微卫星(STR)分析-SSR

一、服务介绍
微卫星标记（Microsatellite）也称为短串联重复序列（STR）或简单重复序列（SSR）是指以少数几个核苷酸（多数为2-4个）为单位多次串联重复的DNA序列。由于重复单位及重复次数不同，使其分布具有很大的差异性，构成了STR的遗传多态性，并按孟德尔规律呈共显性遗传。由于STR具有种属特异性、适合于复合扩增、适合于降解、微量样品的检测等特性，使其在人类基因组遗传图谱的制作，种质鉴定，亲缘关系分析，法医学个体识别和亲权鉴定，筛选目的基因和基因诊断，器官移植，基因定位等领域都得到了广泛的应用。
微卫星位点通常通过PCR扩增，扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。PCR扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测，传统采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法，费时费力效率低。我们利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测，加上分子量内标进行DNA片段长度计算，使STR分型变得高效快捷，结果也更加精确可靠。基于测序仪平台，我们同时提供的整体微卫星（STR、SSR）分型服务，包括单倍型分析、遗传连锁分析或构建遗传连锁图谱等。


二、服务内容
1. 根据相关背景资料，确定试验方案
2. 预试验确定实验条件（基因组DNA提取；荧光标记引物设计、合成 ）
3. 检测位点 PCR 扩增
4. 毛细管电泳检测
5. 数据处理与分析【Genemapper软件】
三、服务说明
1 您可以提供相关基因座已经扩增好的PCR 产物，我们对其直接进行STR 分型检测
2 您亦可以提供试验材料，比如生物组织、血液或基因组DNA；
3 若所送样品为基因组DNA 或质粒DNA，样品要求：DNA 浓度≥20ng/ul，体积≥10ul（若位点数较多，则按1ul/位点准备），纯度 OD 260/280 在1.7～1.9 之间。
4 若样品为血样，样本要求：血液样品，体积大于 500ul，用EDTA抗凝，送样过程中请注意保持低温，防止DNA降解；血斑样品，9-25mm2 大小的血斑两个以上。对每个血样或血斑样本将收取DNA 提取费。若分型样品为细胞、组织样品，样本要求：细胞≥105，组织≥100mg，黄豆大小。
四、交付内容
1. 原始数据，包括Genemapper分析图谱（PDF格式）及fsa格式峰型图
2. 各峰的相对分子量等具体信息（Excel格式）
3. 完整实验报告（包括引物序列、扩增反应体系，实验步骤等）
4. 数据分析软件及使用说明
5. 其他服务
公司可以提供 SSR 跑 PAGE 胶，及 ISSR 跑琼脂糖分析，具体事宜请咨询
五、服务价格、周期

编号	服务名称	内容说明	周 期	价 格
M0022	微卫星—单色检测	单色检测，数据分析至size等	5工作日	600元/96孔板
M0023	微卫星—双色检测	多色检测，数据分析至size等	5工作日	800元/96孔板
M0024	T-RFLP跑板	上机检测，数据分析	5工作日	600元/96孔板
M0025	微卫星—STR跑板	上机检测，不分析数据等	5工作日	400元/96孔板
M0026	微卫星—普通引物合成	2 0D，PAGE纯化，不超过30碱基	5工作日	50元/对
M0027	微卫星—荧光引物合成	FAM 2OD	7工作日	300元/对
		HEX 20D	7工作日	400元/对
		TAMRA 2OD	7工作日	400元/对
		ROX 2OD	7工作日	500元/对
M0028	微卫星—引物设计	不含验证	2工作日	50元/对
M0029	微卫星—引物开发	开发多态性引物，拿5-10个样本验证	3-4周	询价
M0030	微卫星—STR/SSR分型检测	引物设计合成、扩增、预实验、检测	3-4周	询价
M0031	微卫星—数据分析	关联性分析、构建遗传图谱等	2-4周	询价