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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
-20℃,避免反复冻融
- 保质期:
长期
- 英文名:
Fast TaqMan Mixture(Low ROX)
- 库存:
938
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
特别声明:本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品,严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。
北京百奥莱博专业生产销*(代"售")快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)北京厂家,我公司供应的分子生物学试剂品类齐全,且具有优势价格,欢迎新老客户垂询订购。
名称:快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)北京厂家
规格:5ml
品牌:百奥莱博
英文名:Fast TaqMan Mixture(Low ROX)
产地:国产|进口
编号:WE0152
本品是专用于探针法(TaqMan,Molecular Beacon等)实时荧光定量PCR的预混体系,浓度为2×,包含Fast Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、dNTPs、Mg2+等,操作简单方便。主要用于基因组DNA靶序列和RNA反转录后的cDNA靶序列检测。本品含有的Fast Taq DNA Polymerase,能有效减少在常温条件下由引物和模板非特异性结合或引物二聚体而产生的非特异性扩增,酶的激活仅需在95℃孵育30s。整个PCR反应过程比普通反应可节省约40分钟,大大缩短了PCR的反应时间。独特的PCR缓冲体系与快速热启动酶的组合,有效抑制了非特异产物的产生,并显著提高了PCR的扩增效率,荧光信号更强,灵敏度更高,线性范围更宽。该产品适用范围广,可用于普通和快速定量PCR程序。
ROX染料用于校正定量PCR仪孔与孔之间产生的荧光信号误差,一般用于ABI、Stratagene等公司的Real Time PCR 扩增仪。不同仪器的激发光学系统有所不同,因此ROX染料的浓度必须与相应的荧光定量PCR仪相匹配。
不需要ROX校正的仪器(WE0151):
Roche LightCycler 480,Roche LightCyler 96,Bio-rad iCyler iQ,iQ5,CFX96等。
需要Low ROX校正的仪器(WE0152):
ABI Prism7500/7500 Fast,QuantStudio® 3 System,QuantStudio® 5 System,QuantStudio® 6 Flex System,QuantStudio® 7 Flex System,ViiA 7 system,Stratagene Mx3000/Mx3005P,Corbett Rotor Gene 3000等。
需要High ROX校正的仪器(WE0153):
ABI Prism7000/7300/7700/7900,Eppendorf,ABI Step One/Step One Plus等。
试剂盒组成:
| 组份 | WE0151-5ml | WE0152-5ml | WE0153-5ml |
| 2×Fast TaqMan Mixture | 5×1ml | 5×1ml | 5×1ml |
| 50×Low ROX | - | 200μl | - |
| 50×High ROX | - | - | 200μl |
| ddH2O | 5×1ml | 5×1ml | 5×1ml |
注意事项:
1、使用前请上下颠倒轻轻混匀,尽量避免起泡,并经短暂离心后使用。
2、避免反复冻融本品,反复冻融可能使产品性能下降。本产品长期保存可置于-20℃,避光。如果在短期内需要频繁使用,可在2~8℃保存。
使用方法:
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
| 试剂 | 50μl反应体系 | 终浓度 |
| 2×Fast TaqMan Mixture(With ROX) | 25μl | 1× |
| Forward Primer,10μM | 1μl | 0.2μM |
| Reverse Primer,10μM | 1μl | 0.2μM |
| Probe,10μM | 1μl | 0.2μM |
| Template DNA | 2μl | |
| 50×Low ROX or High ROX(可选) | 1μl | 1× |
| ddH2O | up to 50μl |
注意:
1)通常引物浓度以0.2μM可以得到较好结果,可以在0.1-1.0μM作为设定范围的参考。
2)所用探针的终浓度,与使用的荧光定量PCR仪、探针种类、荧光标记物质种类有关,实际使用时请参照仪器说明书,或各荧光探针的具体使用要求进行浓度的调节。
