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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
855
- 英文名:
Fungal RNA Column large-scale extraction kit
- 保质期:
一年
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
常温运输,4℃
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
百奥莱博专业生产供应柱式真菌RNA大量提取试剂盒厂家,我公司销*(代"售")全品类的分子生物学试剂,价格优惠,欢迎广大科研工作者垂询订购。
名称:柱式真菌RNA大量提取试剂盒厂家
品牌:百奥莱博
英文名:Fungal RNA Column large-scale extraction kit
编号:BTN80904
规格:5次
本试剂盒是在本公司柱式真菌RNA提取试剂盒(BTN80804)的大提升级产品,跟柱式真菌RNA提取试剂盒相比,它具有下列特点:
1.样品处理量大,最多可以处理50mL液体培养物或2g菌丝体。
2. 操作简单快捷,整个过程只需要约30分钟。
3. RNA 纯度高,OD260/280一般都在2.0左右,可直接用于RT-PCR、Norther杂交、microarray hybridization、cDNA 合成等。
4. RNA产量高,一般在20-70μg/mL 酵母培养物(约2.0 ×107个细胞)。
5. 非酶细胞破裂法,适用于各种形态的真菌和各个种属的真菌,包括Candida albican、Saccharomyces cerevisiae、Schizosaccharomyces pombe和Pichia pastoris等。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 |
| 溶液A | 50ml |
| 溶液B | 50ml |
| 溶液C | 100ml |
| 溶液D | 30ml |
| 大提离心吸附柱 | 5套 |
| 通用洗柱液 | 100ml |
| RNA洗脱液 | 10ml |
| 说明书 | 1份 |
储存条件:常温运输,4℃保存,有效期一年。
使用方法:
1. 将50mL液体真菌培养物在塑料离心管中5000-7,000rpm 4℃离心1分钟,并弃尽液体培养基(可以分多次离心)。如果是菌丝体,则直接称取2 克放入50mL塑料离心管中。
2. 加入10mL溶液A并充分吹打混匀。注意:溶液A存放时容易产生沉淀,如果有沉淀,用前请置于65℃融化并充分摇晃均匀。
3. 加入10mL溶液B,剧烈振荡30秒。
4. 65℃保温5分钟。
5. 5000-7,000rpm 4℃离心3~5分钟,转移上清到一自备的、干净的50mL塑料离心管中。
6.在上清液中加入2mL自备的*仿,充分振荡30秒混匀。
7. 4℃ 5000-7,000rpm离心3~5分钟,转移上清液到一自备的、干净的50mL塑料离心管中。
8. 加入相当于上清液(体积越10mL左右)3倍体积的溶液C和1倍体积的溶液D,充分混匀。
9. 将混合液分多次转移到离心吸附柱中,每次转移后需要室温放置2-3分钟以让RNA跟吸附膜充分结合,然后5000-7,000rpm室温离心30-60秒,弃收集管中的穿透液,然后再加入后一批混合液,重复操作,直到混合液全部挂柱。
10. 第一次洗涤:将10mL 通用洗柱液加到离心吸附柱中,室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
11. 第二次洗涤:一次洗涤一般足够去除杂质,但如果样品OD260/280 比值不高,可以再用10mL 通用洗柱液重复上步洗涤一次。
12.室温离心空柱子(带收集管)半分钟。此步十分重要,否则残留的通用洗柱液会影响RNA的使用。
13. 将离心吸附柱转移到一自备的RNase-free 50mL塑料离心管中,加入1mL RNA 洗脱液。
14.室温离心半分钟,离心管中溶液即为RNA样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
15. RNA 完整性的电泳检测:
注意:普通DNA上样液不含变性剂,更没经过去RNase处理,所以最好不要用于RNA电泳。
16. RNA产量和纯度产率测定:
将5-10μL RNA 溶于TE缓冲液中(pH7.5-8.2 之间)检测其在OD260的光吸收。通过光吸收可以得出RNA浓度(1 OD260的RNA=40μg/mL),进而计算出RNA的产量(浓度×体积)和产率(RNA产量/细菌用量)。注意不要将RNA 稀释在DEPC 水中检测OD260和OD280,否则光吸收比在TE中测得的低10%-15%;也不要稀释过度,使OD读数在仪器的有效范围之外,这样得到的OD 比值没有意义。
疑难解答:
Q:上样孔里的红色荧光物一定是污染的基因组DNA 吗?
