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- 2025年07月16日
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Insulin Signaling Pathway: AKT3, IGF1, IGF1R, IKBKB, INSR, IRS1, IRS2, MAP2K1 (MEK1), MAPK3 (ERK1), MAPK9 (JNK2), MTOR, PDE3B, PIK3CA (p110A), PIK3R1 (PI3K p85α), PPARGC1A (PGC-1α), PTPN1, RPS6KB1, SLC2A4 (GLUT4), SOCS3, SREBF1.
Genes Involved in NIDDM: ADIPOQ, HK2, IKBKB, INSR, IRS1, IRS2, MAPK3 (ERK1), MAPK9 (JNK2), MTOR, PDX1 (IPF1), PIK3CA (p110A), PIK3R1 (PI3K p85α), SLC2A4 (GLUT4), SOCS3, TNF.
Adipokine Signaling Pathway: Ligands: ADIPOQ, IL6, LEP, NAMPT, RETN, SERPINE1 (PAI-1), TNF.
Receptors/Transporters: ADIPOR1, ADIPOR2, CD36, LEPR, SLC2A4 (GLUT4), TNFRSF1A, TNFRSF1B.
Downstream Signaling: AKT3, CHUK (IKKα), IKBKB, IRS1, IRS2, JAK2, MAPK9 (JNK2), MTOR, NFKBIA (IκBα/MAD3), PPARA, PPARGC1A (PGC-1α), RELA, SOCS3, STAT3.
Innate Immunity: CASP1 (ICE), CHUK (IKKα), IKBKB, IRS1, IRS2, NLRP3, NFKBIA (IκBα/MAD3), PYCARD (TMS1/ASC), RELA, TLR4.
Inflammation: ALOX5, CASP1 (ICE), CCL2 (MCP-1), CCR4, CCR5, CHUK (IKKα), CXCR4, IFNG, IKBKB, IL1B, IL23R, IL6, IL8, LTA4H, NLRP3, OLR1, PYCARD (TMS1/ASC), RELA, TNF, TNFRSF1A, TNFRSF1B.
Apoptosis: PPARG, SERPINE1 (PAI-1), TNF, CASP1 (ICE), IKBKB, IRS2, MAPK9 (JNK2), NFKBIA (IκBα/MAD3), NLRP3, PYCARD (TMS1/ASC), RELA, TNFRSF1A, JAK2, PIK3CA (p110A), SOCS3, RPS6KB1, TNFRSF1B.
Metabolic Pathways: Carbohyde Metabolism: CS, HK2, PCK1, PDK2.
Lipid Metabolism: ACACA, ACACB, ACSL1, ACSL4, APOE, CEBPA, CNBP, FABP4, FASN, LEPR, LIPE, LPL, PPARA, PPARG, PPARGC1A (PGC-1α), SCD, SREBF1, SREBF2.
Metabolite Transport: APOE, CD36, FABP4, RBP4, SLC2A4 (GLUT4), SLC27A1, UCP1, VLDLR.
Infilting Leukocyte Markers: Macrophages: CCR5, CXCR4, EMR1.
Th1 Cells: CCR5, CD3E, CXCR3, IL18R1.
Th2 Cells: CCR4, CD3E, CRLF2 (TSLPR), IL1R1. Th17 Cells: CCR6, CD3E, IL23R
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文献和实验简介：什么是PCR芯片？ 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏，最可靠的方法。通过在试验过程中，实时监测荧光染料的信号变化，反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广（能达到5个数量级），因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是，由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内参基因，因此，每次实验只能检测少数几个基因的表达水平，若要检测大量基因，则工作量巨大，耗时长久。 通过简单的，经过优化的实时定量PCR体系，如SuperArray的RT2ProfilerTM
，或者用RNase-Free的DNase处理RNA样品。在这里我们介绍一些常用的RNA纯化试剂盒，特别是由Affymetrix公司推荐的QIAGEN RNA纯化系列。* RNeasy Protect Kit：一旦生物样品被收集分离，它的RNA会立刻变得非常不稳定，极易被降解。由于特异及非特异的RNA降解，或者由于应激反应产生新的RNA都会引起RNA状态的改变。对于生物芯片、基因表达矩阵分析（Array Analysis）、定量RT-PCR等实验来说，采样后立即稳定样品里的RNA以保存当时RNA的表达状态，是精确
结构的形成及自身复性。由于PNA-DNA结合更加稳定和特异，因此更有利于单碱基错配基因的检测。我们在这里简单介绍一些常用杂交试剂和消耗品。对于商品化的芯片和Array类产品，通常都有配套的杂交试剂以方便使用。例如：1. Clontech公司的Altas Glass Microarrays，产品已经包含GlassHyb™ Hybridization Solution和GlassHyb™ Wash Solution，能有效缩短杂交时间，提高信噪比。同时还提供了方便使用的Altas Glass
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