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- 库存:
853
- 英文名:
Animal mitochondrial DNA column extraction kit(Sequencing Grade)
- 保质期:
长期
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
2~8℃
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
百奥莱博专业生产供应北京现货柱式动物线粒体DNA提取试剂盒(测序级)哪里卖,我公司销*(代"售")全品类的分子生物学试剂,价格优惠,欢迎广大科研工作者垂询订购。
名称:北京现货柱式动物线粒体DNA提取试剂盒(测序级)哪里卖
规格:15次
品牌:百奥莱博
英文名:Animal mitochondrial DNA column extraction kit(Sequencing Grade)
编号:BTN120501
产地:国产|进口
本试剂盒就是基于先纯化动物细胞线粒体、再从中柱式法纯化其DNA的两步法试剂盒。
试剂盒特点:
1. 即开即用,用户不需要自己配制各种溶液,优化各种条件。
2. 两步法,先纯化线粒体,再柱式法纯化其中的DNA,有粗提(mtDNA纯化前不用DNase处理线粒体)和精提(mtDNA纯化前用DNase处理线粒体)两套操作方案,适合于各种要求不同的后续实验。
3. 本产品一次可以处理约107×108个培养细胞,10mg培养细胞(相当于5瓶150 mm培养细胞)可以纯化到到0.2-0.5mg线粒体。
4. 本产品适用于各种动物悬浮培养细胞和贴壁培养细胞,不建议用于动物实体组织。
5. 提供线粒体染液,可以在操作中随时监测纯化过程中线粒体的完整性。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 | 备注 |
| 溶液A | 225ml | 配制匀浆液 |
| 蔗糖 | 25.4g | 配制匀浆液 |
| 詹纳斯染色液 | 1ml | 染色线粒体 |
| 溶液B | 0.5ml | 配制核酸酶反应液 |
| DNase A干粉 | 1mg | 酶切细胞核DNA |
| Benzonase(1U/μL) | 100μl | 酶切细胞核DNA |
| 溶液C | 10ml | 纯化mtDNA |
| 溶液D | 5ml | 纯化mtDNA |
| 溶液E | 20ml | 纯化mtDNA |
| 离心吸附柱 | 15套 | 纯化mtDNA |
| 通用洗柱液 | 15ml | 纯化mtDNA |
| DNA洗脱液 | 10ml | 纯化mtDNA |
| 人TPMT VNTR | 上游引物 | GCT CCG CCC TGC CCA TTT |
| 下游引物 | GCC TCC GCC ACC AAT GAC | |
| 人线粒体HV2区 | 上游引物 | GGT CTA TCA CCC TAT TAA CCA C |
| 下游引物 | CTG TTA AAA GTG CAT ACC GCC A | |
| 说明书 | 1份 | |
储存条件:常温运输和保存,保存期限一年。
使用方法:
注意:线粒体膜对温度高度敏感,所以整个操作必须在冰上或冷室进行,所要用到的溶液和离心管都必须预先冷却,否则线粒体容易破裂。
一:线粒体粗提
1. 称25.4g蔗糖到225mL溶液A中,盖上盖子后充分摇晃3~5分钟溶解即得250mL溶液A工作液,放冰上预冷待用。未用完的溶液A工作液需要-20℃保存,否则会长菌。
2. 如果是单层细胞,先用20mL PBS缓冲液洗涤107×108个培养的单层细胞,共洗涤2次。然后用塑料刮匙刮下细胞,重悬在20mL PBS缓冲液中。如果是悬浮细胞,则1000g 4℃离心10分钟收集107×108个细胞,再用20mL PBS缓冲液洗涤2次,最后将细胞重悬在20mL PBS缓冲液中。
3. 用平甩转子(swinging-bucket rotor)离心机1000 g 4℃离心10分钟,吸弃上清,保留细胞沉淀。
4. 加入5倍体积(以细胞沉淀的体积为基数)的溶液A工作液,轻柔重悬细胞。
5. 如果是成纤维细胞,由于其难于裂解,可将细胞重悬液在-80℃放置20-30分钟后再化冻,然后进入下步操作。如果不是,则直接进入下步操作。
6. 将细胞重悬液体转移到预冷的Dounce玻璃匀浆器中(工作体积为10-15mL,间隙为0.12 mm,最好是玻璃材质,否则线粒体产率会降低)匀浆适当次数。细胞株不同,其最适匀浆次数不同,一般需要40次-60次左右。匀浆是线粒体纯化最关键的步骤,故匀浆前最好先通过预实验确定最适匀浆次数,方法是每匀浆5-10次后,取2-3μl匀浆液到载玻片上,然后在相差显微镜下观察,完整细胞数量降低到20-50%以下为佳。