A:不是。用TAE或TBE电泳液和非变性胶电泳RNA时容易产生此现象,百奥莱博初步研究发现大部分红色荧光物是变性不充分的单链RNA 通过碱基互补或通过硼*(代"酸")络合(如果使用TBE作电泳液的话)形成的复合物,加RNase处理后,这些红色荧光物一般会消失。为避免此现象,建议最好使用甲醛变性胶电泳。如果需要使用非变性胶,也必须在上样前使RNA变性。使用百奥莱博优化的上样/变性/染色三用溶液RNAload可以使RNA在非变性胶上电泳时也有较好分辨率。使用非变性胶时,可以使用TAE或超快电泳液SuperBuffer-2,最好不要使用TBE缓冲液,因为TBE中的硼*(代"酸")能与RNA的多羟基形成复合物,RNA 很难形成锐利的条带。
Q:如何确认和去处除污染的基因组DNA?
A:如果怀疑有DNA污染,可以用RNase处理RNA样品,然后再电泳。如果上样孔里的红色荧光物不消失,则表示是基因组DNA污染。进一步确认可以使用PCR扩增法。去除污染的DNA可以使用5分钟柱式DNA 清除剂、非酶的DNA 去除剂DNA Scavenger或RNase-free DNase,由于RNase-free DNase一般都有残留的RNase污染,所以必须严格按照厂家提供的使用说明书进行操作。
关于柱式真菌RNA大量提取试剂盒厂家的更详细说明,请致电我公司咨询,我们将以最饱满的热情为您提供解答,此外,我公司专业供应下列产品:
·酿酒酵母NMY51感受态细胞
编号:BTN140388
英文名称:E.coli NMY51 Rosetta Competent Cell
规格:10×100μL
NMY51感受态细胞是膜系统酵母双杂宿主菌,本产品经PGADT7质粒检测转化效率为104cfu/μg DNA 。
基因型:MAT a his 3Δ200 trp 1-901 leu 2-3,112 ade 2 LYS2::(lex Aop)4-HIS 3 ura 3::(lex Aop)8-lac Z ade 2::(lex Aop)8-ADE 2 GAL 4
储存条件:干冰运输,-80℃保存,有效期6个月。
·PCR法DNA探针地高*(代"辛")标记试剂盒
编号:BTN90604C
英文名称:PCR DNA Labeling Kit(Digoxin)
规格:5次
PCR标记的原理是用带标记的dNTP进行PCR,最后得到的PCR产物将带有标记,可以直接用于杂交试验。其原理示意图如下:
产品特点:
1.一站式,本试剂盒提供经过优化的试剂,不需要用户自己摸索。
2. 足够10次50μl体系的常规PCR(用于制备标记反应的模板和设置对照反应)和5次50μl体系的标记反应。
3.一次标记可以得到μg级的双链DNA探针或约700ng的单链DNA探针,足够多次杂交实验用。
4. 既可用于制备双链探针,也可以用于单链探针。
5. 90604A需自备含标记核苷酸的dNTP,90604B和90604C分别含生物素和地高*(代"辛")标记的底物。自备的标记包括fluorescein-dUTP、hydroxycoumarin-dUTP、resorufin-dUTP和aminoallyl-dUTP等。
6. 本产品得到的探针参入率一般为4-5%(每100个核苷酸中有4-5个将带有非同位素标记),有效降低了空间阻碍,检测效果最佳。
7.可以用于Southern和Northern Blot、原位杂交、菌落和斑点印迹杂交等分析。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 |
| 2×标记专用PCR Mix | 500μl |
| dNTP,2mM each | 50μl |
| 含Biotin-11-dUTP的dNTP | 25μL(仅B有) |
| 含DIG-11-dUTP的dNTP | 25μL(仅C有) |
| 超纯水 | 1ml |
