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- 详细信息
- 技术资料
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894
- 英文名:
NGS Fast DNA Library Prep Set for Ion Torrent
- 保质期:
长期
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
-20℃
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
北京百奥莱博主要从事生物试剂的生产和销*(代"售"),产品线涵盖北京现货二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)优惠在内的分子生物学试剂产品,还包括PCR及荧光定量PCR、核酸提取试剂盒类、样本核酸保护试剂、核酸提取、克隆与转化、蛋白纯化、蛋白检测、免疫组化、细胞凋亡与抗体等。
名称:北京现货二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)优惠
英文名:NGS Fast DNA Library Prep Set for Ion Torrent
编号:WE0228
规格:24次|96次
品牌:百奥莱博
本试剂盒提供了构建DNA文库需要的酶预混体系及反应缓冲液,包含除接头以外的所有成分,制备的文库可用于Ion torrent PGM、Ion Proton二代测序平台的测序。和常规建库方法相比,该试剂盒将多个步骤进行了合并,省略了多个纯化步骤,因此显著降低了起始模板DNA的最少需求量,缩短了文库构建时间。另外,试剂盒采用高保真DNA聚合酶进行文库富集,无偏好的PCR扩增,扩大了序列的覆盖区域,可高效的制备用于Ion torrent二代测序平台的DNA文库。
试剂盒组成:
| 组份 | 24次 | 96次 |
| 10×End Repair Buffer | 200μl | 800μl |
| End Repair Enzyme Mix | 48μl | 192μl |
| Ligation and Nick Repair Buffer | 400μl | 2×800μl |
| T4 DNA Ligase | 48μl | 192μl |
| Bst DNA Polymerase | 48μl | 192μl |
| 2×HiFidelity PCR Mix | 600μl | 2×1.2ml |
| 10×Primer Mix(5μM each) | 150μl | 600μl |
自备仪器、试剂和耗材:
1、磁力架:建议使用Life公司磁力架。
2、DNA纯化回收试剂盒:建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)。
3、样本接头引物试剂盒。
4、无水乙醇,EB(10 mM Tris-HCl, pH 8.0),去离子水(pH 在7.0-8.0之间)。
5、反应管:建议使用低吸附的PCR管与1.5ml离心管;枪头:建议使用高质量过滤枪头防止试剂盒、文库样本污染。
实验前准备及重要注意事项/strong>:
1、避免试剂盒中Buffer的反复冻融,建议首次使用时将Buffer进行分装保存。酶在使用完应尽快放回-20℃保存,
2、PCR产物因操作不当极易产生污染,导致实验结果不准确,建议将PCR反应体系配制区与PCR产物纯化区隔离,并使用专门的移液器,定期对各实验区域进行清洁。
DNA建库流程示意图:

起始材料:5ng-1μg打断的双链DNA,溶于EB(10 mM Tris-HCl pH 8.0)或去离子水中,DNA纯度要求:OD260/OD 280=1.8-2.0。
DNA末端修复反应:
1、向200μl PCR管中加入以下成分,用枪头将上述溶液轻轻混匀,瞬时离心使所有组分收集到管底。
| 试剂 | 体积 |
| 10×End Repair Buffer | 6μl |
| End Repair Enzyme Mix | 2μl |
| fragmented DNA | X(10ng~1μg) |
| RNase-Free Water | Up to 60μl |
2、将管子置入PCR仪中,热盖打开,反应程序如下:
20 min @ 25℃
10 min @ 70℃
Hold on 4℃
Adaptor 连接:
建议使用百奥莱博adaptor进行连接,也可选择使用Life、Kapa公司的adaptor,具体连接方法可参考各公司的产品使用说明书。以下为使用百奥莱博adaptor进行连接的操作步骤:
1、向上述反应液中直接加入以下试剂, 用枪头将上述试剂混匀,短暂离心,使溶液收集到管底。
| 试剂 | 体积 |
| Ligation and Nick Repair Buffer | 10μl |
| T4 DNA Ligase | 2μl |
| Bst DNA Polymerase | 2μl |
| Adaptor A | 7μl |
| Adaptor P1 | 7μl |
| RNase-Free Water | 12μl |
| Total volume | 40μl |
注意:建议Adaptor的加入量与DNA片段的摩尔比为10:1-20:1,具体Adaptor的使用浓度请参照下表。如果DNA量为10-100ng, adaptor建议使用浓度为1μM(小于260 bp)或 0.5μM(300-400 bp)。
| 插入DNA 量/反应 | 不同大小DNA 建议Adaptor 使用浓度 | |||
| 130 bp | 260 bp | 320 bp | 410 bp | |
| 1μg | 10μM | 10μM | 5μM | 5μM |
| 500ng | 5μM | 5μM | 2.5μM | 2.5μM |
| 100ng | 1μM | 1μM | 0.5μM | 0.5μM |
2、反应步骤:
15 min @ 25℃
5 min @ 65℃
Hold on 4℃
Adaptor连接DNA片段的选择性回收:
构建不同大小的DNA文库时,需进行DNA片段的选择性回收。若起始样本量低于50ng,不建议进行DNA片段选择性回收。可参考另一种方案,直接进行DNA片段的纯化。建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)进行DNA片段选择性回收。若使用除百奥莱博以外厂家的磁珠,需自行摸索最佳磁珠用量。以下操作步骤采用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒,可选择回收DNA片段长度范围为310-370bp(读长为200bp),反应起始体积为100μl。
1、涡旋振荡MCPure 20秒,使其彻底混匀为均一溶液;
2、将100μl adaptor连接反应缓冲液转移至一新的1.5ml离心管中;
3、加入60μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟;
4、短暂离心,将离心管置于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心地将上清溶液转移至新的1.5ml离心管中,并弃去磁珠;
注意:不要弃除上清。
