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- 上海
- 高通量测序
- 2026年03月31日
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- 服务名称：
甲基化测序
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上海丰恒
一、服务介绍
DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息，获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据，对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。我们以新一代高通量测序平台为基础，结合全基因组Bisulfite处理和生物信息数据分析技术，进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析，必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义，并为细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。
二、分析项目
标准分析项目
1) 数据过滤（去除adaptor，低质量的reads等）
2) 序列比对、覆盖度统计、测序深度统计
3) SNP/InDel/CNV/SV变异信息检测
4) SNP/InDel/CNV/SV多种数据库注释
高级分析项目
1）肿瘤：
体细胞突变位点筛选；
基于质谱的 case/control 样品成对初步鉴定
成对样品的Somatic SNV/InDel/CNV检测、注释及统计
成对样品SNV/InDel的COSMIC 数据库注释分析
成对样品SNV的保守型预测
成对样品SV检测分析(CREST)及注释
影响氨基酸改变的突变基因的 CancerGeneCensus 数据库注释分析
2）复杂疾病研究
样本设计以及power计算
群体SNP 检测和Genotype 分型检测
SNP注释与统计
群体SNP 质控
基于遗传数据的样本质控
基于单个SNP的关联分析
重要结论的获得。
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文献和实验海边海鸥 偶的题目大致是研究某一细菌产生ESBLs,其基因组中含有耐药基因，但是表型（药敏试验仍对该类抗生素敏感）阴性。可能存在某些机制使该耐药基因未表达。打算进行该两株的全基因组测序，想请教一下主要从哪几方面考虑未表达的可能性。谢谢大家:) 海边海鸥 怎么没有建议呢？ zhujoker 我来胡说2句吧，不知道细菌基因组有没有甲基化修饰，自己不做细菌，所以不能确定（但是偶刚才查一下的确好像
发展，使得测序成本大幅度下降，也使得甲基化组(methylome)的研究成为可能。近两年，多个研究小组利用高通量测序相结合，绘制出了多张甲基化图谱。 提到基于二代测序平台的全基因组研究，首先想到的必然是“金标准”BS-seq，即全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing)。该方法的实验原理是前期用Bisulfite处理，将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，进行PCR扩增后变成T，与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来，再结合高通量测序技术，特别
欣童 最近想做外周血提取基因组DNA，然后做全基因组甲基化，芯片太贵了，希望大家提供经济实用的检测方法，最好有试剂盒，多谢 kylincom110 做Solexa 测序吧 silentdeath 测序比芯片贵得不是一点两点啊。。 limitless http://www.zymoresearch.com.cn/ 有需要站短我
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