3)通常DNA模板的量以10-100ng基因组DNA或1-10ng cDNA为参照,因不同物种的模板中含有的目的基因拷贝数不同,可对模板进行梯度稀释,以确定最佳的模板使用量。
4)不同仪器的激发光学系统有所不同,根据使用荧光定量的仪器选择加入50× Low ROX or 50×High ROX。
2、PCR反应程序:
建议采用两步法PCR反应程序,本程序是以ABI 7500荧光定量PCR仪为参照设定。
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 95℃ | 30 s | |
| 变性 | 95℃ | 5 s | 35-40 个循环 |
| 退火/延伸 | 60℃ | 30 s |
注意:
1)本产品所采用的酶须在预变性95℃、30s条件下实现酶的活化。在此条件下,大多数模板可良好的进行解链。对GC含量高、二级结构复杂的模板,可将预变性时间延长至1-4分钟,以使起始模板充分解链。
2)建议采用两步法PCR反应程序,若因使用Tm值较低的引物等原因,得不到良好的实验结果时,可尝试进行三步法PCR扩增,退火温度请以 56℃-64℃的范围作为设定参考。
储存条件:-20℃,避免反复冻融
我公司的快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)北京厂家,性价比高,货期短,送货上门,欢迎您来电咨询购买,另外,我公司还生产供应销*(代"售")下列产品:
F010201 小鼠抗鸡IgG(IgY)抗体 Monoclonal Mouse Anti-Chicken IgG(IgY)
PY02-105 乳糖胆盐琼脂 250克
ARB12949 小鼠血浆α颗粒膜蛋白(GMP-140)Elisa定量检测 Mouse alpha-granular membrane protein,gmp-140 ELISA KIT
F030428 胶体金标记兔抗猫IgG抗体 Rabbit Anti-Cat IgG*GOLD
BTN131131 细菌种属鉴定PCR Mix Bacterial DNA Barcoding PCR Mix
25322-68-3 PEG6000 聚乙二醇
苹果酸脱*酶 Shikimic acid 9001-64-3
F020212 兔抗鸡IgY IgG抗体 Rabbit Anti-Chicken IgY
BTN130537 *蛋白酶抑制剂Ⅰ溶液 Calpain InhibitorⅠSolution
BTN120628 GTP溶液,100mM GTP Solution
BTN60904 一站式RNA电泳套装 One-Stop RNA Electrophoresis Pack
F030435 胶体金标记山羊抗鸡IgY IgG抗体 Polyclonal Goat Anti-Chicken IgY(IgG)*GOLD
PY01-156 蛋白酶抑制剂(7000u/mg) 0.1克
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快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)北京厂家关键词:Fast TaqMan Mixture(Low ROX),低含量ROX校正染料,WE0152,快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)
·Taq酶抗体
编号:WE0121
英文名称:Taq Antibody
规格:500U|2500U
本品是抗Taq酶鼠单克隆抗体,适用于Hot Start PCR。Taq Antibody与Taq酶结合后能抑制DNA聚合酶活性,进而能够在低温条件下有效抑制引物的非特异性退火及引物二聚体引起的非特异性扩增。Taq Antibody在PCR反应最初的DNA变性步骤中变性,DNA聚合酶活性恢复,达到热启动效果。因此无需对Taq酶抗体进行特殊失活处理。
产品特点;
1、在37℃,可抑制>95%的聚合酶活性。
2、可提高PCR反应的特异性和灵敏性,包括复杂的人基因组DNA或cDNA模板,低拷贝的模板,多重PCR等。
3、PCR反应速度快于普通化学修饰的聚合酶。
活性定义:Taq Antibody与Taq DNA Polymerase混合,25℃孵育15 min后,将在37℃,30 min条件下抑制97%以上的1 U的Taq DNA Polymerase活性的Taq Antibody量定义为1U。
使用方法:
将Taq DNA Polymerase和Taq Antibody等体积混合,20-25℃下放置15 min冰上待用。
注意:通过实验,我们建议Taq Antibody和 Taq DNA Polymerase混合的分子数之比为13:1较为合适,实际操作中由于引物、目的产物或Taq DNA Polymerase不同,可以摸索一系列的比例以得到最合适的结果。
以下举例为以人基因组DNA为模板,扩增300 bp的片段的PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
| 试剂 | 50μl反应体系 |
| 10×PCR Buffer | 5μl |
| dNTP Mix,10μM each | 1μl |
