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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
-20℃
- 保质期:
长期
- 英文名:
NGS Fast DNA Library Prep Set for Illumina
- 库存:
282
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
北京百奥莱博专注于生命科学和生物技术领域,致力于为客户提供包括北京现货二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)厂家在内的一系列分子生物学试剂产品,并提供一系列相关的技术服务。
名称:二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)
英文名:NGS Fast DNA Library Prep Set for Illumina
规格:24次|96次
品牌:百奥莱博
编号:WE0229
本试剂盒提供了DNA文库构建所需要的酶预混体系及反应缓冲液,包含除接头与PCR引物外的所有成分,用于illumina二代测序平台DNA文库构建。和一般建库方法相比,该试剂盒操作简单、方便,极大地缩短了文库构建时间。另外,试剂盒采用高保真DNA聚合酶进行文库富集,无偏好的PCR扩增,扩大了序列的覆盖区域,可高效制备用于illumina二代测序平台的DNA文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性。
试剂盒组成:
| 组份 | 24次 | 96次 |
| End Prep Enzyme Mix | 48μl | 192μl |
| 10x End Repair Reaction Buffer | 200μl | 800μl |
| T4 DNA ligase | 48μl | 192μl |
| T4 DNA ligase Buffer | 400μl | 2×800μl |
| HiFidelity 2×PCRMasterMix | 600μl | 2×1.2ml |
试剂盒特点;
1、末端补平,磷酸化,加A一步完成。
2、不需纯化,直接加接头。
3、超保真扩增,最大程度上降低了扩增偏好性。
4、支持多种样本,且所得文库能够用于Illumina GAIIx,HiSacnSQ、HiSeq 2500/2000/1000和MiSeq sequencing等测序平台的测序。
自备仪器、试剂和耗材:
1、磁力架:建议使用DynaMagTM-2(货号: 12321D)。
2、DNA纯化回收试剂盒:建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(货号: WE0205)。
3、样本接头引物试剂盒:建议使用百奥莱博二代测序多样本接头引物试剂盒 I/II(货号:WE0241/WE0240)。
4、无水乙醇,EB(10 mM Tris-HCl, pH 8.0),去离子水(pH 在7.0-8.0之间)。
5、反应管:建议使用低吸附的PCR管与1.5ml离心管;枪头:建议使用高质量过滤枪头防止试剂盒、文库样本污染
实验前准备及重要注意事项/strong>:
1、避免试剂的反复冻融,建议您首次使用试剂盒后将剩余试剂分装保存。
2、PCR产物因操作不当极易产生污染,导致实验结果不准确,建议将PCR反应体系配制区与PCR产物纯化区隔离,并使用专门的移液器,定时对各实验区域进行清洁。
DNA建库流程示意图:
操作步骤:
样本要求: 5ng-1μg打断的双链DNA,溶于EB(10 mM Tris-HCl pH 8.0)或去离子水中。DNA纯度要求:OD260/OD280=1.8~2.0。
DNA末端修复反应:
1、向200μl PCR管中加入以下试剂:
| 试剂 | 体积 |
| 10×End Repair Reaction Buffer | 6.5μl |
| End Prep Enzyme Mix | 2μl |
| fragmented DNA | X(5ng-1μg) |
| RNase-free Water | Up to 65μl |
2、用枪头将上述溶液轻轻吹吸混匀,短暂离心,使所有组分收集到管底。
3、将上述PCR管置于PCR仪中,热盖打开, 反应程序如下:
15 min @ 12℃
15 min @ 37℃
20 min @ 72℃
Adaptor 连接:
建议使用百奥莱博adaptor进行连接,也可选择使用NEB、illumina公司的adaptor,具体连接方法可参考各公司的产品使用说明书。以下为使用百奥莱博adaptor进行连接的操作步骤:
1、向上述已完成DNA末端修复的反应液中直接加入以下试剂:
| 试剂 | 体积 |
| T4 DNA ligase buffer for illumina | 14μl |
| T4 DNA ligase | 2μl |
| Adaptor | 2.5μl |
此时管中溶液总体积为83.5μl。
注意:若起始样本量少于100ng,请将adaptor用去离子水稀释10倍至1.5μM后使用。
2、用枪头将上述试剂吹吸混匀,短暂离心,使溶液收集到管底。
3、20℃温浴15分钟。
注意:若此操作使用pcr仪,请将热盖关闭。
DNA片段的选择性回收:
建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)进行DNA片段选择性回收。
注意:DNA片段选择性回收是可选步骤,若起始样本量低于50ng,不建议进行DNA片段选择性回收,直接进行DNA片段的纯化。另外构建不同大小的DNA文库时,DNA片段选择性回收的磁珠使用量不同,具体磁珠用量可参照附表1(若使用除百奥莱博以外厂家的磁珠,需自行摸索最佳磁珠用量)。
以下操作步骤中,可选择回收DNA片段长度峰值为320bp(插入片段长度200bp),反应起始体积为100μl。
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、向连接反应液中加入16.5μl去离子水,使adaptor连接反应缓冲液体积至100μl。
注意:若使用NEB adaptor,只需要加入13.5μl去离子水。
3、将上述adaptor反应缓冲液转移至一新的1.5ml离心管中。
4、加入70μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后, 室温静置5分钟。
5、短暂离心,将离心管置于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心地将上清溶液转移至新的1.5ml离心管中,并弃去磁珠。
注意:不要弃除上清。
6、向上清中加入25μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温放置5分钟。
7、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
8、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
9、重复步骤8。
10、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
11、将离心管从磁力架上取下,加入28μl 10 mM Tris-HCl(pH 8.0)或去离子水(自备),涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
12、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中;
注意:一定不要转移磁珠,微量磁珠污染可影响后续PCR反应的正常进行。
