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实时荧光定量PCR代测
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上海信帆生物科技有限公司
上海信帆生物提供PCR实验代测,荧光定量PCR代测服务。客户只需要提供样本,其他所有试剂都由本公司提供。一般7天出结果,提供原始数据,分析数据,实验报告,实验室所用仪器型号,图片,动力扩增曲线。欢迎来电咨询。
Real -Time PCR,即实时监测PCR扩增产物并进行解析的方法,它是在PCR反应体系中加入荧光物质,并通过Real -Time PCR检测系统对PCR反应进程中的荧光信号强度进行实时监测,终对实验数据进行分析处理的方法。Real -Time PCR自1996年由美国Applied Biosystems公司推出以来,广泛应用于生物研究的各个领域。目前主要有SYBR Green 染料、Taqman探针法两种。
PCR实验代测,荧光定量PCR代测服主要仪器及耗材
旋涡振荡器 :上海青浦泸西仪器厂产品
手握式电动匀浆机:德国FLUKO 公司产品
低温冷冻离心机:Sigma(3K15)公司产品
Real-time检测仪:ABI (ABI-7300)公司产品
超纯水分离系统:美国LABCONCO公司
离心管及10μL、200μL、1000μL枪头等常规耗材均为国产;RNA提取过程中所需的离心管、枪头等耗材经过0.1%的DEPC水浸泡过夜,121℃灭菌30min,烘干后备用。
PCR实验代测,荧光定量PCR代测服实验室试剂的操作
1)所用的所有溶液都应该没有核酸和(或)核酸酶(DNase和RNase)污染。
2)所有PCR试剂中使用的水都应该是高质量的-新鲜蒸馏的去离子水,用0.22μm过滤的,并且是高压灭菌。
3)在20℃到25℃贮存的试剂建议加点像NaN3一类的抗微生物剂,在扩增试剂或样品制备试剂中加入0.025%的NaN3不抑制扩增反应。
4)所用试剂都应该以大体积配制,实验一下看试剂是否满意,然后分装成仅够一次使用的量进行贮存。
5)所有试剂和样品准备过程中都要使用一次性灭菌的瓶子和管子。
6)新配制的试剂在用于准备新的标本之前应该加以检验。
7)样品准备和前PCR区所使用的移液管在不使用时都应该小心保存。
PCR简介:
多聚酶链式反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)是美国 Perkin-Elmer/Cetus公司人类遗传研究室Mullis K. B.等人于1985年发明的一种快速体外DNA片段扩增技术,是八十年代分子生物学资源领域的一项革命性突破,被誉为分子生物学资源发展史上的又一里程碑。该技术一问世,就在分子生物学、医学、生物工程、法医学、考古学等领域得到快速而广泛的应用,并且对已建立的基因克隆、DNA序列分析等现代分子生物学技术的发展也起了巨大的推动作用。
PCR技术是一种模拟自然DNA复制过程的体外酶促合成特异性核酸片段技术(亦称无细胞分子克隆技术)。它以待扩增的两条DNA链为模板,由一对人工合成的寡核苷酸作为介导,通过DNA聚合酶促反应,在体外进行特异DNA序列扩增。其过程包括模板变性(denature)、引物退火(annealing)和用DNA聚合酶延伸(clongation)退火引物在内的重复循环系列,使末端被引物5’端限定的特异性片段成指数形式累积。由于在每一循环中合成的引物延伸产物可作为下一循环中的模板,因而每次循环中靶DNA的拷贝数几乎呈几何级数增长。因此20次PCR循环将产生约一百万倍(220)的扩增产物,具有操作简单、快速、灵敏度高、特异性强的特点,并且具有从DNA粗制品和降解的 DNA模板中扩增靶序列的能力,这一点在生药鉴定应用中尤为重要。
PCR的原理类似于DNA的天然复制过程,关键是运用两个起始引物,分别为待扩增序列的相对的两条单链DNA结合,结合位点分别位于待扩增序列的两端,并且3’端相对,然后利用DNA聚合酶依赖于DNA模板的特性,模仿体内的复制,在两个引物之间诱发聚合酶反应。PCR反应可以简述如下:
在微量离心管中加入适量缓冲液,加微量模板DNA,四种脱氧单核苷酸(dNTP),耐热Taq聚合酶及两个合成DNA引物,并有Mg2+存在。
1、加热使模板DNA在高温下(95℃左右)变性,双链DNA解开而变成单链DNA游离于溶液中。这是所谓变性阶段。
2、PCR的引物是两段人工合成的寡核苷酸链,长度为16-24个核苷酸残基,其顺序由被扩增的DNA片段两端的序列决定。这两段寡核苷酸 链分别与模板DNA的正链和负链互补,所互补的位点一个在被扩增序列的“上游”,一个在被扩增序列的“下游”。高温使模板DNA变性成单 链以后,温度降低,由于PCR反应体系中引物的拷贝数远远多于模板DNA的拷贝数,因而引物与模板 DNA形成复合物的机率要大大高于 模板DNA两条单链的重新结合。只要严格地控制复性的条件,复性过程是倾向于形成引物与模板的复合物的。这是退火阶段。
3、溶液反应温度升至中温(72℃),在Taq酶作用下,以dNTP为原料,引物为复制起点,模板DNA的一条双链在解链和退火之后延伸为两 条双链。这是延伸阶段。
如此重复,改变反应温度,即高温变性,低温退火,中温延伸三个阶段。这三次改变温度为一个循环。每循环一次,使特异区段基因拷贝数扩大一倍,一般30次循环,基因放大数可达2n倍。可用公式
Y=(1+X)n
表示,式中Y=DNA扩增倍数,X=扩增效率,循环数为n。
如X=100%,n=20时,Y=1048576倍。但实际扩增效率(X)不会达到 100%。
2 试验条件
本程序适用于自动PCR操作,可适用于大多数情况,所用酶是不含核酸外切酶活性的热稳定聚合酶,如Taq聚合酶等。
引物(各50pmol)
0.2mmol/L dNTPs(必须使用高质量的dNTPs,这一点非常重要。dNTPs经反复化冻后会发生降解,因此应分成小份保存。应注意混合物中四种dNTP的量要相等)
模板DNA:约0.05~1mg基因组DNA或0.002~0.02mg质粒DNA
Taq DNA聚合酶(Perkin Elmer, Norwalk, Connecticut)
10×PCR缓冲液(500mmol/L KCl,15mmol /L MgCl2,100mmol/L Tris·HCl,pH 8.3)
矿物油
电泳所需试剂
| 反应组分 | 提高产量 | 提高特异性 |
| 模板浓度 | 增加 | 减少 |
| 引物浓度 | 高至75 pmol | 低至15 pmol |
| 引物长度 | - | 增加 |
| dNTPs | 各1 mmol/L | 各20 mmol/L |
| Tris-HCl (10 mmol/L pH8) | pH高至10* | pH高至10* |
| MgCl2 | 高至4 mmol/L | 1.5 mmol/L |
| DMSO | - | 10%** |
| 甘油 | - | 2% |
| 甲酰胺 | - | 5% |
| Taq DNA聚合酶*** | 高至5U | 0.5U |
| 反应条件 | 提高产量 | 提高特异性 |
| 循环数 | 多35个 | 减至25个 |
| 变性* | 增至1 min | - |
| 引物退火** | 降至45℃ | 升至72℃ |
| 引物延伸*** | 在后期循环中延长 | 维持30s |
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