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JAK/STAT Signaling: Janus Kinase Activity: JAK1, JAK2, JAK3, TYK2.
STAT Family: STAT1, STAT2, STAT3, STAT4, STAT5A, STAT5B, STAT6.
Regulators of the JAK/ STAT Pathway: PIAS1, PIAS2, PRL, PTPN1, PTPRC, SOCS1, SOCS2, SOCS3, SOCS4, SOCS5.
Receptors that Bind and Activate JAK Proteins: CSF1R, EGFR, EPOR, F2R, GHR, IFNAR1, IFNGR1, IL10RA, IL2RA, IL2RG, IL4R, IL6ST, INSR, MPL, PDGFRA, SH2B1.
SH3/SH2 Adaptor Protein Activity: CRK, GRB2, SRC, STAM.
Transcription Factors or Regulators that Interact with STAT Proteins: Transcriptional Regulation: HMGA1, SMAD3, SPI1.
RNA Polymerase II Transcription Factor Activity: JUNB, SP1, USF1. Transcriptional Coactivator/Corepressor: JUNB, PIAS1, SMAD1, SMAD5, SP1, YY1.
Other Transcription Factors and Regulators: CEBPB, CRK, GATA3, IRF1, IRF9 (ISGF3G), JUN, MYC, NFKB1, NR3C1 (GRL), SMAD2, SMAD4.
Genes Induced by STAT Proteins: STAT1: CXCL9 (MIG), IRF1, JUNB, NOS2 (iNOS).
STAT3: A2M, BCL2L1 (BCL-X), CCND1, CDKN1A (p21CIP1/WAF1), CEBPD, CRP, FAS (TNFRSF6), IRF1, LRG1, MCL1, MYC, SOCS1, SOCS3.
STAT4: FCGR1A, IFNG, IRF1, MYC. STAT5: BCL2L1 (BCL-X), CCND1, CDKN1A (p21CIP1/WAF1), IL2RA, IRF1, OSM.
STAT6: FCER2, GATA3, IL4, IL4R (CD124).
STAT1/STAT2/p48: ISG15 (G1P2), OAS1.
Apoptosis: AKT1, BCL2L1 (BCL-X), CDKN1A, F2, F2R, FAS (TNFRSF6), IL2RA, MCL1, NFKB1, PRLR, STAT1.
Cell Growth and/or Maintenance: Cell Cycle: CCND1, CDKN1A (p21CIP1/WAF1), EGFR, F2, F2R, IL2RA, IRF1, JAK2, MYC, STAT1.
Cell Growth: A2M, EGFR, GHR, IFNG, IL4, INSR, OSM, SOCS1, SOCS2, SOCS3, SOCS4, SOCS5.
Cell Prolifeion: CSF1R, IL2RG, IL4, MPL, OSM, PDGFRA, SMAD3.
Cell Differentiation: IL20, IL4, NOS2 (iNOS), SOCS2, SOCS5.
Immune Response: Acute-Phase Response: CEBPB, CRP, F2, STAT3.
Humoral Immune Response: FCER2, CSF1R, IL4, NFKB1, YY1.
Inflammatory Response: CEBPB, CRP, CXCL9, IL20, NFKB1, NOS2 (iNOS), NR3C1 (GRL).
Other Genes Involved in the Immune Response: CXCL9 (MIG), FAS (TNFRSF6), FCGR1A, ISG15 (G1P2), IFNG, IL2RA (CD25), IL2RG, IL4R (CD124), IL6ST (GP130), IRF1, IRF9 (ISGF3G), OAS1, OSM, PRLR, PTPN11, STUB1.
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文献和实验Designing RNAi Screens to Identify JAK/STAT Pathway Components
The JAK/STAT signaling pathway has essential roles in multiple developmental processes, including stem cell maintenance, immune responses, and cellular proliferation. As a result, it has been extensively studied in both vertebrate systems
JCI Insight：中山大学苏文如教授团队在眼免疫性疾病的炎症控制和临床靶向防治领域取得新进展
中 IL1B 和 TNF 等炎症基因的水平。基于 JAK-STAT 通路在 VKH 的上调，研究者进一步探究了 JAK-STAT 通路相关基因在不同细胞亚群的表达模式，发现 JAK-STAT 分数在分化程度高的亚群中较高，大部分基因主要在活化和记忆性亚群表达明显。这些结果表明 CD4+ T 细胞、单核细胞和 JAK-STAT 信号在 VKH 疾病中的关键作用。 图 1 JAK-STAT signaling score（图源：Liu X, et al., JCI Insight. 2022
PCR芯片，研究者可以同时研究大量基因，既可以进行某些特别感兴趣的信号通路的研究，也可以作为验证芯片结果的方法。 为了获得理想的实验结果，PCR芯片面临以下挑战：高特异性，高灵敏度和可重复性。高灵敏度或低检出限，在样品的总RNA量少，基因表达量低的情况下，也能检测出目的基因。高特异性，扩增产物严格保证基因特异性，避免非特异性产物，如引物二聚体的产生。可重复性，通过标准化的反应体系和实验方法，使得多人多次重复实验均能获得可靠的基因定量结果。 PCR芯片实验操作步骤 采用PCR芯片进行实验只需
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