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WE0228型二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torr

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  • ¥130 - 1530
  • 百奥莱博
  • 北京
  • WE0228-EUG
  • 2025年07月09日
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      长期

    • 英文名

      NGS Fast DNA Library Prep Set for Ion Torrent

    • 库存

      321

    • 供应商

      北京百奥莱博科技有限公司

    特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。

    北京百奥莱博主要从事生物试剂的生产和销*(代"售"),产品线涵盖WE0228型二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)销*(代"售")在内的分子生物学试剂产品,还包括PCR及荧光定量PCR、核酸提取试剂盒类、样本核酸保护试剂、核酸提取、克隆与转化、蛋白纯化、蛋白检测、免疫组化、细胞凋亡与抗体等。


    名称:WE0228型二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)销*(代"售")
    品牌:百奥莱博
    产地:国产|进口
    编号:WE0228
    规格:24次|96次
      本试剂盒提供了构建DNA文库需要的酶预混体系及反应缓冲液,包含除接头以外的所有成分,制备的文库可用于Ion torrent PGM、Ion Proton二代测序平台的测序。和常规建库方法相比,该试剂盒将多个步骤进行了合并,省略了多个纯化步骤,因此显著降低了起始模板DNA的最少需求量,缩短了文库构建时间。另外,试剂盒采用高保真DNA聚合酶进行文库富集,无偏好的PCR扩增,扩大了序列的覆盖区域,可高效的制备用于Ion torrent二代测序平台的DNA文库。

    试剂盒组成

     
    组份 24次 96次
    10×End Repair Buffer 200μl 800μl
    End Repair Enzyme Mix 48μl 192μl
    Ligation and Nick Repair Buffer 400μl 2×800μl
    T4 DNA Ligase 48μl 192μl
    Bst DNA Polymerase 48μl 192μl
    2×HiFidelity PCR Mix 600μl 2×1.2ml
    10×Primer Mix(5μM each) 150μl 600μl


    自备仪器、试剂和耗材
    1、磁力架:建议使用Life公司磁力架。
    2、DNA纯化回收试剂盒:建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)。
    3、样本接头引物试剂盒。
    4、无水乙醇,EB(10 mM Tris-HCl, pH 8.0),去离子水(pH 在7.0-8.0之间)。
    5、反应管:建议使用低吸附的PCR管与1.5ml离心管;枪头:建议使用高质量过滤枪头防止试剂盒、文库样本污染。

    实验前准备及重要注意事项/strong>:
    1、避免试剂盒中Buffer的反复冻融,建议首次使用时将Buffer进行分装保存。酶在使用完应尽快放回-20℃保存,
    2、PCR产物因操作不当极易产生污染,导致实验结果不准确,建议将PCR反应体系配制区与PCR产物纯化区隔离,并使用专门的移液器,定期对各实验区域进行清洁。

    DNA建库流程示意图:
    产品细节图片1
    起始材料:5ng-1μg打断的双链DNA,溶于EB(10 mM Tris-HCl pH 8.0)或去离子水中,DNA纯度要求:OD260/OD 280=1.8-2.0。

    DNA末端修复反应:
    1、向200μl PCR管中加入以下成分,用枪头将上述溶液轻轻混匀,瞬时离心使所有组分收集到管底。
    试剂 体积
    10×End Repair Buffer 6μl
    End Repair Enzyme Mix 2μl
    fragmented DNA X(10ng~1μg)
    RNase-Free Water Up to 60μl


    2、将管子置入PCR仪中,热盖打开,反应程序如下:
    20 min @ 25℃
    10 min @ 70℃
    Hold on 4℃

    Adaptor 连接:
    建议使用百奥莱博adaptor进行连接,也可选择使用Life、Kapa公司的adaptor,具体连接方法可参考各公司的产品使用说明书。以下为使用百奥莱博adaptor进行连接的操作步骤
    1、向上述反应液中直接加入以下试剂, 用枪头将上述试剂混匀,短暂离心,使溶液收集到管底。
    试剂 体积
    Ligation and Nick Repair Buffer 10μl
    T4 DNA Ligase 2μl
    Bst DNA Polymerase 2μl
    Adaptor A 7μl
    Adaptor P1 7μl
    RNase-Free Water 12μl
    Total volume 40μl