5、向上清中加入20μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温放置5分钟;
6、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心移取上清并弃除,期间避免接触结合目标DNA的磁珠;
注意:不要弃除磁珠。
7、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清;
8、重复步骤7;为彻底移除残留液体,可将离心管短暂离心后,再次移除残留液体。
9、保持离心管固定于磁力架上,室温静置5分钟,使磁珠在空气中干燥;
10、将离心管从磁力架上取下,加入25μl 10 mMTris-HCl(pH 8.0)或去离子水(自备),涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟;
11、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将25μl洗脱液转移至一个新的PCR管中;
另一种方案:Adaptor连接DNA片段的全部回收:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、将adaptor连接反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后,室温静置5分钟。
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5。为彻底移除残留液体,可将离心管短暂离心后,再次移除残留液体。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置5分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入25μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将25μl洗脱液转移至一个新的PCR管中。
PCR富集:
1、在PCR管中加入以下试剂并混匀:
| 试剂 | 体积 |
| 连接adaptor后的DNA片段 | 20μl |
| 2×HiFidelity PCR Mix | 25μl |
| 10×Primer Mix(5μM each) | 5μl |
| 总体积 | 50μl |
2、PCR反应条件:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30s | |
| 变性 | 98℃ | 10s | 4~12个循环 |
| 退火 | 65℃ | 30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 30 s | |
| 终延伸 | 72℃ | 5min |
注:样本量为1ug时,4-6个cycles,样本量100ng时6-8个cycles,样本量为10ng时10-12个cycles。PCR循环数可根据实验进行优化。
PCR产物的纯化:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液;
2、将PCR反应液转移至一新的1.5ml离心管中;
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟;
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟)。小心移取上清并弃除,期间避免接触结合目标DNA的磁珠;
注意:不要弃除磁珠
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5;为彻底移除残留液体,可将离心管短暂离心后,再次移除残留液体。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置5分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入25μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟,短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将25μl洗脱液转移至一个新的PCR管中,DNA文库在-20℃保存。
储存条件:-20℃
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·HRP标记驴抗兔IgG(H+L)
编号:WE0366
英文名称:Donkey Anti- Rabbit IgG,Peroxidase Conjugated
规格:100μl
本产品为过氧化物酶标记的经亲和纯化的驴抗体,特异识别兔IgG,检测灵敏度高,本底低,可用于Western Blot、ELISA 和免疫组化检测。酶标记抗体,是一类广泛用于免疫学、分子生物学及临床医学各个分支学科中的免疫化学制剂,具有特异、敏感和安全的特点。
免疫原:兔IgG
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应用范围:
WB ECL发光检测(1:10000-200000)
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·RNA酶抑制剂
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本品为从人胎盘中提取得到,分子量约50 KDa的广谱型RNase抑制剂。RNasin能够特异地与RNase以非共价键结合形成复合体从而使RNase失活,而不抑制RNase H、S1核酸酶、SP6、T7或T3 RNA 聚合酶、AMV或M-MLV反转录酶、Taq DNA聚合酶、RNaseT1等酶的活性,不影响后续的反转录及翻译过程。广泛的应用于RNA方面的研究,如RT-PCR,cDNA合成,mRNA的保护,体外转录和体外翻译,制备RNase-Free的抗体,原位杂交和mRNA定位等。
储存缓冲液:HEPES-KOH(pH7.6)20 mM, KCl 50 mM, DTT 8mM , Glycerol 50%。
活性定义:1个活性单位(U)指抑制50%5ng RNAse A中的苷2",3"-环磷酸发生水解所用的酶量。
主要用途:cDNA合成、体外翻译、体外转录、RNA 扩增、RNA纯化和储存。
纯度:
1、300 U的Rnasin和1μg的λ DNA-Hind Ⅲ分解物在37℃下反应1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
2、300 U的 Rnasin 和1μg的超螺旋pBR322 DNA在37℃下反应1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
3、100 U的Rnasin 和1μg的16 S,23S rRNA在37℃下反应1小时,RNA的电泳谱带不发生变化。
4、SDS-PAGE:在分子量50 KDa处是单一带。
注意事项:
1、本产品避免反复冻融,长期储存请与-70℃存放。
2、建议使用终浓度为1 U/μl。
储存条件:-20℃
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