| 说明书 | 1份 |
注:标记专用PCR Mix不含dNTP。
储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一:准备工作
1. 按常规的方法设计PCR引物,使探针长度在400-800bp之间。过短则标记参入少,探针杂交信号强度减弱;过长则非特异杂交增加,背景变强。
2. 根据PCR引物优化PCR条件。
3. 由于标记的dNTP比较珍贵,所以本试剂盒不推荐以基因组DNA或其他复杂DNA为模板直接进行PCR标记,而是建议采取下述的两步法标记来提高成功率,即先制备非标记PCR产物,再以之为模板制备标记的PCR产物。
二:非标记PCR产物的制备
4. 设置50μL PCR的反应体系:
| 成份 | 用量 |
| 2×标记专用PCR Mix | 25μl |
| dNTP,2mM each | 5μl |
| 自备的探针引物一(10pmol/μL) | 1μL(10μM) |
| 自备的探针引物二(10pmol/μL) | 1μL(10μM) |
| 自备的模板DNA | 1μg基因组DNA或1ng质粒DNA |
| 超纯水 | 补到50μL |
5. 按已经优化的PCR参数进行PCR。
6.电泳检测和胶回收所需的PCR产物,并定量。用10 pmol引物一般能得到1μg左右的PCR产物(具体取决于PCR产物的长度)。注意:最好采取胶回收而不是PCR回收以避免残留引物干扰后续的标记PCR。
三:标记PCR反应(最好做一个不加标记的对照用于定量)
说明:在设置下面反应时,如果加一种引物,就得到单链标记的PCR产物;如果加两种引物,则得到双链标记的PCR产物。由于双链PCR探针在杂交前虽然要变性成单链后使用,但杂交时变性的双链彼此还会复性,这种复性会与探针-靶DNA杂交反应相竞争,降低杂交效率,因此强烈推荐使用单链标记的DNA探针。
| 成份 | 样品 | 对照 |
| 2×标记专用PCR Mix | 25μl | 25μl |
| 含Biotin-11-dUTP的dNTP或 含DIG-11-dUTP的dNTP或 自备的含其他标记dUTP的dNTP |
5μl | 不加 |
| dNTP,2mM | 不加 | 5μl |
| 双链标记:探针引物一和引物二 单链标记:探针引物一或引物二 |
每种50 pmol 一种50 pmol |
每种50 pmol 一种50 pmol |
| 上步胶纯化所得PCR产物 (单链标记可用100ng) |
10 ng | 10 ng |
| 超纯水 | 补到50μL | 补到50μL |
注意:本试剂盒提供的dNTP混合物中,标记底物与非标记底物的比例已经进过优化,如果自备标记dUTP,其与dTTP的最佳比例需要优化,标记不同,比例不同。对DIG-11-dUTP,最佳比例1:3;对BrdUTP,最佳比例为1:1。
7. 按第5步的PCR参数进行标记PCR,但需要进行下列修改:一是循环数增加到35-55个循环。由于模板为纯化后的PCR产物,探针对扩增长度完整性要求不高(长度不均的探针由于能形成网络结构,效果反而更好),所以可以增加循环数;二是延伸时间增加15秒,因为标记dUTP参入到DNA的速度比常规的dTTP慢;三是降低复性温度5-7℃,因为标记核苷酸参入到DNA后,新模板的Tm值将降低。
8. 标记探针的定量:取标记反应和对照反应的产物1-5μl,在琼脂糖凝胶上跟浓度已知的DNA marker一起电泳,并判断探针的浓度。由于标记反应的PCR产物中额外带有非同位素的配体(生物素,地高*(代"辛")等)、因此其泳动速度将慢于非标记PCR产物(但同位素标记不能用此法)。
注意:如果扩增的是单链DNA探针,其结合EB的能力远低于双链DNA(EB是嵌合到双链碱基对之间的,而单链DNA没有碱基对,只有一些局部区域折叠形成的有限双链区,因此能结合的EB很少),因此EB染色的强弱不能准确反应DNA的浓度,可以采用银染定量(跟marker比较)。一般100ng模板按上述条件经过单链PCR扩增可得到700ng左右探针。