7. 用平甩转子离心机4℃ 1000 g离心10分钟。沉淀含残留完整细胞、细胞碎片和细胞核,上清液含线粒体。
8.转移上清液到离心管中,冰上放置待用。如有必要,可在显微镜下检测上清液中线粒体的完整性。具体做法是先滴一滴上清液到载玻片上,再滴入50μl詹纳斯染液染色20分钟,油镜下观察,蓝绿色颗粒状物即为线粒体。
9. 用固定角度转子(fixed-angle rotor)离心机4℃ 10000 g离心10分钟,弃上清,所得棕黑色沉淀即为粗提线粒体沉淀。
10. 用5mL溶液A工作液洗涤2次得线粒体粗提液(即重悬后,4℃ 10000 g离心10分钟,弃上清)。
11. 如果后续实验是提取mtDNA用于PCR或Southern杂交,则直接进入第3部分mtDNA提取,也可以放-80℃长期保存待用。
12. 如果后续实验是提取mtDNA用于高通量测序,则必须彻底降解掉其中的细胞核DNA污染。匀浆过程中一个破裂的细胞核释放出的DNA相当于上百万个线粒体的DNA量之合,所以无论如何小心,粗提线粒体中必有大量的细胞核DNA污染,如果不将其清除,高通量测得的序列将绝大部分来于核DNA而非mtDNA。
二:线粒体粗提液中细胞核DNA的去除及鉴定
13. 将线粒体重悬于0.3mL溶液A工作液中,取10μl作为未处理对照。
14. 加入6μl Benzonase(1U/μL)溶液和30μl DNase A溶液(配法:将0.5mL溶液B加到装有1mg DNase A干粉的离心管中得到2mg/mL溶液,未用完的部分需要分装后放-20℃保存)。
15. 37℃保温一段时间酶切细胞核DNA。注意:最好先预实验,每隔一段时间取10μl样品,灭活其中的DNase后作为模板用PCR扩增1-4个自选的VNTR位点和1-2个mtDNA基因(如vis或COII基因),检测不到VNTR基因而能检测到mtDNA基因的处理时间为最佳。可从本公司另购细胞核基因和线粒体基因专一性引物。
16. 加入10μl自备的0.5M EDTA溶液(pH8.0)以终止酶反应。显微镜下检查线粒体完整性(见上节第8步)。
17. 用固定角度转子离心机4℃10000 g离心10分钟,弃上清。
18. 用1mL的溶液A工作液洗涤沉淀(即重悬后,4℃ 10000 g离心10分钟,弃上清。此为一次洗涤。)2次得到线粒体沉淀。
三:线粒体DNA提取
19.在不超过100μl的线粒体沉淀中加入600μl预热的溶液C到沉淀中,充分吹打均匀。
20. 再加入150μl(可称150-160mg)预热的溶液D到离心管中,颠倒数次混匀。此时溶液中可能有白色丝状悬浮物产生。
21. 65℃放置3~5分钟。
22. 加入200μl自备*仿,震荡混匀10-30秒,此时溶液将呈乳白色。
23. 12000~15000g室温离心2分钟。此时上清液将变得透明,中间层有白膜。小心转移上清液到一个新的1.5mL塑料离心管中,避免触及中间的白膜。
24. 加入1.5倍体积的溶液E,颠倒混匀后全部转移到离心吸附柱中,室温放置至少2分钟。
25. 12000rpm室温离心1分钟,弃收集管中的穿透液。
26. 通用洗柱液洗涤2次(将0.5mL加入离心柱中,12000rpm室温离心1分钟,弃穿透液,此为洗涤一次,再重复一次)。
27. 空甩半分钟去除残留液体,将离心吸附柱转移到新的1.5mL离心管中。
28. 加30-50μl DNA 洗脱液,室温放置3~5分钟。
29. 12000rpm室温离心1分钟即得纯化的mtDNA溶液。
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·3´RACE试剂盒
编号:BTN101104
英文名称:3´-RACE Kit
规格:10次
研究真核基因的最基础的工作之一就是确定其转录终止位点,目前最通用的方法是3´-RACE法,RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)是Frohman发明的、通过PCR快速克隆cDNA末端的技术,它在不建立cDNA文库的前提下,利用已知cDNA序列设计引物,通过往两端延伸和扩增获得其3´-端序列。本试剂盒就是根据3´-RACE原理而开发。RACE的原理如下图:
产品特点:
1. 即开即用,客户不需要单独准备各种材料。
2.反应条件经过精心优化,包括使用无RNase H活性的MMLV和优化的引物。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 |
| MMLV逆转录酶-RI混合物(RNase H-,200U/μL) | 10μl |
