双链DNA(dsDNA)定量试剂 核酸电泳和回收

特别声明：本产品及我公司所售其他产品均为科研类试剂产品，严禁用于药物、医疗及其他非科研用途。

北京百奥莱博主要从事生物试剂的生产和销*(代"售")，产品线涵盖双链DNA(dsDNA)定量试剂 核酸电泳和回收在内的分子生物学试剂产品，还包括PCR及荧光定量PCR、核酸提取试剂盒类、样本核酸保护试剂、核酸提取、克隆与转化、蛋白纯化、蛋白检测、免疫组化、细胞凋亡与抗体等。

名称：双链DNA(dsDNA)定量试剂 核酸电泳和回收
规格：100μl
产地：国产|进口
编号：SY0259
Picogreen是一种极为灵敏的荧光核酸染料，常用于双链DNA的定量检测。历来DNA浓度的测定在cDNA文库的构建，DNA亚克隆、PCR产物的估测等领域中具有重要意义。疫苗等生物制品中残留微量DNA的检测更是直接关系到人类的健康。

常用的检测核酸的方法有:
1）紫外吸光法（A260），该法操作简便，但DNA样品中核苷酸、单链DNA、RNA和蛋白质对紫外吸收信号影响很大，还容易受到核酸样品中污染物的干扰，不能区分DNA和RNA，而且灵敏度低（ΔA260=0.1相当于5ug/ml的dsDNA）；
2）探针杂交法，该法是传统检测微量DNA的常用方法，基本能满足目前疫苗和治疗性生物制品的检测需求，但是该法耗时较长，操作繁琐，稳定性、敏感性和特异性较差；
3）Hoechst33258染料法，Hoechst33258是一种一定程度上特异于双链DNA的核酸染料，基本不受蛋白质的干扰，可以检测低至10ng/ml的DNA；在检测稳定性和灵敏度上仍达不到理想效果。

Picogreen dsDNA定量法：Picogreen仅在与DNA双链结合后才发出荧光，且所产生的荧光与DNA浓度呈正比，在存在ssDNA、RNA和单体核苷酸的条件下，可以选择性地检测低至25pg/ml的dsDNA。该分析在三个数量级范围内呈线性，且几乎无序列依赖性，可以精确地测量多个来源的DNA，包括基因组DNA、病毒DNA、小量提取DNA或PCR扩增产物。

相比传统的方法，Picogreen dsDNA Quantitation Reagent定量具有以下优势：
①灵敏度高：数量级较UV吸光读数更敏感，可节省宝贵的样品；
②特异性强：在等摩尔的RNA存在的条件下，对dsDNA具有特异性；
③耐受性好：耐受较高浓度的盐、尿素、乙醇、*仿、去垢剂、蛋白或琼脂糖，可以直接定量PCR扩增产物而无需从反应混合物中纯化DNA。
④易于使用——只需在样品中加入染料，等待5分钟，然后读数即可，且适用于96和384孔板；与大多数基于荧光的酶标仪和荧光计兼容。
⑤适用范围广：可适用于PCR的分析、芯片样品、DNA损伤分析、酶活性分析、基因组DNA定量以及复杂混合物中dsDNA的检测和病毒DNA定量等多种领域。

若每次分析体积为2 mL，1ml Picogreen定量试剂足够200次分析使用，若使用微孔板或96孔板检测，每次使用量200µl，则足够2000次分析。另外，我公司提供【双链DNA（dsDNA）定量检测试剂盒】方便客户选用。

储存条件：4℃避光干燥，有效期6个月。

注意事项
1）Picogreen定量试剂含有DMSO（已知有毒试剂），请小心操作；
2）尽管目前尚未有数据表明Picogreen具有诱变性和毒性，但是该试剂能结合双链DNA，请操作时务必小心。

应用实例
【注】：本方法参照2010《中国药典》进行操作的，如结果要求不是特别严格，可参照Yeasen 【双链DNA（dsDNA）定量检测试剂盒（Cat#10225）】的标曲制备方法。

1、染料工作液的配置

PicoGreen dsDNA定量试剂取出后回温至室温，该试剂是以1mL的浓缩液形式保存于无水DMSO中的。实验当天，根据实验用量用1×TE（10mM Tris-HCl，1mM EDTA，pH7.5）按1:200 的比例稀释PicoGreen浓缩液。如，要准备足够的操作溶液测定20个样品，可在19.9mL1×TE 中加入100μL PicoGreen dsDNA 定量试剂。
【注】：
a、由于试剂容易吸附到玻璃表面，要在塑料容器中配制。
b、PicoGreen试剂见光易降解，所以应将配好的溶液用铝箔包住或放置暗处避光保存。
c、溶液最好在配制好数小时内使用，以保证最佳结果。

2、标准品工作液的配制

小牛胸腺嘧啶DNA干粉 1mg（Tris，Nacl等浓度已成标准体系），加入1mL无菌去离子水（无Dnase），配制成1mg∕mL的标准品工作液。
【注】：标准品也可用λDNA或其他已知浓度的纯化DNA。

