匀,室温放置5-10分钟。
④加入200μl Buffer GL,涡旋震荡混匀。
b. 革兰氏阳性菌
①取细菌培养物1-5ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备)中,12000rpm离心1分钟,尽量吸净上清。
②加入180μl Enzymatic Lysis Buffer(自备)使菌体重悬。
③37℃孵育30分钟。
④加入20μl 蛋白酶K 涡旋震荡,充分混匀。加入200μl Buffer GL,涡旋震荡混匀。56℃孵育30分钟。
注意:
1)如果需要,95℃孵育15分钟可以使病原体失活,但是95℃孵育会造成一些DNA的降解。
2)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl浓度为100 mg/ml 的RNase A溶液(货号:WE0225S),震荡混匀,室温放置5-10分钟。
2、加入200μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。
注意:加入无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。
3、将步骤2所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已装入收集管的吸附柱DM中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
4、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
5、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤5。
6、12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。
7、将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μlBuffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
注意:
1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。
2)Buffer GE在65-70℃水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。
3)如果要提高DNA的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟;若洗脱体积小于200μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1μg,推荐用50μl Buffer GE或灭菌水洗脱。
4)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。
储存条件:室温(15~30℃)。
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Real-time qPCR 手册——手把手教你从菜鸟到高手
NaOH 中浸泡 10 分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。 当然,这些也不是绝对的要求。如果是操作熟练。完全可以用初次开封的离心管和枪头,新过滤的超纯水,进行 RNA 的提取。 2. Mix 配制 一般来讲,进行 real-time qPCR MasterMix 都是 2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于 real-time qPCR 灵敏度高,所以每个样品至少要做3 个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于 Ct 相差较多或者 SD 太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应
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