9. 剩余的PCR标记产物可以不经过纯化,直接加入(对单链PCR探针)杂或加热变性并急冷后加入(对双链PCR探针)到杂交液中使用。如果暂时不用请放-20℃长期保存。如果需要纯化,请使用乙酸铵/乙醇沉淀法。
柱式真菌RNA大量提取试剂盒厂家关键词:Fungal RNA Column large-scale extraction kit,柱式真菌RNA大量提取试剂盒,BTN80904
·碱性胶电泳液
编号:BTN100816
英文名称:10×Alkaline Gel Buffer
规格:250mL
本品为10×的琼脂糖碱性电泳液,专门用于琼脂糖碱性变性电泳,后者主要用于分析抗核酸酶S1的DNA-RNA杂交分子DNA的大小、分析cDNA链大小、检测反转录酶合成第一条和第二条cDNA链的大小、检测分子克隆中酶的缺口活性、标定DNA缺口平移核素标记实验中试剂的用量等。
储存条件:常温运输及保存、有效期一年。
·柱式土壤RNA提取试剂盒
编号:BTN90705
英文名称:Soil microbe RNA Column extraction kit
规格:50次
本品为10×的琼脂糖碱性电泳液,专门用于琼脂糖碱性变性电泳,后者主要用于分析抗核酸酶S1的DNA-RNA杂交分子DNA的大小、分析cDNA链大小、检测反转录酶合成第一条和第二条cDNA链的大小、检测分子克隆中酶的缺口活性、标定DNA缺口平移核素标记实验中试剂的用量等。
储存条件:常温运输及保存、有效期一年。
·Real-Time PCR稀释液
编号:BTN130816
英文名称:Diluent for Real-Time PCR
规格:1mL
本制品是制作标准曲线时用于梯度稀释DNA或RNA标准品的稀释液。模板DNA或模板RNA如果用水或TE稀释时,由于受Microtube的吸附作用等原因的影响,往往不能准确地进行稀释,导致实验结果精度降低。使用本制品稀释DNA或RNA样品时,即使稀释至低浓度也能够准确稀释,容易在宽广范围内获得准确定量的标准曲线。
储存条件:低温运输和-20℃保存,有效期一年。
注意事项:为避免样品间的交叉污染,最好适量分装或小份后保存。
·1M Tris-HCl(pH7.5)(DNA级)
编号:BTN101205
英文名称:Diluent for Real-Time PCR
规格:250mL
本制品是制作标准曲线时用于梯度稀释DNA或RNA标准品的稀释液。模板DNA或模板RNA如果用水或TE稀释时,由于受Microtube的吸附作用等原因的影响,往往不能准确地进行稀释,导致实验结果精度降低。使用本制品稀释DNA或RNA样品时,即使稀释至低浓度也能够准确稀释,容易在宽广范围内获得准确定量的标准曲线。
储存条件:低温运输和-20℃保存,有效期一年。
注意事项:为避免样品间的交叉污染,最好适量分装或小份后保存。
·EDTA溶液
编号:BTN131181
英文名称:EDTA Solution
规格:1mL
本产品是0.2M EDTA溶液,专用于终止各种需要*离子的酶反应。
储存条件:低温运输和-20℃保存、有效期一年。
·AFLP试剂盒(EcoRI-MseI)
编号:BTN100903
英文名称:AFLP Kit(EcoRI-MseI)
规格:1600次
本产品在传统AFLP-PCR的基础上经过精心优化而开发。AFLP(amplified fragment length polymorphism)原理是一种结合RFLP和PCR技术特点的、迄今为止最有效分子标记分型技术,其原理如下:
产品特点:
1.一站式,足够50次酶切-连接反应、50次预扩反应和1600次AFLP PCR(PCR按30μL体系计算),但不包括DNA 纯化和带型分析试剂(如PAGE电泳试剂和银染试剂)。