    注意:建议Adaptor的加入量与DNA片段的摩尔比为10:1-20:1,具体Adaptor的使用浓度请参照下表。如果DNA量为10-100ng, adaptor建议使用浓度为1μM(小于260 bp)或 0.5μM(300-400 bp)。
    插入DNA 量/反应 不同大小DNA 建议Adaptor 使用浓度
    130 bp 260 bp 320 bp 410 bp
    1μg 10μM 10μM 5μM 5μM
    500ng 5μM 5μM 2.5μM 2.5μM
    100ng 1μM 1μM 0.5μM 0.5μM


    2、反应步骤:
    15 min @ 25℃
    5 min @ 65℃
    Hold on 4℃

    Adaptor连接DNA片段的选择性回收:
      构建不同大小的DNA文库时,需进行DNA片段的选择性回收。若起始样本量低于50ng,不建议进行DNA片段选择性回收。可参考另一种方案,直接进行DNA片段的纯化。建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)进行DNA片段选择性回收。若使用除百奥莱博以外厂家的磁珠,需自行摸索最佳磁珠用量。以下操作步骤采用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒,可选择回收DNA片段长度范围为310-370bp(读长为200bp),反应起始体积为100μl。
    1、涡旋振荡MCPure 20秒,使其彻底混匀为均一溶液;
    2、将100μl adaptor连接反应缓冲液转移至一新的1.5ml离心管中;
    3、加入60μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟;
    4、短暂离心,将离心管置于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心地将上清溶液转移至新的1.5ml离心管中,并弃去磁珠;
    注意:不要弃除上清。
    5、向上清中加入20μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温放置5分钟;
    6、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心移取上清并弃除,期间避免接触结合目标DNA的磁珠;
    注意:不要弃除磁珠。
    7、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清;
    8、重复步骤7;为彻底移除残留液体,可将离心管短暂离心后,再次移除残留液体。
    9、保持离心管固定于磁力架上,室温静置5分钟,使磁珠在空气中干燥;
    10、将离心管从磁力架上取下,加入25μl 10 mMTris-HCl(pH 8.0)或去离子水(自备),涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟;
    11、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将25μl洗脱液转移至一个新的PCR管中;

    另一种方案:Adaptor连接DNA片段的全部回收:
    1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
    2、将adaptor连接反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
    3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后,室温静置5分钟。
    4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
    注意:不要弃除磁珠。
    5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
    6、重复步骤5。为彻底移除残留液体,可将离心管短暂离心后,再次移除残留液体。
    7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置5分钟,使磁珠在空气中干燥。
    8、将离心管从磁力架上取下,加入25μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
    9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将25μl洗脱液转移至一个新的PCR管中。

    PCR富集:
    1、在PCR管中加入以下试剂并混匀:
    试剂 体积
    连接adaptor后的DNA片段 20μl
    2×HiFidelity PCR Mix 25μl
    10×Primer Mix(5μM each) 5μl
    总体积 50μl


    2、PCR反应条件:
    步骤 温度 时间 循环数
    预变性 98℃ 30s  
    变性 98℃ 10s 4~12个循环
    退火 65℃ 30 s
    延伸 72℃ 30 s
    终延伸 72℃ 5min  

    注:样本量为1ug时,4-6个cycles,样本量100ng时6-8个cycles,样本量为10ng时10-12个cycles。PCR循环数可根据实验进行优化。

    PCR产物的纯化:
    1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液;
    2、将PCR反应液转移至一新的1.5ml离心管中;
    3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟;
    4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟)。小心移取上清并弃除,期间避免接触结合目标DNA的磁珠;
    注意:不要弃除磁珠
    5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
    6、重复步骤5;为彻底移除残留液体,可将离心管短暂离心后,再次移除残留液体。
    7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置5分钟,使磁珠在空气中干燥。
    8、将离心管从磁力架上取下,加入25μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟,短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将25μl洗脱液转移至一个新的PCR管中,DNA文库在-20℃保存。