| Forward Primer,10μM | 1μl |
| Reverse Primer,10μM | 1μl |
| Template DNA | 4μl |
| Taq酶和抗体的混合液 | 0.36μl |
| ddH2O | up to 50μl |
2、PCR反应条件,可以按照各种PCR用DNA Polymerase的常规PCR反应条件进行PCR反应。
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 94℃ | 2 min | |
| 变性 | 94℃ | 30 s | 25-35 个循环 |
| 退火 | 55-65℃ | 30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 30 s | |
| 终延伸 | 72℃ | 2 min |
储存条件:-20℃,避免反复冻融。
快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)北京厂家关键词:Fast TaqMan Mixture(Low ROX),低含量ROX校正染料,WE0152,快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)
·二代测序DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)
编号:WE0229
英文名称:NGS Fast DNA Library Prep Set for Illumina
规格:24次|96次
本试剂盒提供了DNA文库构建所需要的酶预混体系及反应缓冲液,包含除接头与PCR引物外的所有成分,用于illumina二代测序平台DNA文库构建。和一般建库方法相比,该试剂盒操作简单、方便,极大地缩短了文库构建时间。另外,试剂盒采用高保真DNA聚合酶进行文库富集,无偏好的PCR扩增,扩大了序列的覆盖区域,可高效制备用于illumina二代测序平台的DNA文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性。
试剂盒组成:
| 组份 | 24次 | 96次 |
| End Prep Enzyme Mix | 48μl | 192μl |
| 10x End Repair Reaction Buffer | 200μl | 800μl |
| T4 DNA ligase | 48μl | 192μl |
| T4 DNA ligase Buffer | 400μl | 2×800μl |
| HiFidelity 2×PCRMasterMix | 600μl | 2×1.2ml |
试剂盒特点;
1、末端补平,磷酸化,加A一步完成。
2、不需纯化,直接加接头。
3、超保真扩增,最大程度上降低了扩增偏好性。
4、支持多种样本,且所得文库能够用于Illumina GAIIx,HiSacnSQ、HiSeq 2500/2000/1000和MiSeq sequencing等测序平台的测序。
自备仪器、试剂和耗材:
1、磁力架:建议使用DynaMagTM-2(货号: 12321D)。
2、DNA纯化回收试剂盒:建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(货号: WE0205)。
3、样本接头引物试剂盒:建议使用百奥莱博二代测序多样本接头引物试剂盒 I/II(货号:WE0241/WE0240)。
4、无水乙醇,EB(10 mM Tris-HCl, pH 8.0),去离子水(pH 在7.0-8.0之间)。
5、反应管:建议使用低吸附的PCR管与1.5ml离心管;枪头:建议使用高质量过滤枪头防止试剂盒、文库样本污染
实验前准备及重要注意事项/strong>:
1、避免试剂的反复冻融,建议您首次使用试剂盒后将剩余试剂分装保存。
2、PCR产物因操作不当极易产生污染,导致实验结果不准确,建议将PCR反应体系配制区与PCR产物纯化区隔离,并使用专门的移液器,定时对各实验区域进行清洁。
DNA建库流程示意图:
操作步骤:
样本要求: 5ng-1μg打断的双链DNA,溶于EB(10 mM Tris-HCl pH 8.0)或去离子水中。DNA纯度要求:OD260/OD280=1.8~2.0。
DNA末端修复反应:
1、向200μl PCR管中加入以下试剂:
| 试剂 | 体积 |
| 10×End Repair Reaction Buffer | 6.5μl |
| End Prep Enzyme Mix | 2μl |
| fragmented DNA | X(5ng-1μg) |
| RNase-free Water | Up to 65μl |
2、用枪头将上述溶液轻轻吹吸混匀,短暂离心,使所有组分收集到管底。
3、将上述PCR管置于PCR仪中,热盖打开, 反应程序如下:
15 min @ 12℃
15 min @ 37℃
20 min @ 72℃
Adaptor 连接:
建议使用百奥莱博adaptor进行连接,也可选择使用NEB、illumina公司的adaptor,具体连接方法可参考各公司的产品使用说明书。以下为使用百奥莱博adaptor进行连接的操作步骤:
1、向上述已完成DNA末端修复的反应液中直接加入以下试剂:
| 试剂 | 体积 |
| T4 DNA ligase buffer for illumina | 14μl |
| T4 DNA ligase | 2μl |
| Adaptor | 2.5μl |
此时管中溶液总体积为83.5μl。
注意:若起始样本量少于100ng,请将adaptor用去离子水稀释10倍至1.5μM后使用。
2、用枪头将上述试剂吹吸混匀,短暂离心,使溶液收集到管底。
3、20℃温浴15分钟。
注意:若此操作使用pcr仪,请将热盖关闭。
DNA片段的选择性回收:
建议使用百奥莱博磁珠法DNA纯化回收试剂盒(WE0205)进行DNA片段选择性回收。
注意:DNA片段选择性回收是可选步骤,若起始样本量低于50ng,不建议进行DNA片段选择性回收,直接进行DNA片段的纯化。另外构建不同大小的DNA文库时,DNA片段选择性回收的磁珠使用量不同,具体磁珠用量可参照附表1(若使用除百奥莱博以外厂家的磁珠,需自行摸索最佳磁珠用量)。
以下操作步骤中,可选择回收DNA片段长度峰值为320bp(插入片段长度200bp),反应起始体积为100μl。
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、向连接反应液中加入16.5μl去离子水,使adaptor连接反应缓冲液体积至100μl。
注意:若使用NEB adaptor,只需要加入13.5μl去离子水。
3、将上述adaptor反应缓冲液转移至一新的1.5ml离心管中。
4、加入70μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后, 室温静置5分钟。
5、短暂离心,将离心管置于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心地将上清溶液转移至新的1.5ml离心管中,并弃去磁珠。
注意:不要弃除上清。
6、向上清中加入25μl混合均匀的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温放置5分钟。
7、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
8、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
9、重复步骤8。
10、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
11、将离心管从磁力架上取下,加入28μl 10 mM Tris-HCl(pH 8.0)或去离子水(自备),涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
12、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中;
注意:一定不要转移磁珠,微量磁珠污染可影响后续PCR反应的正常进行。
另一种方案: DNA片段的纯化:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、将adaptor连接反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后,室温静置5分钟。
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟),小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入28μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将23μl洗脱液转移至一个新的PCR管中。
附表1:不同片段选择回收时磁珠建议用量
| DNA文库大小 | 插入片段 | 150bp | 200bp | 250bp | 300-400bp | 400-500bp | 500-700bp |
| 插入片段+adaptor | 270bp | 320bp | 400bp | 400-500bp | 500-600bp | 600-800bp | |
| 磁珠用量 | 第一次选择 | 85 | 70 | 55 | 50 | 45 | 35 |
| 第二次选择 | 25 | 25 | 20 | 20 | 20 | 15 |
PCR扩增:
1.在PCR管中加入以下试剂并混匀。
| 试剂 | 体积 |
| 连接adaptor后的DNA片段 | 23μl |
| 2×HiFid elity PCR Mix | 25μl |
| Univesial primer | 1μl |
| Index primer | 1μl |
| 总体积 | 50μl |
2、PCR反应条件:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s | |
| 变性 | 98℃ | 10 s | 6-16个循环 |
| 退火 | 65℃ | 30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 30 s | |
