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- 2025年12月24日
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基因GO和Pathway富集分析
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基因GO和Pathway富集分析
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文献和实验基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis, GSEA），根据名称我们就可以知道这是一种对基因进行富集的工具和方法。其基本思想是使用预设定的基因集（通常是基因组注释信息或者来自前人、牛人的实验结果），即将基因富集，把功能相似或者相同的基因进行组合，并最终以基因集的形式进行封装；然后将 case 和 control 组中差异表达的基因进行排序，之后检验两组中差异表达的基因是否在预先设定的基因集合的顶端或者尾端富集。如果在最终的分析结果中，case 和 control
基因集富集分析（Gene Set EnrichmentAnalysis, GSEA），根据名称我们就可以知道这是一种对基因进行富集的工具和方法。其基本思想是使用预设定的基因集（通常是基因组注释信息或者来自前人、牛人的实验结果），即将基因富集，把功能相似或者相同的基因进行组合，并最终以基因集的形式进行封装；然后将 case 和 control 组中差异表达的基因进行排序，之后检验两组中差异表达的基因是否在预先设定的基因集合的顶端或者尾端富集。如果在最终的分析结果中，case 和 control
DAVID(the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery),它是一个生物信息数据库，整合了生物学数据和分析工具，为大规模的基因或蛋白列表（成千上百个基因 ID 或者蛋白 ID 列表）提供系统综合的生物功能注释信息，帮助用户从中提取生物学信息（想了解更多，转战度娘~）。Tips: 通过 DAVID 对肿瘤相关基因做功能注释和富集分析。打开 DAVID 平台http://david.abcc.ncifcrf
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