| MMLV Buffer(含dNTP) | 50μl |
| PCR MagicMix 2.0(含酶和染料) | 1.5ml |
| 3´-RACE引物A(10μM) | 10μl |
| 3´-RACE引物B(10μM) | 100μl |
| 3´-RACE引物C(10μM) | 100μl |
| RNase-Free水 | 1ml |
| 说明书 | 1份 |
储存条件:低温运输、-20℃保存、有效期一年。
使用方法:
一、利用含Oligo(dT)的3´-RACE引物A进行逆转录
注意:MMLV酶使用前必须短暂离心,因为它含50%甘油,及其粘稠,否则将取不到所需体积。
1.在一个PCR管中,加入以下组分:
| 成分 | 用量 |
| Poly(A)RNA(或总RNA) | 0.2-2μg(5μg) |
| 3´-RACE引物A(10μM) | 1μL |
| MMLV Buffer(含dNTP溶液) | 5μL |
| RNase-Free水 | 补至19μL |
| 合计 | 19μL |
注意:如果可能,最好使用Poly(A)RNA作为模板。
65℃保温5分钟,展开RNA的二级结构,立即冰浴待用。
2. 再在上述PCR管中加入1μl MMLV逆转录酶-RI混合物(200U/μL)。
3. 37℃保温60分钟,42℃保温30分钟进行逆转录反应;然后50℃保温10分钟终止反应。
4. 加入0.5mL RNase-free水稀释上步得到的cDNA,冰浴待用。长期放置需要放-20℃保存。
二、利用基因专一性引物A和3´RACE引物B进行第一轮PCR
5. 用不同量的RT反应液(稀释后的cDNA)设置PCR(样品组最好设置用量梯度,单位:μL)。
| 成分 | 梯度1 | 梯度2 | 梯度3 | 梯度4 |
| 稀释后的cDNA | 1 | 5 | 10 | 15 |
| 基因专一性引物A(10μM) | 2.5 | 2.5 | 2.5 | 2.5 |
| 3´RACE引物B(10μM) | 2.5 | 2.5 | 2.5 | 2.5 |
| 98℃ 5分变性RNA-cDNA杂交链,短暂离心后再加入下列成分 | ||||
| PCR MagicMix 2.0 | 25 | 25 | 25 | 25 |
| RNase-free水 | 19 | 15 | 10 | 5 |
| 合计 | 50 | 50 | 50 | 50 |
6. 按下列条件进行PCR(注:应根据实际情况选择适当的退火温度)。
第1次循环:52-60℃ 2分,72℃ 40分(此步的目地是合成第二链的cDNA,复性温度需要根据自备基因专一性引物A的Tm值进行优化,一般可以从55℃开始)。
第2-30次循环:94℃ 1分钟,52-60℃ 1分,72℃ 3分(此步为PCR扩增,复性温度需要根据自备基因专一性引物A的Tm值进行优化,一般可以从55℃开始)。
最后延伸:72℃ 15分
7. 取5μl的PCR反应液进行琼脂糖凝胶电泳以确认PCR扩增产物。若得到目的扩增产物需要用于后续实验,请于-20℃保存;若没有得到目的扩增产物,可按下列步骤进行巢式PCR反应。
三、利用基因专一性引物B和3´RACE引物C进行巢式PCR反应
8. 将上轮PCR产物(4管)均用水稀释稀释20倍,然后每管均用巢式PCR进行扩增。巢式PCR反应设置如下:
| 成分 | 用量 |
| PCR MagicMix 2.0 | 25μl |
| 上步得到的PCR反应液(稀释20倍后) | 1μl |
| 基因专一性引物B(10μm) | 2.5μl |
| 3´RACE引物C(10μm) | 2.5μl |
| 超纯水 | 补至50μL |
9. PCR反应。按下列条件进行PCR:
第1-30次循环:94℃ 1分钟,52-60℃ 1分,72℃ 3分(复性温度需要根据自备基因专一性引物B的Tm值进行优化,一般可以从55℃开始)最后延伸:72℃ 15分
10.电泳检测。然后根据实验结果进行DNA测序或TA克隆。
注意事项:
1. 如果两轮PCR得到的非特异产物多,可以在RT反应是继续降低3´-RACE引物A的用量。
2.自备的基因专一性引物的GC含量最好跟3´-RACE引物B和引物C的一致,后者长度均为18nt,均含11个G(或C),7个A(或T)。
北京现货柱式动物线粒体DNA提取试剂盒(测序级)哪里卖关键词:Animal mitochondrial DNA column extraction kit(Seq,柱式动物线粒体DNA提取试剂盒,柱式动物线粒体DNA提取试剂盒(测序级),BTN120501
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