3、标准品工作液稀释

1）母液稀释：取10µl（1mg∕mL）标准品工作液加入到990ul TE溶液中，浓度稀释成10µg∕mL，取10µl（10µg∕mL）标准品工作液加入到990µl TE溶液中，浓度稀释成100ng∕mL；
2）倍比稀释：取800µl （100ng∕mL）的标准品工作液加入到200µl TE溶液中，浓度达到80ng∕mL，取500µl（80ng∕mL）的标准品工作液加入到500µl TE溶液中，浓度稀释到40ng∕mL；依次倍比稀释，配成20ng/ml、10ng/ml、5.0ng/ml、2.5ng/ml、1.25ng/ml、0.625ng/ml的标准品溶液；
3）标准曲线的制备：倍比稀释后的各梯度标准品溶液和染料工作液各取100µl混匀，避光室温放置5min。使用FB-15型便携式荧光仪检测样品的荧光值：将混合后的溶液加入微量比色皿，确信不要在样品中引入气泡，轻轻地弹微量检测皿的外部，可以驱散气泡。以1×TE缓冲液为blank，测定样品和空白对照的荧光值；用标准品溶液的浓度（ng/ml）对应的荧光强度作直线回归，制备标准曲线。
4）测量剩余样品的荧光值。荧光计将给出一个直接的浓度读数，数据可以用来产生DNA 浓度的标准曲线。

4、结果分析


表1 标曲测定荧光值


图1 标准曲线图

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·Anti-His标签亲和纯化凝胶
编号：SY0435
英文名称：Anti-His Affinity Gel
规格：1ml
Anti-His Affinity Gel（Anit-His亲和纯化凝胶）由高质量的鼠源 IgG1单克隆抗体与sepharose 4B gel 通过供价偶联制备，本产品具有较高的His标签融合蛋白加载容量（至少为0.6mg protein/mL凝胶），杂蛋白非特异结合少，可用于带有His标签的融合蛋白免疫沉淀（IP）和纯化。我公司提供的Anit-His亲和纯化凝胶可用于纯化N-端、C-端、4×His、5×His、6×His融合蛋白。

亚型：Mouse IgG1
纯化方法：Protein A
浓度：7.5g抗体/L凝胶
应用：蛋白纯化，免疫沉淀（IP）
蛋白结合量（Protein）：≥0.6 mg蛋白/mL凝胶
储存缓冲液：TBS, 50% 甘油, pH 7.4，含有0.02%（w/v）叠氮*
储存条件：-20℃，有效期1年


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·PCR Master Mix (含染料)
编号：SY0025
英文名称：PCR Master Mix (With Dye)
规格：1ml
PCR Master Mix是即用型的常规PCR预混合溶液，含有Taq DNA Polymerase，dNTP混合物，MgCl2以及优化的缓冲体系，只需加入引物和模板即可进行扩增，大大简化实验的操作步骤，提高了高通量操作和实验结果的重现性。

Mix中加入电泳缓冲液和染料，使得PCR产物可以直接进行电泳，染料的存在不会干扰扩增效率。体系中含有的保护剂使得Master Mix 4ºC条件下长期放置，或经过反复冻融后仍可维持酶的活性以及产品的稳定性。PCR产物具有3’-dA突出端，可轻松克隆至T载体。

活性定义：用活性化的大马哈鱼精子作为模板/引物，在74ºC，30min内摄入10 nmol的全核苷酸为酸性不溶物的活性定义为1个活性单位（U）。

质量控制
核酸外切酶残留检测：20 μl本品和0.6 μg λ-Hind Ⅲ在74 ºC下孵育1小时，DNA的电泳谱带不发生变化。
核酸外内酶残留检测：20 μl本品和0.6 μg Supercoiled pBR322 DNA在74 ºC下孵育1小时, DNA的电泳谱带不发生变化。
大肠杆菌残留DNA检测: 50 μl体系中，以ddH2O为模板，扩增E.coil 16s rDNA基因。35个循环后扩增产物进行1% 琼脂糖凝胶电泳，EB染色，无扩增条带。
功能检测：50 μl体系中，以100 ng人基因组DNA为模板扩增α-1-antitrypsin基因。30个循环后取10% PCR产物进行1% 琼脂糖凝胶电泳，EB染色，观察到单一的360 bp条带。
稳定性检测： PCR Master Mix 分别在-20 ºC放置1年、4 ºC放置3个月、25 ºC放置1个月后，菌落PCR扩增1.2 kb片段。电泳结果显示2×PCR Master Mix具有非常好的稳定性。

 

操作注意事项
由于Taq DNA Polymerase室温下也有一定的反应活性，PCR反应体系配制需在冰上进行。体系混匀后快速置于PCR仪进行反应。这样可以减少反应准备阶段的非特异扩增，有助于得到更好的PCR结果。

引物设计注意事项
1.引物3’端最后一个碱基选择C或G；
2.引物3’端最后8个碱基应避免出现连续错配；
3.引物3’端尽量避免发卡结构的出现；
4.引物Tm值控制在55℃-65℃之间；
5.引物额外附加序列，即与模板非配对序列，不应参与引物Tm值计算；
6.引物GC含量控制在40%-60%之间；
7.正向引物和反向引物Tm值以及GC含量尽可能一致。

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