    储存条件:-20℃

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    WE0228型二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)销*(代"售")关键词:WE0228,NGS Fast DNA Library Prep Set for Ion Torrent,二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)


    ·一步法快速WB试剂盒(兔源一抗)
    编号:WE0298
    英文名称:One Step Western Kit HRP(Rabbit)
    规格:50次
      本试剂盒是百奥莱博最新研发的Western Blot检测试剂盒,能够在1小时左右得到高质量的Western Blot结果,且操作简便、检测灵敏度高、背景低、不需再加入二抗、系统稳定性强。常规的Western Blot间接法检测过程(封闭、一抗结合和二抗结合)需要较长的时间,实验流程复杂且需要多步条件优化。胶上的蛋白转移到载体膜上后,使用试剂盒中的封闭液孵育5 min,再用抗体反应液处理后的一抗孵育载体膜,经洗涤三次(每次5 min)后,即可进行发光或显色检测。本试剂盒针对目的蛋白一抗为兔来源的实验系统使用。

     
    组份 50次
    Blocking
    Buffer
    500ml
    Antibody Pretreat Solution(HRP/Rabbit) 5×1ml
    Dilution Buffer 500ml
    Wash Buffer(10×) 500ml


    注意事项
    1、客户需自己准备兔来源的一抗。
    2、使用Blocking Buffer封闭液、Antibody Pretreat Solution(HRP/Rabbit)抗体反应液(兔)、Wash Buffer(10×)漂洗液之前请充分混匀。
    3、漂洗液如在2~8℃保存时出现沉淀,请恢复到室温,把沉淀溶解后正常使用,1×漂洗液可在室温保存一个月。
    4、建议转膜完成后用丽春红等试剂染色,并把膜上多余部分剪去以增加试剂的使用效率。
    5、一抗和抗体反应液HRP(兔)需要通过预实验来确定最佳的稀释用量。
    6、抗体反应液HRP(兔)、抗体稀释液和抗体用量可根据膜的大小按比例放大或减少。
    7、加入一抗的抗体稀释液可以回收重复使用一次。特异性及亲和力低的抗体不建议重复使用。回收后抗体如在1-2天内使用放置在2~8℃,长期保存请在-20℃冻存,避免多次反复冻融。
    8、如果存在较高背景的情况,请调整抗体的用量,并增加洗膜次数。
    9、试剂盒内所有试剂请于2~8℃保存,避免冻融。

    操作步骤
    本产品适用于转膜完成后的封闭及抗体孵育步骤,以5cm×8cm 膜为例:

    1、漂洗液准备:取10ml Wash Buffer(10×)用蒸馏水稀释至100ml,即为1×Wash Buffer,待用。每次洗膜用8-10ml。
    2、封闭:转膜完成后,将膜浸没到10ml Blocking Buffer中,室温封闭5分钟。
    3、漂洗:倒掉封闭液,加入8-10ml 1×Wash Buffer,于摇床上用较大速度漂洗1分钟。
    4、洗膜的同时可准备抗体孵育液:取Antibody Pretreat Solution(HRP/Rabbit)100μl到离心管中,加入兔源一抗3-10μg,枪头吸打至充分混匀,室温孵育5分钟。加入至10ml Dilution Buffer中,充分混匀。
    注意:
    1)一抗的用量也可根据抗体的稀释度来进行调整。以抗体的最终稀释度1:1000为例,取100μl抗体反应液HRP(兔)到EP管中,加入10μl一抗,加入到10ml 抗体稀释液中,充分混匀,室温孵育5分钟。
    2)如果膜面积较小,可按比例减少抗体、反应液及稀释液的用量。
    5、完成步骤3后,倒掉漂洗液,将一抗、Antibody Pretreat Solution(HRP/Rabbit)及Dilution Buffer混合而成的抗体孵育液加到膜上(确保孵育液完全浸没膜表面),在摇床上以60 rpm左右的速度室温孵育40分钟。
    6、弃去(回收)抗体孵育液,用配制的1×Wash Buffer漂洗3-5次,每次3分钟。
    7、进行后续检测。建议采用ECL或者DAB法进行检测。