另一种方案: DNA片段的纯化:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、将adaptor连接反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后,室温静置5分钟。
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入28μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中。
附表1:不同片段选择回收时磁珠建议用量
| DNA文库大小 | 插入片段 | 150bp | 200bp | 250bp | 300-400bp | 400-500bp | 500-700bp |
| 插入片段+adaptor | 270bp | 320bp | 400bp | 400-500bp | 500-600bp | 600-800bp | |
| 磁珠用量 | 第一次选择 | 85 | 70 | 55 | 50 | 45 | 35 |
| 第二次选择 | 25 | 25 | 20 | 20 | 20 | 15 |
PCR扩增:
1.在PCR管中加入以下试剂并混匀。
| 试剂 | 体积 |
| 连接adaptor后的DNA片段 | 23μl |
| 2×HiFid elity PCR Mix | 25μl |
| Univesial primer | 1μl |
| Index primer | 1μl |
| 总体积 | 50μl |
2、PCR反应条件:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s | |
| 变性 | 98℃ | 10 s | 6-16个循环 |
| 退火 | 65℃ | 30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 30 s | |
| 终延伸 | 72℃ | 5 min |
注意:建议1μg样本起始量时PCR循环数为6个循环,50ng时10个循环,5ng时14-15个循环,PCR循环数也可根据实验需要进行优化。
PCR产物的纯化:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、将PCR反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟。
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟)。小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入30μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将洗脱液转移至一个新的PCR管中约25μl,DNA文库在-20℃保存。
文库质量检测
文库浓度:
为了得到高质量的测序结果,需要对DNA文库进行精确定量,首先推荐使用Real-time PCR方法对DNA文库进行绝对定量。此外,还可使用荧光染料法,如Qubit法或荧光染料picogreen法,此处请勿使用基于吸光度测量的定量方法。最终可使用以下近似公式换算DNA文库的摩尔浓度。
| 文库平均总长度 | 近似转换公式 | 成簇反应DNA文库浓度 |
| 200 bp | 1ng/μl=7.5 nM | 6-12 pM |
| 300 bp | 1ng/μl=5.0 nM | 6-12 pM |
| 400 bp | 1ng/μl=3.8 nM | 6-12 pM |
| 500 bp | 1ng/μl=3.0 nM | 6-12 pM |
文库长度分布
制备好的DNA文库可用琼脂糖凝胶电泳或Agilent 2100 Bioanalyzer检测DNA文库中的片段长度分布范围。

图1:Agilent 2100 Bioanalyzer文库分析结果
L:DNA Ladder;
S:使用200ng人基因组DNA构建文库,磁珠进行选择回收后结果。
文库结构
5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT [Target Sequence] TGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACNNNNNNATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’
NNNNNN:index, 6bases
储存条件:-20℃
关键词:二代测序DNA快速建库试剂盒,NGS Fast DNA Library Prep Set for Illumina,WE0229,二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)
北京现货二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)厂家正在火爆热销,除此之外,为您推荐下别热销产品:
| 编号 | 名称 |
| WE0323 | DAB显色试剂盒(WB IHC) |
| WE0343 | 抗V5标签单克隆抗体 |
| WE0249 | TA快速连接试剂盒(pUC-T) |
| WE0297 | 一步法快速WB试剂盒(鼠源一抗) |
| WE0314 | 免疫组化试剂盒(兔源一抗) |
| WE0203 | DNA/RNA提取试剂盒 |
| WE0326 | 细胞周期与凋亡检测试剂盒 |
| WE0161 | 寡聚核苷酸Oligo(dT)15 |
| WE0285 | 0.5 M Tris-HCl缓冲液(pH6.8) |
| WE0158 | miRNA荧光定量检测试剂盒 |
| WE0271 | Protein A琼脂糖凝胶 |
| WE0270 | Protein G琼脂糖凝胶 |
| WE0141 | 快速实时荧光定量PCR预混体系 |
| WE0233 | DNA文库定量试剂盒(Ion Torrent平台) |
| WE0276 | BCA蛋白定量试剂盒 |
| WE0100 | PCR Mix(含染料)(滴瓶装) |
| WE0331 | 抗GST标签琼脂糖介质 |
| WE0111 | BaldStar Taq DNA Polymerase |
| WE0318 | 柠檬酸缓冲液(IHC抗原修复液,100×) |
| WE0167 | 高效无内毒素质粒大量提取试剂盒 |
| WE0200 | 植物RNA提取试剂盒(含DNase I) |
| WE0197 | 血液RNA提取试剂盒(含DNase I) |
| WE0280 | 蛋白分子量Marker |
| WE0186 | 鼠尾基因组DNA提取试剂盒 |
| WE0204 | 磁珠法游离DNA提取试剂盒 |
| WE0333 | HRP标记抗c-Myc标签单克隆抗体 |
| WE0375 | HRP标记山羊抗人IgG(H+L) |
| WE0345 | 抗GST标签多克隆抗体 |
| WE0108 | 2×Pfu MasterMix(含染料) |
| WE0118 | 结核分枝杆菌基因分型试剂盒(VNTR-9) |
| WE0255 | DNATrans转染试剂 |
| WE0376 | HRP标记山羊抗人IgM(Fc5μ) |
| WE0307 | 低背景ECL化学发光检测试剂盒 |
| WE0398 | 游离DNA样本保存管(10ml) |
| WE0361 | 生物素标记驴抗小鼠IgG(H+L) |
| WE0316 | 通用型免疫组化试剂盒(鼠兔源一抗) |
| WE0192 | 超纯RNA提取试剂盒 |
| WE0278 | 蛋白快速染色液 |
| WE0247 | TA快速连接试剂盒(pUC-T Simple)(含载体,连接酶) |
风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
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