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T4 RNA连接酶2 ,截短型

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    概述
    T4 RNA连接酶2,截短型(T4 RNL2 截短型)可特异性地将DNA或RNA的预腺苷酰化5´ 末端连接到RNA 3´ 末端。该酶连接时不需要ATP,但需要预腺苷酰化底物。T4 RNL2截短型的表达来自E. coli 质粒,该质粒编码T4 RNA连接酶2基因的前249个氨基酸。与全长的T4 RNA连接酶2不同,T4 RNL2截短型不能将底物的5´ 末端腺苷酰化,因此无法将RNA或DNA的5´ 磷酸末端连接到RNA3´端(1-3)。该酶,即RNL2,可用于microRNAs克隆中接头连接的优化,因为此酶只能利用腺苷酰化的引物,因此,可以降低连接背景(4-6)。


    来源
    携带T4 RNA连接酶2截短型基因的重组E.coli 菌株。


    反应条件
    1X T4 RNA 连接酶 2,截短型反应缓冲液 [50 mM Tris-HCl (pH 7.5 @ 25°C), 2 mM MgCl2 , 1 mM DTT, 400 μM ATP],16°C温育。


    质保声明
    经检测每批产品均无单链和双链DNA核酸外切酶、核酸内切酶、核糖核酸酶以及磷酸酶的污染。


    单位定义
    1单位指20μl反应体系中,37°C条件下,30分钟内能将50%的17-mer RNA连接到预腺苷酰化23-mer DNA末端所需的酶量。退火后17和23-mer将首先形成互补的40-mer DNA。
                                                5´App
    FAM 5´-CUUUUUCCCCUCTG CGG CATAGAAACCCACGCAAAGCCC -3´
           3´-GAAAAAGGGGGAGCGCCGTATCTTTGGGTGCGTTTCGGG-5´
    红色 = DNA
    蓝色 = RNA
    ppA = 预腺苷酰化末端(连接区域)


    活性检测条件
    1X T4 RNA 连接酶 2(截短型)反应缓冲液,0 4 μg 的 23-mer、17-mer 和 40-mer RNA 等摩尔混合物。37°C 温育 30 分钟,连接产物在 20%的变性聚丙稀酰胺凝胶电泳上检测。


    浓度
    5,000 units/ml。




    注意事项
    加入 25% PEG 8000 和 16°C 条件下延长温育时间都可以提高连接效率。


    参考文献
    (1) Ho, C.K. et al. (2004) Structure , 12, 327–339.
    (2) Ho, C.K. and Shuman, S. (2002) Proc. Natl.Acad.Sci. USA , 99, 12709–12714.
    (3) Nandakumar, J. et al. (2004) J. Biol. Chem. , 279, 31337–31347
    (4) Pfeffer, S. et al. (2005) Nat. Meth. , 2, 269–276.
    (5) Chen, P.Y. et al. (2005) Genes and Dev. , 19, 1288–1293.
    (6) Aravin, A. and Tuschi, T. (2005) FEBS Letters , 579, 5830–5840.


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