    应用实例:


    实例一 抗原为293T细胞全裂解液
    A:普通WB对照:beta-actin兔多抗 3.3ug 室温孵育40min,洗膜后二抗羊抗兔-HRP(WE0394)1:10000稀释,室温40min,ECL(WE0308)曝光


    实例二 抗原为293T细胞全裂解液
    C:普通WB对照:PAK1,Epitomics兔单抗1:1000 室温孵育40min,洗膜后二抗羊抗兔-HRP(WE0394)1:10000稀释,室温40min,ECL(WE0308)曝光
    D:一步法WB: Epitomics兔单抗1:1000 室温孵育40min,ECL(WE0308)曝光。

    常见问题及解决方法:


    问题 可能原因 解决方案
    信号太弱或者
    看不到条带
    蛋白上样量太少 进行SDS-PAGE电泳时加大上样量。
    蛋白转膜效率太低 优化转膜时间或者电流,确保转膜时膜与胶之间没有气泡。
    一抗亲和力较低 增加膜在溶液中的孵育时间或者增加抗
    体浓度可以增加信号
    一抗亲和力较低 对于低亲和力抗体来说,减少洗膜时间可以增加信号。由每次10 分钟,减少到每次5分钟可以增加信号。
    背景偏高 一抗使用过量 减少一抗的使用量。
    一抗有非特异性结合或者
    与封闭试剂有交叉反应
    使用和二抗来源一致的血清或者无IgG的BSA。
    洗膜时间太短 增加洗涤的步骤可以进一步的降低背景。
    曝光显影时间过长 减少曝光时间。如果信号和背景都高,可以等待一段时间
    ,等背景信号减弱后,再进行曝光。
    容器或者试剂被污染 每次洗涤的时候使用清洁的容器。带手套,使用清洁的镊子处理膜。


    储存条件:2~8℃保存,避免冷冻


    WE0228型二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)销*(代"售")关键词:WE0228,NGS Fast DNA Library Prep Set for Ion Torrent,二代测序DNA快速建库试剂盒(Ion Torrent平台)


    ·丽春红染色试剂
    编号:WE0305
    英文名称:Ponceau Stain Reagent
    规格:100ml
      丽春红为常用蛋白质染色剂。试剂本身带负电荷,既可与带正电荷的*基酸残基相结合,也可与蛋白质非极性区结合,从而在印迹膜上形成清晰的红色条带;同时这种结合具有可逆性,染色后可用蒸馏水、PBS缓冲液或其它适当溶液进行漂洗脱色,对后续实验不产生影响。本产品可用于检测Western Blot实验中PVDF或NC膜上蛋白,以检测蛋白的转膜效率;具有灵敏度高,使用方便等优点。

    注意事项
    1、丽春红染色试剂不适用于尼龙膜上的蛋白的检测。
    2、使用本品时,请穿着实验服并佩戴手套进行操作。
    3、本产品仅用于科研,不能用于人体实验或人体治疗。

    操作步骤
    1、蛋白转移完毕后,将PVDF或NC膜完全浸没在Ponceau Stain Reagent(丽春红染色液)中,摇动染色3-5分钟。
    2、使用纯水、PBS缓冲液或其它适当溶液对印迹膜进行漂洗2-3次,每次3-5分钟,去除未与蛋白结合的染料,直至膜上出现清晰条带。
    3、检测结束后,再次使用纯水,PBS缓冲液或其它适当溶液对印迹膜进行漂洗2-3次,每次3-5分钟,去除与蛋白结合的丽春红染料。
    4、按照正常步骤,进行后续的Western Blot检测。

    储存条件:室温



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