2.本系列产品提供EcoRI-MseI 组合,适用于GC含量在50%以上的基因组。对GC含量在50%以下的基因组,需从本公司采购AFLP(EcoRI-TaqI)组合。
3.各种参数都经过优化,一次PCR所得AFLP片段数一般在10-100之间,可重复性好,误差小于0.6%。
4.本产品适用于基因组在500 Mb-6000Mb的材料(如动物和植物),对于基因组在50-500Mb的材料(如细菌和真菌)或50Mb以下的材料(如质粒,cosmid,BAC,YAC和PAC等),需要分别另购专门的+1型预扩引物混合液和+3型EcoRI引物(8 种)AFLP引物对。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 |
| 酶切-连接Buffer,10× | 100μl |
| EcoRI-MseI酶混合液 | 100μl |
| EcoRI-MseI 接头混合物 | 1ml |
| T4 DNA连接酶(1U/μL) | 50μl |
| +0型预扩引物混合液 | 750μl |
| PCR Mix 3.0 | 9ml×3 |
| 对照DNA(50ng/μL) | 20μl |
| +2型EcoRI引物(8条) | 1ml每种 |
| +3型MseI引物(8条) | 1ml每种 |
| TE溶液,pH8.0 | 10ml |
| 超纯水 | 10ml |
| 说明书 | 1份 |
+2型EcoRI引物和+3型MseI引物最后碱基的序列
| 引物名称 | 8条引物3´最后碱基 |
| +2型EcoRI引物 | -AA,-AT,-AG,-AC,-TA,-TT,-TG,-TC |
| +3型MseI引物 | -CAA,-CAC,-CAG,-CAT,-CTA,-CTC,-CTG,-CTT |
储存条件:低温运输、-20℃保存,有效期一年。
自备试剂:Southern级DNA纯化试剂,尿素-PAGE电泳套装,银染试剂盒。
使用方法:
一、DNA提取(本试剂盒不提供相关试剂)
用户需要自备50-500ng Southern级别的基因组DNA,用前最好预实验以确保DNA能够被EcoRI和MseI内切酶彻底切开。
二、限制性酶切和接头连接反应(本试剂盒足够50次本反应)
1.在0.2mL离心管中加入设置20μL的限制性内切酶酶切体系:
| 成分 | 用量 |
| 酶切-连接Buffer,10× | 2μl |
| 样品DNA | 50ng(对小基因组材料) 500ng(对大基因组材料) 如果用对照,则用5μL |
| EcoR I-Mse I酶混合液 | 2μl |
| 超纯水 | 加水到20μl |
2.轻柔混匀并短暂离心后,37℃保温2小时酶切(若PCR 仪器不带热盖,则必须加50μL自备石蜡油,否则水分会蒸发影响反应。下同),70℃保温15分钟灭活内切酶。
3.在上述酶反应体系中加入20μl EcoRI-MseI 接头混合物和1μl T4 DNA连接酶,轻柔混匀并短暂离心后,20℃保温2小时让接头跟DNA片段相连。
4.在一个离心管中加入10μl上步得到的连接反应液和90μL TE缓冲液,pH8,充分混匀,得到酶切-连接反应10倍稀释液,未用完的酶切-连接反应原液(30μL)可放-20℃保存。
三、预扩增(本试剂盒足够50次本反应)
5.在0.2mL离心管中设置30μl的PCR 体系:
| 成分 | 体积 |
| 酶切-连接反应液10倍稀释液 | 5μl |
| +0型预扩引物混合液 | 10μl |
| PCR Mix 3.0 | 15μl |
6.离心数秒,按下列参数进行PCR预扩增:
| 温度 | 时间 | |
| PCR(20次) | 94℃ | 30s |
| 56℃ | 60s | |
| 72℃ | 60s |
7.可以取10μl PCR产物在1.5%琼脂糖胶上电泳检测,产物为100-1500bp 模糊条带。
