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mTOR Complexes: mTORC1: MLST8, MTOR, RPTOR.
mTORC2: MLST8, MAPKAP1 (SIN1), MTOR, RICTOR.
mTOR Upstream Regulators: mTORC1
Positive Regulators: AKT1, AKT2, AKT3, HRAS, IGF1, IKBKB, INS, INSR, IRS1, MAPK1, MAPK3, PDPK1, PIK3C3, PIK3CA, PIK3CB, PIK3CD, PIK3CG, PLD1, PLD2, RHEB, RPS6KA1, RPS6KA2, RPS6KA5, RRAGA, RRAGB, RRAGC, RRAGD, TELO2.
mTORC2 Positive Regulators: AKT1, AKT2, AKT3, MAPK1, MAPK3, PDPK1, PIK3C3 (VPS34), PIK3CA, PIK3CB, PIK3CD, PIK3CG, RHEB, RPS6KA1, RPS6KA2, RPS6KA5.
mTORC1 Negative Regulators: AKT1S1 (PRAS40), CAB39, CAB39L, DDIT4, DDIT4L, DEPTOR, FKBP1A (FKBP12), FKBP8, IGFBP3, PRKAA1 (AMPK), PRKAA2, PRKAB1, PRKAB2, PRKAG1, PRKAG2, PRKAG3, PTEN, STK11 (LKB1), STRADB, TP53, TSC1, TSC2, YWHAQ (14-3-3θ).
mTORC2 Negative Regulators: CAB39, CAB39L, DDIT4 (REDD1), DDIT4L (REDD2), DEPTOR, PRKAA1 (AMPK), PRKAA2, PRKAB1, PRKAB2, PRKAG1, PRKAG2, PRKAG3, STK11 (LKB1), STRADB, TSC1, TSC2.
mTOR Downstream Effectors: mTORC1 Positive Regulation: CHUK (IKKa), EIF4B, EIF4E, HIF1A, IKBKB, RPS6, RPS6KB1, RPS6KB2, TP53, VEGFA, VEGFB, VEGFC.
mTORC2 Positive Regulation: AKT1, CDC42, GSK3B, HSPA4, ILK, MYO1C, PRKCA, PRKCB, PRKCE, PRKCG, RHOA, RPS6KB1, SGK1.
mTORC1 Negative Regulation: EIF4EBP1, EIF4EBP2, PPP2CA, PPP2R2B, PPP2R4, TP53, ULK1, ULK2.
Cellular Processes: Amino Acid Response: PIK3C3 (VPS34), RRAGA, RRAGB, RRAGC, RRAGD.
Angiogenesis: CHUK (IKKa), DDIT4 (REDD1), DDIT4L (REDD2), HIF1A, IKBKB, VEGFA, VEGFB, VEGFC. Autophagy: PIK3C3 (VPS34), ULK1, ULK2.
Cytoskeletal Organization: CDC42, PRKCA, PRKCB, PRKCE, PRKCG, RHOA.
Growth Factor Response: HRAS, IGF1, IGFBP3, MAPK1, MAPK3, RPS6KA1, RPS6KA2, RPS6KA5.
Energy Stress: PRKAA1 (AMPK), PRKAA2, PRKAB1, PRKAB2, PRKAG1, PRKAG2, PRKAG3.
Insulin Signaling: AKT1, AKT2, AKT3, INS, INSR, IRS1, PDPK1, PIK3CA, PIK3CB, PIK3CD, PIK3CG, TP53.
Lipid Metabolism: PLD1, PLD2.
Translation: EIF4B, EIF4E, EIF4EBP1, EIF4EBP2, PPP2CA, PPP2R2B, PPP2R4, RPS6, RPS6KA1, RPS6KA2, RPS6KA5, RPS6KB1, RPS6KB2.
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文献和实验PCR芯片,研究者可以同时研究大量基因,既可以进行某些特别感兴趣的信号通路的研究,也可以作为验证芯片结果的方法。 为了获得理想的实验结果,PCR芯片面临以下挑战:高特异性,高灵敏度和可重复性。高灵敏度或低检出限,在样品的总RNA量少,基因表达量低的情况下,也能检测出目的基因。高特异性,扩增产物严格保证基因特异性,避免非特异性产物,如引物二聚体的产生。可重复性,通过标准化的反应体系和实验方法,使得多人多次重复实验均能获得可靠的基因定量结果。 PCR芯片实验操作步骤 采用PCR芯片进行实验只需
值)! 版主zhujoker留言: 请不要打广告! 侠骨仁医 基因芯片本身是高通量的检测方法,由于一次性检测基因数目较多,不可避免的出现假阴性和假阳性,这就是为什么芯片一般需要重复试验,甚至同一张芯片上都要有不同对照的目的,我个人认为客观的说应该把基因芯片定位在高通量、初筛的定性检测手段,芯片的结果只是给你下游试验提供一些线索,mRNA水平的表达必须通过定量PCR来验证,不能直接利用芯片的结果来区分基因表达量的差异
大家好, Fluidigm BioMark 系统通过集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit, IFC),将上万个微小管道、控制阀门集成到微板上,形成纳升(nL)量级的反应仓,不需特别移液器,就可以同时进行多达近万个常规qPCR (传统Taqman 或其他) 实验。操作简单,既有传统qPCR可定量之好处,又有基因芯片高通量耗材少之优点,能大幅提高实验效率及准确度。 · 单个细胞基因表达( Single Cell Gene Expression): 能同一时间最多
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