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- 上海
- 大小鼠模型已被证明是研究生物分子相互作用和人类疾病的一种宝贵工具，大小鼠基因组与人类基因组有类似之处，通过一个改变的或者失活的转录本代替基因或使得基因失去活性，可方便地操纵大小鼠基因以模仿人类疾病的状态，尽管人类和大小鼠的基因水平表达印记可能高度类似，但在将大小鼠模型里的临床前研究转译成人类研究时，许多研究人员都遇到了困难。
- 2025年07月16日
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- 文献和实验
- 技术资料
- 服务名称：
大小鼠编码基因及非编码基因芯片检测及
- 提供商：
上海其明信息技术有限公司
- 规格：
每个样本
- GeneChip® Mouse/Rat Transcriptome Assay 1.0
大小鼠模型已被证明是研究生物分子相互作用和人类疾病的一种宝贵工具，大小鼠基因组与人类基因组有类似之处，通过一个改变的或者失活的转录本代替基因或使得基因失去活性，可方便地操纵大小鼠基因以模仿人类疾病的状态，尽管人类和大小鼠的基因水平表达印记可能高度类似，但在将大小鼠模型里的临床前研究转译成人类研究时，许多研究人员都遇到了困难。
M/RTA1.0芯片特点：
- 可确信地分析全基因水平的表达模式
- 揭示long non-coding RNA在表达调控中的作用
- 精准地分析准路本异构体和选择性剪切事件
- 准确检测罕见转录本而不影响整体性能
| MTA1.0芯片设计和注释数据来源 |
| RefSeq |
| Ensembl |
| UCSC Known Genes |
| MGC Mammalian Gene Collection |
| NONCODE |
| lncRNA db |
| Intergenic non-coding RNA from Luo H., et al.1 |
| Vertebrate Genome Annotation (Vega) database |
| MGI: Mouse Genome Informatics from Jackson Lab |
| MTA Array content |
|
Long non-coding RNA content (lncRNA,lincRNA,pseudogenes, rRNA, etc.) | |
| Genes (transcript clusters) | 23000 | 55000 | |
| Transcripts | 114000 | 101000 | |
| Exons | 332000 | 222000 | |
| Exon clusters | 215000 | 162000 |
| RTA1.0芯片设计和注释数据来源 |
| RefSeq |
| Ensembl |
| Rat Genome Database (RGD) |
| MGC Mammalian Gene Collection |
| NONCODE |
| lncRNA db |
| AceView |
| High-resolution profiling of novel transcribed regions during rat spermatogenesis from Chalmel F., et al.2 |
| RTA Array content | Protein-coding RNA content | Long non-coding RNA content (lncRNA,lincRNA,pseudogenes, rRNA, etc.) |
| Genes (transcript clusters) | 25000 | 61000 |
| Transcripts | 91000 | 103000 |
| Exons | 316000 | 289000 |
| Exon clusters | 229000 | 230000 |
- GCBI支持GeneChip® Mouse/RTA Transcriptome Assay 1.0芯片分析
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- 参考文献
[2] Vidal, C.; Li, W.; Duque, G.; et al. The Kynurenine Pathway of Tryptophan Degradation is Activated During Osteoblastogenesis[J]. Stem Cells, 2015（MTA1.0）
[2] Dadras, S.S.; Fishert, D.E.; et al. A Novel Role for Microphthalmia-Associated Transcription Factor-Regulated Pigment Epithelium-Derived Factor during Melanoma Progression[J]. American Journal of Pathology, 2015 （MTA1.0）
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