8.将剩下的预扩反应液用TE 稀释50倍,直接用于下步反应或放-20℃保存待用。
四、选择性PCR扩增(本试剂盒足够至少1600次本反应)
9.在0.2mL PCR 管中,加入下列成分(如果用户已经知道哪个一种或几种引物组合适合自己的材料,则直接使用;如果不知道,则需要预先测试所有64 种组合,设置64个PCR反应),下面只是一种组合:
| 成分 | 体积 |
| 预扩反应液50倍稀释液 | 5μl |
| +2型EcoR I引物之一(八种之一) | 5μl |
| +3型Mse I引物之一(八种之一) | 5μl |
| PCR Mix 3.0 | 15μl |
10.轻柔混匀后离心数秒,按下列参数进行PCR:
| 温度 | 时间 | |
| PCR(13次) | 94℃ | 30s |
| 65℃ | 30s(每次循环递减0.7℃) | |
| 72℃ | 60s | |
| PCR(13次) | 94℃ | 30s |
| 55℃ | 30s | |
| 72℃ | 60s | |
| 延伸 | 72℃ | 5min |
五、尿素-PAGE电泳和银染(需另购试剂并按相关说明书进行)
柱式真菌RNA大量提取试剂盒厂家关键词:Fungal RNA Column large-scale extraction kit,柱式真菌RNA大量提取试剂盒,BTN80904
·三合一RNA上样液(B型,6X)
编号:BTN3130B
英文名称:RNA Loading Buffer
规格:1.5mL
本品是集RNA变性RNA、上样、RNA染色三种功能于一体的即用型溶液。
产品特点:
1.能提高RNA上样速度,免去繁琐的准备步骤,减少污染。
2.其含有的RNase抑制剂能抑制RNA样品中残留RNase的活性,保证电泳过程中RNA的完整性。
3.所含甘油和染料(仅BTN3130A含EB染料),便于直接上样和UV观察RNA电泳条带,免去染色和脱色过程。
4.本产品与DNA/RNA两用快速电泳液SuperBuffer-2完全兼容。
产品组成:
| 成分 | 规格 |
| 三合一RNA上样液 | 1.5ml |
| 说明书 | 1份 |
本产品为红色液体,含红色的EB(*化乙锭),有致癌性,避免用手直接接触。
另一红色电泳示踪剂的电泳速度相当于50nt的RNA。
储存条件:常温运输,4℃(短期)或-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
1. 按1:1-1:3的比例将RNA样品与RNA上样液混合(如5μL RNA+15μL RNA上样液)。
2. 65-85℃水浴保温10分钟,。
3. 冰浴5分钟后即可直接上样电泳。
注:本产品含EB,所以琼脂糖凝胶中可以不必再加EB。本产品与甲醛琼脂糖变性凝胶或用DNA/RNA两用快速电泳液SuperBuffer-2配制的非变性琼脂糖变性凝胶兼容。
4.电泳完毕后可直接将凝胶放在紫外灯下观察结果,RNA 条带成红色。
疑难解答:
Q:为何RNA样品在甲醛变性胶中的电泳效果比普通非变性胶差?
A:这是因为在非变性胶中,即使内部有切口的RNA分子(实际已经是两条RNA分子)也会通过形成发夹结构而跟完整的分子等速电泳,而在变性胶中,完整RNA分子和内部有切口的RNA分子将以不同的速度泳动,所以变性胶看起来效果不好是反应了真实情况,非变性胶看起来好只是一种假象。要求严格的实验(如CDNA文库构建)最好还是使用甲醛变性胶判断RNA的质量好坏。
北京百莱博科技有限公司专业生产供应销*(代"售")生物试剂、化学试剂、抗原抗体、血清血浆、Elisa试剂盒,更多试剂产品需求,欢迎来电咨询选购柱式真菌RNA大量提取试剂盒厂家。
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