| 终延伸 | 72℃ | 5 min |
注意:建议1μg样本起始量时PCR循环数为6个循环,50ng时10个循环,5ng时14-15个循环,PCR循环数也可根据实验需要进行优化。
PCR产物的纯化:
1、涡旋振荡MCPure20秒,使其彻底混匀为均一溶液。
2、将PCR反应液转移至一新的1.5ml离心管中。
3、加入1倍样品体积的MCPure,涡旋震荡5秒钟后室温静置5分钟。
4、短暂离心,将离心管放于磁力架上,使磁珠和上清溶液分离,直至溶液澄清(约需5分钟)。小心吸取上清并弃除,期间避免接触已结合目标DNA的磁珠。
注意:不要弃除磁珠。
5、继续保持离心管固定于磁力架上,向离心管中加入250μl新鲜配置的80%乙醇,室温放置30秒,待悬起的磁珠完全吸附后,小心弃除上清。
6、重复步骤5。
7、保持离心管固定于磁力架上,室温静置10分钟,使磁珠在空气中干燥。
8、将离心管从磁力架上取下,加入30μl EB(自备)或去离子水,涡旋振荡使磁珠完全重悬于洗脱液中,室温静置5分钟。
9、短暂离心,将离心管放于磁力架上直至溶液澄清(约需5分钟),将洗脱液转移至一个新的PCR管中约25μl,DNA文库在-20℃保存。
文库质量检测
文库浓度:
为了得到高质量的测序结果,需要对DNA文库进行精确定量,首先推荐使用Real-time PCR方法对DNA文库进行绝对定量。此外,还可使用荧光染料法,如Qubit法或荧光染料picogreen法,此处请勿使用基于吸光度测量的定量方法。最终可使用以下近似公式换算DNA文库的摩尔浓度。
| 文库平均总长度 | 近似转换公式 | 成簇反应DNA文库浓度 |
| 200 bp | 1ng/μl=7.5 nM | 6-12 pM |
| 300 bp | 1ng/μl=5.0 nM | 6-12 pM |
| 400 bp | 1ng/μl=3.8 nM | 6-12 pM |
| 500 bp | 1ng/μl=3.0 nM | 6-12 pM |
文库长度分布
制备好的DNA文库可用琼脂糖凝胶电泳或Agilent 2100 Bioanalyzer检测DNA文库中的片段长度分布范围。

图1:Agilent 2100 Bioanalyzer文库分析结果
L:DNA Ladder;
S:使用200ng人基因组DNA构建文库,磁珠进行选择回收后结果。
文库结构
5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT [Target Sequence] TGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACNNNNNNATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’
NNNNNN:index, 6bases
储存条件:-20℃
北京百莱博科技有限公司是核酸扩增(PCR)产品的专业生产供应销*(代"售")商,恭候您的咨询选购快速实时荧光定量PCR的预混体系(荧光探针)(低含量ROX校正染料)北京厂家。
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文献和实验扩增曲线的分析攻略。 1、确认软件设置是否正确 对照试剂盒说明书,检查时间、温度、循环数、荧光采集等是否设置正确。有一个比较容易忽略的设置问题是,需要看下所选用的试剂中是否含有 ROX 来作为参比荧光染料。Applied Biosystems™ 系列荧光定量 PCR 仪器可以用 ROX 来作为参比荧光染料,用以校正仪器系统以外的物理误差,比如均一化校正由于移液误差或者蒸发导致的批内体积误差等。目前市面上有的的荧光定量 PCR 预混液是不含有 ROX 的,当用此类试剂的时候,应该将 ROX 参比
MasterMix,模板和引物的不同进行优化,达到一个最佳反应体系。在反应体系配置过程中,有下面几点需要注意:1. MasterMix不要反复冻融,如果经常使用,最好溶解后放在4度。2. 更多的配制Mix进行,减少加样误差。最好能在冰上操作。3. 每管或每孔都要换新枪头!不要连续用同一个枪头加样!4. 所有成分加完后,离心去除气泡。5. 每个样品至少3个平行孔。参比或者校正染料(reference dye,passive dye)常用的是ROXTM(现在已经是ABI的注册商标了!)或者其他染料,只要不影响检测
Real-time qPCR 手册——手把手教你从菜鸟到高手
或者 Premixture 里。如果反应曲线良好或已经优化好反应体系,也可以不加 ROXTM 染料校正。 通常来讲,real-time qPCR 的反应程序不需要像常规的 PCR 那样,要变性、退火、延伸 3 步。由于其产物长度在 80-150 bp 之间,所以只需要变性和退火就可以了。SYBR @Green 等染料法,最好在 PCR 扩增程序结束后,加一个溶解程序,来形成溶解曲线,判断PCR产物的特异性扩增。而溶解程序,仪器都有默认设置,或稍有不同,但都是一个在产物进行溶解时候,进行荧光信号的收集
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